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CRISPRs details
NC_019772_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_019772_2                                                                                                                 
top
Strain :
Anabaena cylindrica PCC 7122
RefSeq :
NC_019772 (plasmid pANACY.01 ci)
CRISPR id :
NC_019772_2
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
Number of repetitions :
40
Begin Position :
31583
End Position :
34510
31583
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
ATACGCGCTGCGAGTGCGGTATGTGTGGTAAGTGA
31654
31655
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
ATAGACAAGAACTAGAACGTAAAGAGATTATCTGGAAAA
31730
31731
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
CTTACTCCTACTATTCCTTACTTTGTTTTTCCAT
31801
31802
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
ATAATTTAGATCCATTTATTTATCGTTGGAAATG
31872
31873
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TCGATAGTGAATCGTGGGATATTTTTGTTCACAAGAAAC
31948
31949
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
ACTGATATCCAGCAAGTCTCGTGGGCTTCATCACAAATAAT
32026
32027
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TTGGCAAGACATCCTACAATATAGATACCTTTTGTTTTGTTG
32105
32106
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TTGGGCGTAGCTTCTGAGAAGCTAGAAATTCCTTCAGATGT
32183
32184
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
AAATTATTGCGATCGCGAAGGCAAGAAATATGAA
32254
32255
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
CAATAACTGATATTCCTAAACTCCACAAATAAA
32324
32325
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TATTTGACCTTAGTGCCTGGTAAGTGGGGTGCAA
32395
32396
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TTCTGAGCTTTTACAACTCCGGCCGCGATTAAAGG
32467
32468
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TAAAAAAAATCATGGCTACCACACAAACTGCTCTTAA
32541
32542
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
GATATAACTTTAATGCTTTAATGTAGACGATACTCCTTT
32617
32618
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
AACTAAACTACCAGAATCTGTACTTATATCTAGGAGA
32691
32692
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TCAATTTGATAGCTGCCAGGAATCGGACAAGGGGCAG
32765
32766
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TTCATTAAATTGTCGAGGTTCAGTTTTGATTGATAAAT
32840
32841
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
CATCAACCTCAATTAAATTAAGGGTATCTTCAACTTTAAAAC
32919
32920
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
CTGATGAAAATCATAATTGCTGATAACCTGTGTAGGGAT
32995
32996
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
GGGGGCTAACTTATCTAGGGTTAGGTTTTTGGATCAATGCTAA
33075
33076
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
CTATCTCCAATCGAGTCTTATCAAATCTTGACTG
33146
33147
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TATCTAGTCTGTAAAAAAGTCTGGTACATCGACTGGT
33220
33221
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
CCAGATAAGGTTTGATAGCAAAGGGGAGTTTAATCTT
33294
33295
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
AAGGCAAAATTCATATTATTCAACTCCGATGCTAT
33366
33367
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
AACCTGTTACAGGTTATGCTAGATAGGTACTAGCAGT
33440
33441
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
ATTCCATTAAAAGAAGCTGCCAAAAAACTGAACTAT
33513
33514
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TATTGTTGCAACTGTCTGGTATTGGGATAGAGATGAA
33587
33588
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
CTGTAGACGACATAATTGAGTCTCCAGACTTTTGGAT
33661
33662
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TTTACAGGGAATCTTAAAAGAAATTCATAAAATCAT
33734
33735
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TTTTTCTTAAATTAGAAATAGAATTTATAACATCTA
33807
33808
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TTTCAACAAAGGTTTTTTGTTCCGTTTCATTGTCA
33879
33880
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TCTCGAACCGGTCAAGCGATCGCTAAAGAAAAACTTATTAAT
33958
33959
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
GTAGCTTACAAAAACATCTTAGGCAATATAAAAGCC
34031
34032
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TTTTAAGGTGCAACGAGACTGGGTATATACCGTTGA
34104
34105
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
AGTGTTCCCTTTCCCTGGAACAACCAAGCCTATCAC
34177
34178
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TTGAAGTTGTGCCAAACTTTTCCGAATCCGGCTATTT
34251
34252
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
TAGAGTCTTACATAGCCTCGAATTTTGTGTCTATAGATGA
34328
34329
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
ATTCACTGGACAGATGCAACAGATTTTAAGGTTAAT
34401
34402
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
CTAGAAAATAGTAACGTTTTAAAGCCAGAAGAGGT
34473
34474
GTTTCAGTCCCCTTGCGGGGATTAGTTATATCGAAAC
34510
Left flanking sequence : Till position 31583 (length
bp)
TAGAGAGGTGTTTTGTGATGGGGTTTTGCGTTTGCTAGATGTAGCTACTCTTGGCATTTTTTTTTGATGC
TACATGATCTTATGCTCAGTATTTTACTCT
Right flanking sequence : From position 34510 (length
bp)
CCCGCCATCTGAAACACAGTCTAGGAGCAGACTGTAGGGGGGATTTTGGCAGACCTCTCAAAAAACCTCA
TTTCCGGCTTTGGGTTAACTGCCTACTGAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp