Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_021009_1                                                                                                                 top


Strain : Coprococcus catus GD/7 RefSeq :NC_021009 (chromosome linear)
CRISPR id : NC_021009_1
DR consensus (36 bp) : GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCNumber of repetitions :16
Begin Position : 14161 End Position : 15186

14161GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCTCATGTCTTTAAATCTTAGACATCCTCTTT 14226
14227GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCGGTTTTATCTCCAGGCCCAACTCCTCTCTG 14292
14293GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCAACAATATCCTCTTTCATCTATCTCCTGCT 14358
14359GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCATTTCCTACAGCATAAGGGTCAAAAAATCC 14424
14425GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCTTAATCTACATACTTTATATCCAAACATGC 14490
14491GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCTTTATACGGGCCTTCAAATTTCTGACATCC 14556
14557GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCAACAGCAGAAACAATAACGTCTATATCATT 14622
14623GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCCGCGTCCCATCCTTCCACTTCGCCGGTCGT 14688
14689GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCTGGGCGGACGCCGAAAGAAGACTATCGGCA 14754
14755GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCTCTTAACACGCATACCAGAACACCACTTCC 14820
14821GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCATTGGAGGAGTTGTCGGAATATGACCCATT 14886
14887GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCTGCTGTACAAGGCTTCAATGATTCCATGAC 14952
14953GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCCCGGAATATCTCCGGCTCTGGCATACATTA 15018
15019GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCTGCTGTGTTTTTTGCTGCATTGTTTCCGGT 15084
15085GTTTGAGAATGATGTAAAAATGTATGGTACTCAAGCATTCTATCGCCTATCAGTTTTACGGCGACA 15150
15151GTTTGAGAATGATGTAAAAACATATAGTATGTAATT15186
Left flanking sequence : Till position 14161 (length bp)
CGGTATATTATAGATAGAGATGGTTGTGAAATCTATTAAAATCACACAGCTTGGGTACCTTGTTTTATGC
AGGTGATAGCATTTCATTTTTGAATTTGAG
Right flanking sequence : From position 15186 (length bp)
TATTTTTGATTCATCCTCCCATGCGAGGGTTTGAGAATGATGTAATGGTATTAAAACAGGTTATTCCCTG
TCGTTTGTGATAGGGAATTTTAGTATATAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp