Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_022529_2                                                                                                                 top


Strain : Campylobacter jejuni 4031 RefSeq :NC_022529 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_022529_2
DR consensus (36 bp) : GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATNumber of repetitions :5
Begin Position : 1482249 End Position : 1482548

1482249TTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATGCTTTAGGAAATGCTTTAAAACGCTTTGGA 1482314
1482315GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATTATGAGTTATCAAGTTTTTGTTTTTAATAA 1482380
1482381GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATTTTTTGAAACATCAACATCTTTAATCATAT 1482446
1482447GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATGAAGATGAGGTTGCGGGTTTAATAACGACG 1482512
1482513GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT1482548
Left flanking sequence : Till position 1482249 (length bp)
TTTATTTCGATTTTAATCAACCCTAAATTTCAATAAGTTTCAAATTTGCACCTCCTTTTAGTGAAGTAAT
TAGCCCTAGCAGAGTTTCAATCCACTAGGG
Right flanking sequence : From position 1482548 (length bp)
AGATATTTACCAGATAATGAAAATTTCGGGGTTTTTTCATGAAAAATAGCAAAAATTATGCTATAATCTC
AATAAGAAATTTAAAAAGGGACTAAAATAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp