Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_019738_15                                                                                                                 top


Strain : Microcoleus sp. PCC 7113 RefSeq :NC_019738 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019738_15
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACNumber of repetitions :16
Begin Position : 3859458 End Position : 3860565

3859458GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACAAAGGAAAGCATCATGATTACCAAGCAGAAAAGA 3859528
3859529GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACGGGAAGGCGTTCGTTCATCTTGAATTTCAAACG 3859598
3859599GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACTTCATGTGAGAGCGGATAAACGCCTCGATTT 3859666
3859667GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACGACTTGCAGTCTACAAGCCATCTACCTCGATTGA 3859737
3859738GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACACCAGTTGATGAGCCGTCTTGTAGTGGAAGTCCTTGC 3859811
3859812GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTCGAATTTAAACGAGGAGCGGGAGAAAGGGGCACGAATCATTTTCACG 3859884
3859885GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACGTTCCTCGTTCGGAAAGGCTCTTTGGCCCAAGCCA 3859956
3859957GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACACACCACTAAAGCCGTTTGCCTAATTGGCGCTCAA 3860028
3860029GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACCCCAAGACTCGTATTCAGAGGCTTGATCGATCGCCGC 3860102
3860103GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACAGCAAATGGCAAGATGAAATCTTAATCGCTGTC 3860172
3860173GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACCGATCGCCCTTGGACTTGATAGAGGTGAAGTTCTT 3860244
3860245GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACTAACGTTTCCCGTGACATTAAGAACCAAGTGTCT 3860315
3860316GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACTTTTAAGGCTATTCGTGGCGAAAAATGACCGGGCT 3860387
3860388GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACCCCATTCTCTCACCGGTGAAACGCAGGATATCA 3860457
3860458GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAACACAATCCTGGAGGAATTTCTCTAGTTTGGCTCTG 3860528
3860529GTTTCAATCCCTGATAGGGATTAAGTGGAATTTAAAC3860565
Left flanking sequence : Till position 3859458 (length bp)
AATACTCATTCAGTCGTCTTTAGACGACTTTTGCTATTAGACAGTGGTTTTAACCACTGGCGGTTGTTGC
AATTAGTACAACATTTTGTCAGTTTAAAAT
Right flanking sequence : From position 3860565 (length bp)
CGCAGGCATCCAGAACCCTTACTATATTTAGTTTTCAAGGTACGTTGGTGACGGACACCTCTTATAGTAG
CATACCAGAGCCAAAGGATGATAAGAGGAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp