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CRISPRs details
NC_020419_5
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_020419_5                                                                                                                 
top
Strain :
uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17
RefSeq :
NC_020419 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_020419_5
DR consensus (36 bp) :
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
Number of repetitions :
23
Begin Position :
343493
End Position :
344980
343493
TTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
TTTGGTTTGTTGTTATTGACATCTTGTTCT
343558
343559
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
ATAATAGCGATAGCAGTGATATTCTTGATG
343624
343625
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
CAATATTTTCAAGCCCAGTGCTGTCTCCA
343689
343690
AGTTTAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
ATTACCATTAGCATCTAATCCAAATGATTT
343755
343756
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
ACCGTATGCTTCTATAGTGTTTAATCTACA
343821
343822
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
TGTATTCAGCTTCAATGGCGATTTTTGGTTC
343888
343889
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
TTACGAACCGATTAAACAAACATGGGACGC
343954
343955
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
CCAGAGATACGACGAACGTCACGGATTGAA
344020
344021
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
CATTATATCAGCGATTGAGAGCATAAAACC
344086
344087
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
TTGATTCGCTGAGAGCCTTTACGGCCTGTG
344152
344153
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
CAAAGTAAATACCATACGGGAACCACGTAG
344218
344219
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
GTACTAAAGGGTGCTACTACAGTAAAGCCC
344284
344285
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
CAATTGTACGGAATATATTAACTTTCTTAC
344350
344351
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
GTAAGGTGCATAGCGTACTCCGGTAGCTGG
344416
344417
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
TGGATATCATATTACCTGCATACGCTGATA
344482
344483
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
TAACCAAAGCAGGCATATCGTATACATTGG
344548
344549
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
ACATTGTTAAAAAATATAGAGAGAATTACG
344614
344615
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
CAGGGATTATTACGTCCTCGCCTGCTTTTA
344680
344681
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
GCAAAGTAACTTAATCTAAACATTTTTACA
344746
344747
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
ATGACGAATATAAAACTATGGCTGATATAG
344812
344813
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
GAATTCAAGTACGACGATATCAGAGATGGT
344878
344879
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
CATGCAAAGCACTTTTATCACACTTACGTA
344944
344945
GTTATAGTTTCCTTCCTCTCTCAGATGTGCTATAAT
344980
Left flanking sequence : Till position 343493 (length
bp)
GTAAAAAGCAACTTGCTGAACAAATAGATTCAAGGCAGTTAGTATTTTTTTAACAAATTAACTTATAATA
TGCAGCCACGACACTTCGTCCTCAAAGGTG
Right flanking sequence : From position 344980 (length
bp)
AGACAAACGCTAAATTATTGAAAACTCAATTGATTTAGCGTTTTCTATTTTTAGTAAGCAGGCTTTATTA
AATTTCGGAAGTATCTGTAATTTCAACTTC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp