Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_020411_9                                                                                                                 top


Strain : Hydrogenobaculum sp. HO RefSeq :NC_020411 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_020411_9
DR consensus (29 bp) : GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGNumber of repetitions :51
Begin Position : 1088952 End Position : 1092284

1088952GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGACTTATGCAAAAGTATCTATTACATTAGAACTATCAAAC 1089019
1089020GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCCTGACAAAAATGAGAGCATAACACTTCCTACTTTTGCAA 1089088
1089089GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTATCACACGTGCAAGTGTTTTGTGTTTTGATATGA 1089153
1089154GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTGTCTCGTAACATTAAAATTCGTTGGAGTTGTAT 1089217
1089218GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTCTTCAAAGCATACGTCAATAGTCTGCCAGCTTTGAGA 1089284
1089285GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCTAAATTTTGAAAGTGTGGAGGATATGAAATCTTTTT 1089350
1089351GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATTTCTTGAGATAATTTGATGATAGAAATATTTTTCT 1089416
1089417GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGTTAAAGAATCGTTTGAAAAACAGCAAATAGCAGAA 1089481
1089482GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATCTCCTACAGCACTCCATTGATAATATGTTATTT 1089545
1089546GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTTGCAGTTAGCTTCTTCAATAGATTGATGTTTATA 1089610
1089611GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTACAAGTTTGTAAAACATCTCTTAAAAGCTTGTTT 1089675
1089676GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTCGCACAGCTAAACAGCAACAGACTACTTGCTAAAATA 1089742
1089743GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGAACTCAACATCATGCAAATCTGGGACTGCTTCTTTTTGC 1089810
1089811GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCCAAAATATACTTGATAAAAACGATAAACAAGCACATTCG 1089879
1089880GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTATCTCATCTTTTTGTAGGTATCTCAATACTCCTTG 1089945
1089946GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTTTTTAGCATCACTTTTTAACGATGCATTAGGTTTAA 1090012
1090013GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTGTTGGATAAGTGATTTTTACTTTGTACTTCATGG 1090077
1090078GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGAAGCTGTCAATCTAAACACTACTTTGTAATTATTTG 1090143
1090144GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTTTGCATCAAGCGTATCAGGAACCAAAACTTTCGC 1090208
1090209GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGCACTTGCAAGTGCCACTTTGCGAGCCAATGCGAATAGA 1090276
1090277GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTTAAAATGGCGGAAAGTTCTTGCGATCTGTCTAGT 1090341
1090342GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATTAGAGCTTTGTCTTTTTTCAAGAAAGACTCTATTC 1090407
1090408GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTCCTTGGCGCTCTTTCTACTCTTGATATCACAGAA 1090472
1090473GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTTAGAAGAGCTTCAAGATTAAGTTGCTTTTCCATCT 1090538
1090539GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGAAATAGCAGCCCAGCTCCAACCCCACTGTCTTTCAG 1090603
1090604GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATGTCAACATGTATTGGTCAAAAGCTGAAGGAAGGC 1090668
1090669GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTGAGCCATATTCTCAGAGATTGGCTGGTGTAATAGCA 1090734
1090735GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGACGGTGTGCGTGGTCTTACGGGGGATGTCATTTTA 1090799
1090800GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGACAAAGACTTGATTGAAGATTTGCACTCAGTCAAAAA 1090866
1090867GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCGTTGAGTTGTGAGTATCACTTTGATATTTTGCATGA 1090932
1090933GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTATTCTATTTGCAATCTCTTCAGGCTTGAGGGCTCT 1090997
1090998GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCTTAATCACTTCAAGCCGCAGATGTGTATCTCCTTG 1091062
1091063GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTAGAGCATTTGCACTCATAGATGCTCCAGTAGGACT 1091127
1091128GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTAAGTTTTTGCTTAAAACTTCTTCTAAAGAAGCTGCA 1091193
1091194GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGAACACAGACGCAAACCTTTTAAACGCAAACGGTGTA 1091258
1091259GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGACGTTTTTCACACGACCTAACGCATCTATGTGTTTCATCTGA 1091329
1091330GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGACAATTGCTGAAAAAGTGGACGATGACAAGAAGAAGA 1091395
1091396GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGAAGTAAACAAAGCTCTGTTGCTTCTGGCGGCTTCT 1091460
1091461GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCTACCAATCGCATCTACGCCTATCACCTTCCAACCA 1091525
1091526GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTGATTACAAACATTATCAACGCACTTGTAAAACAAA 1091591
1091592GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGAGTAAGCGTTTTTTTAACAGAATGGAGGTCTTCTAT 1091657
1091658GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTAGAGCATTTGCATTAATAGATGCTCCTGTGGGACTT 1091723
1091724GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGGCGTTTGAAAATAGTATTTCTTTTGTGTAAAAATAGG 1091789
1091790GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGTTTAAAATGGCGGAAAGTTCTTGCGATCTGTCTAGT 1091854
1091855GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATTAGAGCTTTGTCTTTTTTCAAGAAAGACTCTATTC 1091920
1091921GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATATGATACTTTTAGCACTTGCCCGAGCCAGTAGCTAATGG 1091990
1091991GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGATTACTGAAAAATTGCAACAATTATTAAACTACATG 1092055
1092056GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGCTTCTAAGGTTTGATGTAGTCTTTCAATCATTTGAGGCA 1092123
1092124GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGAGCATCGGGGCGTTTATAAATACCGATGCAAAAACT 1092188
1092189GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAGACAACAAGCGTTTGATAAACGTTAGCGGGAGTTGTTGA 1092255
1092256GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG1092284
Left flanking sequence : Till position 1088952 (length bp)
CAGAATCTGGCATTTTCGGGAAATTACCTTCATTTGCGATGGGTACCCCCTTGACAAAACCATTGATACA
CTATATAATTTTAAATATAGTGATTTCTGG
Right flanking sequence : From position 1092284 (length bp)
TTTCATTCTACTTTGTAATAAAGGGTTATCTCTTTGTTGTCCCTTATGATTTTTACGCTGAAGCTTTGGC
TGTTTCTTAATGTACCTAATATTCTAAAAG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp