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CRISPRs details
NC_019779_8
Flanking alignement tool
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NC_019779_8                                                                                                                 
top
Strain :
Halothece sp. PCC 7418
RefSeq :
NC_019779 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_019779_8
DR consensus (37 bp) :
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
Number of repetitions :
50
Begin Position :
2090436
End Position :
2094051
2090436
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TTTTGATTCAGGCCCCGAGCCAAATCCCGATCCC
2090506
2090507
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TCTAACTAAAAATAATCATAACACATTCTTTTAAAA
2090579
2090580
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
AAGCAATTTTATATTGCTCAGGAGTGCTAGGCAA
2090650
2090651
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
AGGGAAATATACCAGATGGTAGCAGTAAGGTAGCA
2090722
2090723
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
CTAAGATGACCGCAGTGGCGCAATAACAACTTCT
2090793
2090794
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
CTTTTCAGTCTTGCGATCCTCGTAGTCATCAAAT
2090864
2090865
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
ATTAAAAGAGGGGTTAAAAGTTGTTGGATTCAAT
2090935
2090936
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
ACGGACTGAATATTACAAAACCATCGGGGCAAAG
2091006
2091007
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TTTTTCTGTGGTCAGAATAGCCTAAGTATTCTG
2091076
2091077
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
GAAAGAAGAGCGCAACGACAACAGCAGTGACACCGCAACG
2091153
2091154
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TATTTTGTGGTTTCAGGATGAATCCTACCTAAAATC
2091226
2091227
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TTGCTCAAGTTTTGGCATCATTGTGTAGTCAAATACT
2091300
2091301
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
AGGGAATTTTGTAATATCTTCTATGCCAAGATTTTCGTTGATA
2091380
2091381
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TAACATCTGCAATGGTTTCTTCTAGGAGTTCCCACT
2091453
2091454
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
CCATCGCTTTGACTTTCATTCTACTAATGAAAAGGGAG
2091528
2091529
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
CTGGTCGCAGTAATGAATATCCTCATTGGCTCTTAGA
2091602
2091603
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TTATTAATAGGTAAATAAGGTGGATCGAGATATA
2091673
2091674
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
AAAAATAAGCCAGAACAACCGCTCCATGACACAGTTC
2091747
2091748
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TTTTCATAAACGAAAACCAAAGTACAAGAAATGCT
2091819
2091820
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
GAGAAAAGCTGCGGATGGATTTTAGGCGGAGCTTGCCCAA
2091896
2091897
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
CCGATATAAGATTTACTGGCTTTAGTTGCTCCTGTTCT
2091971
2091972
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
ATCGACTCTCTGACTAGCGTTAATCTTCGCAGCACCTTCA
2092048
2092049
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TCCTTCCTAAAATGAGATATCTGTTAATCCTTTGT
2092120
2092121
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TGAGTATTCGGGCAACGCTCGAATATCATCCAGT
2092191
2092192
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TTTGAATAAAGTGTAAACTCTGTAAACTTAGGCG
2092262
2092263
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TTTTTGGTTGTGACAATTCTGAAGGGGGGTCAAGT
2092334
2092335
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
GTTGTTTAGCGATATCTTCGCCTGATTGCTCCCAA
2092406
2092407
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
GTCAACGCTTTACCAACTCGTTTGGCAGTTGACCAAA
2092480
2092481
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
CCGCTAGTTGTCCCCTCGGCTATGGTTGCGGT
2092549
2092550
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
GGTAAGTGTAATTGGGTCTTTATCATCATCTTC
2092619
2092620
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
CTTATCATGAAGAAGAACATCTACACTAATTTAATGT
2092693
2092694
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TGGCATTTTCAATTTTCTGCTCTAGTGAATCCAGATCTG
2092769
2092770
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
CATTTCCAGCATTGGCTCTCCCCCGATGGTAATTGC
2092842
2092843
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
GCTGGGCTGACATTCCCCCGGAAAACAACCCAGA
2092913
2092914
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TATTAATTGCTTACGGTAGTCCTGATTACGGACTAAGCACA
2092991
2092992
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TTCTACAATTAGATAATTAGCAAGTTGCTACCAGTGACTACC
2093070
2093071
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TTACAGCAACTCGTAGAGGCGTACTGTGAAGGAGATA
2093144
2093145
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
TTCCCCACCCTGAATATAAGCAGAATAAAAATACGG
2093217
2093218
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
ATTAATCCCAGATACAGACGGCATTTTAACCTCCCA
2093290
2093291
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
AAAACTACTCGCTGAGGAGTACCGTCGCTTAACA
2093361
2093362
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
AGAGTATGGGGACCAGAAATAGCAAATACTTCAATG
2093434
2093435
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
GTTAGGGTCGAAGGGATGCTCCCTAAACTCAAAAGCA
2093508
2093509
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAT
AACGCTACTCAGCAACAAGTCCTTACTCTTATGA
2093579
2093580
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAT
TATTACCCCAGTTATTGCGCTCTAAAGGAACAGGT
2093651
2093652
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAT
CCTTTTTTTTGCCTCAGCTTCTAGTCGATCTTCCA
2093723
2093724
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAT
CAAAAGTTAAATTATTGTTGTTGTGCGGGCTTTAAAC
2093797
2093798
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
ACAGTGTTTACAGGTGGGCTTGTTGATGCCGAT
2093867
2093868
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTAAATTGAAAC
ATAATTGTGATTACTATCCTTTTTATATGGCTATT
2093939
2093940
GTTTAAATCCCCGATTTTCAGGGGACTACGTTGAAAC
TCAATTTAGTCCTACAAATAATGAGGATTAAAACAAGT
2094014
2094015
GTTTAAATCCCCGATCCTCAGGGGACTAAATTAAAAC
2094051
Left flanking sequence : Till position 2090436 (length
bp)
TAATTTGGCAAATTTAATTTTGAGAATCGGCTAAAATGATTAAGGATTCGCGCAACTGGACTTTGAAAAC
TAAATATGACAAGGGGTTCAGATGCAAGCT
Right flanking sequence : From position 2094051 (length
bp)
AAACTGAGAGCAAATGCAGAAAGTTACAGCAGATCCCCCCTTCGCCCCTCTTAGTAAGGGGGGATGAGGG
GATCGTTGTGTAGCACTAGTTGATCGAGAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp