Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_019773_2                                                                                                                 top


Strain : Anabaena cylindrica PCC 7122 RefSeq :NC_019773 (plasmid pANACY.03 ci)
CRISPR id : NC_019773_2
DR consensus (36 bp) : GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATNumber of repetitions :32
Begin Position : 23460 End Position : 25825

23460GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTCTAAAGCAGTGCAATCTGTCGCAACTTCAATTAAA 23531
23532GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATAATATAGTCACAATCTACCTTTCACACAAGTAGAGT 23603
23604GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTAGAAACCTTTACAGCTAAAGATAAAGAGCTATCT 23674
23675GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATCTGATTGACATCGGGTTATGTGAAGATAACACGGAAGAATA 23751
23752GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTAGATGAACTTGTAAACTTTGGTAGTAAATCACATGATG 23826
23827GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATCCACGTCATCCATGCTGGCTCGTAGGTGGAGAGAGATAGCAACTAG 23908
23909GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTTGGCAAGTAGTTCAAACTGGTCAAATCAGTGTTGAAGATCCAATTACTA 23994
23995GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATAAACAATCATCATCTACATCATCATATTTGAAATAACCA 24069
24070GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTCTGTTTGTTGTAGCTTACAAGCTACTCTACAAATTAGA 24144
24145GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTTATCCGAGTCTTCAATACGTCTTTTTGTCAACAAA 24216
24217GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTTAATACTAGCTTAATTCTTACTAAAGAGTCATTTTACG 24291
24292GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTAGGTGATGTACCATTACTTGAACAAACTAAATTTGGCAAA 24368
24369GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATCATCAAGCAGGACATCATGTAACTTTTGAAAATCGAAA 24442
24443GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATAATAGTGGTTTAATCCAACTGTGTACGTTCTCATCTG 24515
24516GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATGGAAGTATTCTAAAACTACAAAGTGAAGCTTATTCTAA 24589
24590GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATAAGATGACACTCTACAAGGGTTATAAGCTCCATTCATCAAA 24666
24667GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATCCTTTTAGCACAATAACTGTAATAGTTTCTGCTACTGAT 24741
24742GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATCTGACATTATCAGACAAGTTGAACAGCGTGAAATG 24812
24813GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTCTACGCAGAGTCAGGTAAAGTCTCTTATTTTCAAGGTG 24887
24888GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATCTACCACCAAAGACCAATCAAGTTAGACCTGAGCATTCTACA 24965
24966GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATCATATTAAGGCATCTTCTTGGGACGGATTAAACCA 25036
25037GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTGGAGTGTCTCACCATTCTCGGTAGCTACTGCCTCG 25108
25109GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATACTTTATCACGGTACTATCTGAGGACTTGATGTGGGAG 25182
25183GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATGATTGTTGCTTTTTAGGTATAGACGATGATGAGATA 25254
25255GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATGTTAAGGACGCGGTTATGACTAACGAAAAATCAA 25324
25325GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTGATGATGTACTGGTAGTTAGTTTACCTGCTCAATCTATGG 25401
25402GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATGTGTAAACTGCTTTATCTGGTAATTCATTTAATAGTTGTTT 25478
25479GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATGAAAGCGGTAAGTTCGATGCTCAACATTTACGAATA 25550
25551GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTTGTGATCAGTAGAATCAGCTAAGTCCTCATCTAGCTGCCGTAAATAGT 25635
25636GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTCTGCAAAAATGGCTGCTGAAGAATCAATTGATTACGAC 25710
25711GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAATTAGCCCTCTTCCCTACTCCCCCTAGTTATCCTCGATCCATCTG 25789
25790GTTTCCATTCAATTAATATCCCCAGCGAGTGGGAAT25825
Left flanking sequence : Till position 23460 (length bp)
GTATTGTATTGGGCGTTGCTAGTACAAGCTTTAAGAATGTAAAAATAAATACTGTTTAGTTGGGGAAGCG
ATCGCTATTGCTCTTAAAGCCGTTAATATC
Right flanking sequence : From position 25825 (length bp)
ACCTCTATTTTAAACCCTTACTCATTAAGGAGTCTAGACCCACTTTCCGAAGGTCAGCAAAAACCGCTGC
TAAACAGATCACAAAACCACCATTAAAAAC
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp