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CRISPRs details
NC_020887_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_020887_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532
RefSeq :
NC_020887 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_020887_2
DR consensus (30 bp) :
GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
Number of repetitions :
19
Begin Position :
784886
End Position :
786087
784886
GGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
TCACCATCGCCTTTACTATACAAGTGTGTTCCTC
784949
784950
CGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
ATTTCGGTGATGCACCCCACGAGCATAAAATGCTCG
785015
785016
GGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
GTTAGGTTTCTTTTTAGATTCTATGATACCTTTTA
785080
785081
AGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
TCAAAAATCTATATCACTTTTTACTATATCCCTTGT
785146
785147
TGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
ATCGATAATGTCAATTCTACCTAAAGGGTAATAATC
785212
785213
CGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
GTGTTTTTTAATATATTAAGTAATGTTTTATCATTT
785278
785279
TGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
CGTTAATTAATTTTTCATTCTTCATGGTTTTAACCT
785344
785345
TGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
TCCCCAACGCTCAGCAAGTTTAACCTCCGATGTGA
785409
785410
AGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
TGAGCGCATCAGCGAACTCATGGAAGAAGAGCGCAG
785475
785476
GGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
GCAGTAGTCCGTATGCTGGTAACATCCGGCCTCTC
785540
785541
CGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
CATAAATAATTATTTAGAGGCGCCTCCTGAAAGGC
785605
785606
CGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
TTACATGTTGCTCATACAGTGGAACAGGTACCGTAA
785671
785672
AGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
CTTTAGCGTCAAACATTACATATATCCCTCTAC
785734
785735
CGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
CGAACACCAGGACCACAGCAAAGCGGTGCGTGATG
785799
785800
GGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
CCTCGACATTGGATATAGGCCCAAATTCACAAGA
785863
785864
AGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
CCTTCTGAAAGGATAATAAAAATAGCCGTCGCAA
785927
785928
AGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
ATGATCGTTGTGGAAAACGAATACTTCGTTTCCAC
785992
785993
CGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
TTATTAAAAGCGTTTAATGCACCGTCTATTGTTA
786056
786057
AGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAA
786086
Left flanking sequence : Till position 784886 (length
bp)
AGATGTAAAAATCGAGCAATATCAGCTATTTGCGGATTTTAATACTTAAAAACATGAAAGTTATGATTTT
ATAAAAGCGGCTTTTTACGAGGGTTTTACG
Right flanking sequence : From position 786087 (length
bp)
TATTTTCATTGTGGGAAACCTTCACATCGAAGGTATTTCATACAATTTATATTGAAAAGGATAAAACTAA
TGGTATAATTTAAATAAACGTTTTGTCTGT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp