Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_019757_35                                                                                                                 top


Strain : Cylindrospermum stagnale PCC 7417 RefSeq :NC_019757 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_019757_35
DR consensus (37 bp) : GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACNumber of repetitions :29
Begin Position : 5966534 End Position : 5968600

5966534GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACGGTAACCGAGAAACCAGCTTTCTTTAATTTAGCTT 5966605
5966606GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACGAAAAATCCAGCAAAGCCAAGCATGGAGACTGGA 5966676
5966677GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACTGATGTAATTAGCCATTTAGTTAACAATATGCCTG 5966748
5966749GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACTGTATCTCAATAAAGCTTCCCGCCAACCAAACCA 5966819
5966820GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACCAATCAGCATCAATTATGAGACTGATGAAGACGA 5966890
5966891GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACAATGGTAACAGTGCTATTGATAACCGCTTAAACCG 5966962
5966963GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACTCTAGGCGTAAGTGACAAACAACGGGATTTTATC 5967033
5967034GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACTTAGGATTCCCAGGATCTGCTTCGATTATAAGATT 5967105
5967106GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACGCAACGCGCCTAGCGATGCGGCAGACTGCATTGTTCTTT 5967181
5967182GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACGTGGCAATTGGAGAGATACAACGGATTTGGGCATCGC 5967255
5967256GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACTTTGCAGTATTCTTCAATGACAACCCTAACTT 5967324
5967325GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACCACAGACTTGTTCTATGCCAACAAGAAAGCAGATAT 5967397
5967398GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACGTGGCTAAGAACAACCCTAGCAAGTTAGGTGAGCC 5967469
5967470GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACTTAAACTCTACTCTTCCAGCCTATGAAAATGATTTA 5967542
5967543GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACCTGAATAAATAACAACTAAGGAGACATCCCAATGG 5967614
5967615GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACTCTTCATTTAAAGTAGCAAGATTATTTTTGATGCAATC 5967689
5967690GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACTCAGAATTATTTTCAGCCCAGCTAGTAAAAACTG 5967760
5967761GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACCTTGCAGTTAAACGCGACTACAGCGCCTGGGGGAA 5967832
5967833GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACCTCTTACTCTAGCAGACCTAGACATTACAGAAGGAGAAGG 5967909
5967910GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACGCGTATGAAATTGCTAGATCACTGGACGAAGCAGAAAGT 5967985
5967986GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACTTGCCAGTGGAGCCAAGGCAGCAGACACAG 5968052
5968053GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACTATGACGTACCCGTGGAGGTTGATTTACAAATGTGCGA 5968127
5968128GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACCTTTCCATAGAAGCGCGATCGCCATCTGCAAACCC 5968199
5968200GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACGCAACTGATTTTTTGATAGTGCTAAAAGTTCTTTTCAAG 5968275
5968276GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACTAGACGAAACCCAGGATATAAAAAGGATTGTGTG 5968346
5968347GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACATCGGAAGCGGGTAACTCGTAACATTTCGCAAGAAG 5968419
5968420GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACGACTTAATCCCCGAAAGCACCTTTGACCAATTT 5968489
5968490GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAACTCAGCGGGAAGTATCGCTACTGGCTGACCTTGCATCA 5968563
5968564GTTGCAATTCATCTAAATCCCTATTAGGGATTGAAAC5968600
Left flanking sequence : Till position 5966534 (length bp)
CTCCCTCTTTTCAAATCGATGGCTGGAATGGTATATTGATGATCGATCCGCGCAACTGCACCTTGAAAAC
TAAATATGGTAAGGCTTCCAGACCCCAGCG
Right flanking sequence : From position 5968600 (length bp)
TCAAAATTCAGTAAGTATAGCAATCCTATTTGATTTGCTTTCCAGAGAGAGGCTCAGATCCCCGACTTCT
TGAAGAAGTCGGGGATCTTTTTGTTCGTAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp