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CRISPRs details
NC_020814_9
Flanking alignement tool
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NC_020814_9                                                                                                                 
top
Strain :
Hydrogenobaculum sp. SN
RefSeq :
NC_020814 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_020814_9
DR consensus (29 bp) :
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
Number of repetitions :
51
Begin Position :
1088919
End Position :
1092251
1088919
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACTTATGCAAAAGTATCTATTACATTAGAACTATCAAAC
1088986
1088987
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CCTGACAAAAATGAGAGCATAACACTTCCTACTTTTGCAA
1089055
1089056
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTATCACACGTGCAAGTGTTTTGTGTTTTGATATGA
1089120
1089121
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTGTCTCGTAACATTAAAATTCGTTGGAGTTGTAT
1089184
1089185
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TCTTCAAAGCATACGTCAATAGTCTGCCAGCTTTGAGA
1089251
1089252
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTAAATTTTGAAAGTGTGGAGGATATGAAATCTTTTT
1089317
1089318
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTTCTTGAGATAATTTGATGATAGAAATATTTTTCT
1089383
1089384
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GTTAAAGAATCGTTTGAAAAACAGCAAATAGCAGAA
1089448
1089449
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATCTCCTACAGCACTCCATTGATAATATGTTATTT
1089512
1089513
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTGCAGTTAGCTTCTTCAATAGATTGATGTTTATA
1089577
1089578
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTACAAGTTTGTAAAACATCTCTTAAAAGCTTGTTT
1089642
1089643
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TCGCACAGCTAAACAGCAACAGACTACTTGCTAAAATA
1089709
1089710
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AACTCAACATCATGCAAATCTGGGACTGCTTCTTTTTGC
1089777
1089778
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CCAAAATATACTTGATAAAAACGATAAACAAGCACATTCG
1089846
1089847
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTATCTCATCTTTTTGTAGGTATCTCAATACTCCTTG
1089912
1089913
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTTTTAGCATCACTTTTTAACGATGCATTAGGTTTAA
1089979
1089980
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTGTTGGATAAGTGATTTTTACTTTGTACTTCATGG
1090044
1090045
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GAAGCTGTCAATCTAAACACTACTTTGTAATTATTTG
1090110
1090111
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTTGCATCAAGCGTATCAGGAACCAAAACTTTCGC
1090175
1090176
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GCACTTGCAAGTGCCACTTTGCGAGCCAATGCGAATAGA
1090243
1090244
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTAAAATGGCGGAAAGTTCTTGCGATCTGTCTAGT
1090308
1090309
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTAGAGCTTTGTCTTTTTTCAAGAAAGACTCTATTC
1090374
1090375
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTCCTTGGCGCTCTTTCTACTCTTGATATCACAGAA
1090439
1090440
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTAGAAGAGCTTCAAGATTAAGTTGCTTTTCCATCT
1090505
1090506
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AAATAGCAGCCCAGCTCCAACCCCACTGTCTTTCAG
1090570
1090571
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATGTCAACATGTATTGGTCAAAAGCTGAAGGAAGGC
1090635
1090636
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TGAGCCATATTCTCAGAGATTGGCTGGTGTAATAGCA
1090701
1090702
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GACGGTGTGCGTGGTCTTACGGGGGATGTCATTTTA
1090766
1090767
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GACAAAGACTTGATTGAAGATTTGCACTCAGTCAAAAA
1090833
1090834
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CGTTGAGTTGTGAGTATCACTTTGATATTTTGCATGA
1090899
1090900
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TATTCTATTTGCAATCTCTTCAGGCTTGAGGGCTCT
1090964
1090965
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTTAATCACTTCAAGCCGCAGATGTGTATCTCCTTG
1091029
1091030
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TAGAGCATTTGCACTCATAGATGCTCCAGTAGGACT
1091094
1091095
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TAAGTTTTTGCTTAAAACTTCTTCTAAAGAAGCTGCA
1091160
1091161
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AACACAGACGCAAACCTTTTAAACGCAAACGGTGTA
1091225
1091226
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACGTTTTTCACACGACCTAACGCATCTATGTGTTTCATCTGA
1091296
1091297
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACAATTGCTGAAAAAGTGGACGATGACAAGAAGAAGA
1091362
1091363
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GAAGTAAACAAAGCTCTGTTGCTTCTGGCGGCTTCT
1091427
1091428
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTACCAATCGCATCTACGCCTATCACCTTCCAACCA
1091492
1091493
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTGATTACAAACATTATCAACGCACTTGTAAAACAAA
1091558
1091559
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GAGTAAGCGTTTTTTTAACAGAATGGAGGTCTTCTAT
1091624
1091625
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TAGAGCATTTGCATTAATAGATGCTCCTGTGGGACTT
1091690
1091691
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
GCGTTTGAAAATAGTATTTCTTTTGTGTAAAAATAGG
1091756
1091757
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
TTTAAAATGGCGGAAAGTTCTTGCGATCTGTCTAGT
1091821
1091822
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTAGAGCTTTGTCTTTTTTCAAGAAAGACTCTATTC
1091887
1091888
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATATGATACTTTTAGCACTTGCCCGAGCCAGTAGCTAATGG
1091957
1091958
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ATTACTGAAAAATTGCAACAATTATTAAACTACATG
1092022
1092023
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
CTTCTAAGGTTTGATGTAGTCTTTCAATCATTTGAGGCA
1092090
1092091
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
AGCATCGGGGCGTTTATAAATACCGATGCAAAAACT
1092155
1092156
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
ACAACAAGCGTTTGATAAACGTTAGCGGGAGTTGTTGA
1092222
1092223
GTTTCTAATTAACCGTGTGGAGTTGAAAG
1092251
Left flanking sequence : Till position 1088919 (length
bp)
CAGAATCTGGCATTTTCGGGAAATTACCTTCATTTGCGATGGGTACCCCCTTGACAAAACCATTGATACA
CTATATAATTTTAAATATAGTGATTTCTGG
Right flanking sequence : From position 1092251 (length
bp)
TTTCATTCTACTTTGTAATAAAGGGTTATCTCTTTGTTGTCCCTTATGATTTTTACGCTGAAGCTTTGGC
TGTTTCTTAATGTACCTAATATTCTAAAAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp