Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_019765_1                                                                                                                 top


Strain : Stanieria cyanosphaera PCC 7437 RefSeq :NC_019765 (plasmid pSTA7437.01 )
CRISPR id : NC_019765_1
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACNumber of repetitions :8
Begin Position : 32009 End Position : 32557

32009GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACTTTTATCTTTTCTCAATCAATTGATAAAGGTCGTA 32080
32081GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACAATGAGTTTAAAGATTTGCTTATGGCGCAAGTTTG 32152
32153GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACATAGATGGAAATTCCTCTTTCTTCGGAAAAAATTATCGA 32228
32229GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACATTGTTTCTCAGCAAACGTAATTGGTTGCCAGTCAT 32301
32302GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACGTGCTACGTTCGTAAACTTGCGTTTCAAAAGTCCCT 32374
32375GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACGTGAGGGAATTGATATGTTTGCTCGTAAAGGTGAT 32446
32447GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAACCAATCCCCCCTTCGTCGAGGAGCAATACAGAGTTAG 32519
32520GTTTCAATTCCTCATAGGAATTATTAATAGTTTAAAC32556
Left flanking sequence : Till position 32009 (length bp)
ATAGCGATAATTGATTAGTAAATTTTGAAACTTATTCGCTAACCATAAAATTAGATTTAGTTTAAACTTG
AAACTTTCGTAGAAGCTGAGAATCGTAATA
Right flanking sequence : From position 32557 (length bp)
TTTGATAAGGTATTATGTTATTGAGGATAAATAAGTTTCAATTCAAACGGGTGTCGCAGGAACATGGCAA
CTATTCTGGGTATTATGTTATTGAGGATAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp