Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_020134_2                                                                                                                 top


Strain : Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532 RefSeq :NC_020134 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_020134_2
DR consensus (30 bp) : GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACNumber of repetitions :19
Begin Position : 784774 End Position : 785975

784774GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTCACCATCGCCTTTACTATACAAGTGTGTTCCTC 784837
784838GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACATTTCGGTGATGCACCCCACGAGCATAAAATGCTCG 784903
784904GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACGTTAGGTTTCTTTTTAGATTCTATGATACCTTTTA 784968
784969GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTCAAAAATCTATATCACTTTTTACTATATCCCTTGT 785034
785035GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACATCGATAATGTCAATTCTACCTAAAGGGTAATAATC 785100
785101GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACGTGTTTTTTAATATATTAAGTAATGTTTTATCATTT 785166
785167GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACCGTTAATTAATTTTTCATTCTTCATGGTTTTAACCT 785232
785233GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTCCCCAACGCTCAGCAAGTTTAACCTCCGATGTGA 785297
785298GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTGAGCGCATCAGCGAACTCATGGAAGAAGAGCGCAG 785363
785364GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACGCAGTAGTCCGTATGCTGGTAACATCCGGCCTCTC 785428
785429GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACCATAAATAATTATTTAGAGGCGCCTCCTGAAAGGC 785493
785494GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTTACATGTTGCTCATACAGTGGAACAGGTACCGTAA 785559
785560GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACCTTTAGCGTCAAACATTACATATATCCCTCTAC 785622
785623GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACCGAACACCAGGACCACAGCAAAGCGGTGCGTGATG 785687
785688GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACCCTCGACATTGGATATAGGCCCAAATTCACAAGA 785751
785752GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACCCTTCTGAAAGGATAATAAAAATAGCCGTCGCAA 785815
785816GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACATGATCGTTGTGGAAAACGAATACTTCGTTTCCAC 785880
785881GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTTATTAAAAGCGTTTAATGCACCGTCTATTGTTA 785944
785945GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC785974
Left flanking sequence : Till position 784774 (length bp)
GATGTAAAAATCGAGCAATATCAGCTATTTGCGGATTTTAATACTTAAAAACATGAAAGTTATGATTTTA
TAAAAGCGGCTTTTTACGAGGGTTTTACGG
Right flanking sequence : From position 785975 (length bp)
ATTTTCATTGTGGGAAACCTTCACATCGAAGGTATTTCATACAATTTATATTGAAAAGGATAAAACTAAT
GGTATAATTTAAATAAACGTTTTGTCTGTC
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp