Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_019751_2                                                                                                                 top


Strain : Calothrix sp. PCC 6303 RefSeq :NC_019751 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019751_2
DR consensus (35 bp) : CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACNumber of repetitions :16
Begin Position : 324319 End Position : 325428

324319CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTAGGAAGTTTTCGCTTGGGTATTGCTTAATTTAGCAGAG 324392
324393CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTATTTAAGGCTATATCGCTTCTAAATTGAGAGACA 324462
324463CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACAAGACAGAGATATGTCCTCAAAGAGAAATGAGTTTGTCTCAATT 324541
324542CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTTTTATCTGCTTTTGTAAACTCTCCCCAATGCAAAG 324612
324613CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACACTGGTTTGCCGCTTGAGTGGGCATAGTCAAAAAAT 324683
324684CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACAGTTTGAGTCTCGGTCTCGGTCTCGGTCTCGGTCTC 324754
324755CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTTTACACGATTCTGGAACGTTACTAACATCCCATCAGGA 324828
324829CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACTCGTTGAGTTGGTACACCAGCTGACTCTCAATTTG 324898
324899CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACATTAGGGTCTCTGTAGATCTTAAATTCCTCAGAGTA 324969
324970CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACGAATGAAAAGATTTTTACATCTTTTGCTGATAAAA 325039
325040CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACGTGTAAGTCACGGAATTTTCGGTTGAACTAACTAAT 325110
325111CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACCTTTGATGTAAGAAAACTCATCACTAGCAAAAAAA 325180
325181CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACGGGGCTCTTAGCTCTGCCCGTAATTCGTCGCGGGACTT 325253
325254CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACGTGTCGCTGCTTTCAACTTCTGCTGCACAAACTACG 325324
325325CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAACCTGAATTTTGTTATTCTAACCTCCACTCCACATG 325393
325394CTTTAGACTTCTTCGGAAGTTGAATTAATGGAAAC325428
Left flanking sequence : Till position 324319 (length bp)
TAGGTTAACTGCTAAGTATTATCAATTATTTAGGAAAAATTTTGCATCCCACAAAAAATGCCTGTAGAAT
AGCAACTAGACAAGGCTTTCAAAGACTAGC
Right flanking sequence : From position 325428 (length bp)
AAGGAATTCCGTAGTCAGTGAACTGGGCTTTTTGACTTTAGACTACAAAAGTATAAATAATTTTGCGTAA
GGACTTCCAGGAAATAGGTATAAATTGTCA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp