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CRISPRs details
NC_019777_2
Flanking alignement tool
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NC_019777_2                                                                                                                 
top
Strain :
Cyanobacterium aponinum PCC 10605
RefSeq :
NC_019777 (plasmid pCYAN10605.0)
CRISPR id :
NC_019777_2
DR consensus (36 bp) :
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
Number of repetitions :
44
Begin Position :
32652
End Position :
35929
32652
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TAAGTTTTGTTTTACTAATCCCCCAATGAATTAG
32721
32722
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
GATATATATCTATATCTCCCTGCGATTATTAAACAGT
32794
32795
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TAGTTTTTCAGCCTCAACACGGGCGGTTTCCTGAGTTAG
32869
32870
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
CGTAAAGAGGGTTTGTTCTCTTTAGTGCTAAACGGTAAACA
32946
32947
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
AAGCACATAATGTAACTTTGGTGGGAGTTTATCAAGAT
33020
33021
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TGACCTGACCGCGTAGACCCTCGATAGCAAAAAACTTCT
33095
33096
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
ATAGCCCCTGTTATAGCTTCATAAAAAGGAAAGAAACTC
33170
33171
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
CAAACACGCTAGTTAAGATATCACTAGCTAAATGCTGTACAG
33248
33249
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
CTGCATCGGAATATCATTACCTTGGCGAACAGCATTGATAGTATC
33329
33330
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TGATATGCGATCACTATACACGTTCATCTCAATCACTGC
33404
33405
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TAGAAGGCAATCGTGACATCTTCAGCTTATCCCAT
33475
33476
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TTAAAAGCCCAATTAGCAAATTCAGTATCTCGCGAAGAGTTTAATGAG
33559
33560
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
AAGAAGGCTTGGTGTTGCTGAACTAGCTCTGCTATAGCCGGG
33637
33638
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TTCATACCAACTTGTATCTTGGCAAGAAAAGTTTAT
33709
33710
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
CTAAGTTTTTATTACTACCTATGATAAAGGCATTCG
33781
33782
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
GCAATTAGATGCAAACCCTGAATTGGTTGACAAATTAAA
33856
33857
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
CATATCCGCGTCCTCATCGAAAGTCATCCCTTGGGTGAGA
33932
33933
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
CTCCAAGTTAATCAACAATATTGATTTGACGTTTAAA
34005
34006
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
AACTTGCCCATTCAGAAGGTACGGGCTTAAATTTACT
34078
34079
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TCAACATTGCGCTCTGTTGTCTTTAAGGTGGAGGCAGG
34152
34153
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
AAATATCGTAACAGAGTTCTGGAGAATAGATAGGTAGCAACTG
34231
34232
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TGAATTTAAGAATATAGTGGGATATCCGCCAGAAGCAGCC
34307
34308
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
AATCTCTTCTTCAGTTTTCTGCTCTGCCTCGGCTACTTTATC
34385
34386
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
GAGGTATATCCCCACCTTTAATAACATCAGCATTAAT
34458
34459
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
CTTCATACCCTTTTCTTCTTGAGTTAAATCAGCCCAGTT
34533
34534
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
AATCCAACAGTCTCTGGGCAATTAGCATGTAACCAAT
34606
34607
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TTAGATCTAGGTGATACAATTCATCTGGACGCATAGATTT
34682
34683
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TTTAGAAGTAATAGTAGAATTAACAATAGCAGATTTACCG
34758
34759
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
CCATAGCTCCTCTTTCGAGGAGGCTGAATTATTAACCA
34832
34833
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
GCAGTCATATAAAGCTGTACAGTCTCGTGGGAACTAGA
34906
34907
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
CTTAGACGAGTTGAGGATAGCTTGCCAAGAAAAAGAAAAA
34982
34983
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TAAAGATAATGCGGTTTCATAATCTCCAGCAACACTAC
35056
35057
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
AGGTCGTCCTCCTGAGTTGCCATCTCCTCGAGAATAAGA
35131
35132
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
ACATGGCTAACGTTGCCGTCACTGGAGAGAACGGTCTATT
35207
35208
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
GCACATGGCAGCGTCATCTGCTAAGTCGGAATATTTTTCAGG
35285
35286
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
AGGTTGAAAAAGAAGTTAAGGGATTTACTGTGTTCGTGCCATTAAC
35367
35368
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
AAATAAATCTTTTCAGTTCGAGTATATTCGTCCTCGG
35440
35441
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TTTATTTCATCGTAGCTAACAGTTACTACATAATCA
35512
35513
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
GTACCCAGAAACAAATCCAAGCATGAGCACCTGTACTACCTGCC
35592
35593
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TCAATATTGGTATCGTTGTTTTGTTTAACAATGAAAGG
35666
35667
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
TTTATTGAGAGATGATCATCAGTTTATTATTATTTAAG
35740
35741
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
CGTTCATATCTATGAACTAAATAAAGTACATAAAAAAGAA
35816
35817
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
AAGGCTTCGATGGTTTTAGACGAAGCTTTTTCGTTAACGCA
35893
35894
CTCTCCCTTAATGGGAGAAACTAATTGAATGGAAAC
35929
Left flanking sequence : Till position 32652 (length
bp)
GATTTTTCTTTGACAAAAATAGGTTAAATTGATTATAATTTTGCTATCGGTCGCAAACCGCCTCTGGAAT
TATTATCAGATAAGCGTTTTAAAACTGGCG
Right flanking sequence : From position 35929 (length
bp)
TTGGGATTATAACGATAACACGCTATGTAATTATCTCTCCCTTAATGGGGGAAACTACGATGTTTTGTCT
AGTTTTTGGTAGCGTTGGGAGAGTGCGATC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp