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CRISPRs details
NC_019751_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_019751_1                                                                                                                 
top
Strain :
Calothrix sp. PCC 6303
RefSeq :
NC_019751 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019751_1
DR consensus (35 bp) :
CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
Number of repetitions :
12
Begin Position :
316560
End Position :
317384
316560
CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
GAAACTGCTTCTGCTGATTGAGTTAAAAAGGATTTT
316630
316631
CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
CTCTGTACCTCTCCCCTGTATCGTTGCGCATAGATTGCGA
316705
316706
CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
TAGATATTTTCTCTATTTCACGACCATCTTTTTTAAT
316777
316778
CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
TTGAAGTTTCCGTCTGTTACAAAATCATCTAAATTG
316848
316849
CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
GAGGATAAATTTAAAAAGAATGAAGTCGATACGATCA
316920
316921
CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
GAAATGGATAATTTTTGACCGAATACCACTTTTCT
316990
316991
CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
TATATGATTCGCTGCTAAAGTATTTTTCAACCTTCTT
317062
317063
CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
TTTTTACTCTTTCAAAATAAGAGTCAAAATTTTTT
317132
317133
CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
AGTAGCACAATCCCATTCAGTAATTGCACATACTTTTC
317205
317206
CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
ATTGTTTGCCACATATTCTGAAAATAAAACACGAGTT
317277
317278
CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
ACATTTAACAAATTATTTTGTCAAATCTGAAAAATCA
317349
317350
CTTTAAACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC
317384
Left flanking sequence : Till position 316560 (length
bp)
TGGATTAATTACTAAGAATTATCAATTATTTAGGAAAAATTTTACACCCCACAAAAAATGGCGGTAGAGT
AGTTGCTAGGCAAGGCTTTCAAAGGCTAGC
Right flanking sequence : From position 317384 (length
bp)
ATAGATTAAGATCCTCGATGTTAAAAAGTCGAGGATATTTTCGTTTGCCAGATATTTGGGTTTGAAAAAT
ATCGTAAATATGAGAATCCTACTAATGATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp