CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_022571_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_022571_4                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium saccharobutylicum DSM 13864
RefSeq :
NC_022571 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_022571_4
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
Number of repetitions :
33
Begin Position :
2818156
End Position :
2820274
2818156
ATTTAAATACATGTCATGTTAATGTTAATC
CTACACTTACTCTGTAGCTACCCCATGGCTTACT
2818219
2818220
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ATTTCTTCCTTTTCTGTTTGCTATATTGGCTAATTT
2818285
2818286
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ACTTTGAGCCAGTTATAGATAAGCTTATTAAATA
2818349
2818350
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AAGATGAATAATGAAAGGTATAGATATTTCAAATAA
2818415
2818416
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AGGTTAAAGTTATTACCAAAGAGTGTAATTACTGC
2818480
2818481
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTAAACCGCCTTTTGGATACATAGGTATCTTATGGTT
2818547
2818548
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTTGATTTGTTTTAGTCTTCTTTTTTTTATACAA
2818611
2818612
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ACATAGTTACTTGGGCTTAAGTTATCTATTGTAGAT
2818677
2818678
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TCCAGCTAATGCTAGTGTATTACAAATAGATGGAA
2818742
2818743
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTTATTCTTTTTGCTCGTACTAAACTATTATCTACA
2818808
2818809
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ATAGATGGATTTACTCAACTTGGATTCGATGCAAA
2818873
2818874
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AAAGTATTTAAAATAGAGAGGTGATAAATGATGAG
2818938
2818939
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AACTATATTAATTTCATCATCTTTTAAATCAATGTA
2819004
2819005
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
CGAAAACTGATAATCCAAGTGACCCTGCTCCTTC
2819068
2819069
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
CTTGTGCAACAGACTTAAACTTAACATTATCAGAA
2819133
2819134
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
CCAACAGTTAATTTTTCCATCTTGACCTTTTATAT
2819198
2819199
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
AAGGTAGGCATATTTAAGTAGATTTTAAGAAGCTTT
2819264
2819265
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTTTACTGATACAAACACTAAAACTGATACTAAAAC
2819330
2819331
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ATAATGGTGGTAAATTCTACATGGTAATTCCTAA
2819394
2819395
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TATTCCGGAAATGTTGATATTTATTTAAAATTAGC
2819459
2819460
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
GCAAATTTAATTTAAGGAGGAAATTATTATTATGTT
2819525
2819526
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ACTCATGTTACTATATGTTATACAAAAAGTGGTAG
2819590
2819591
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TAGTAAAAGTGAGGTTGAACATATGATAAAACATA
2819655
2819656
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTATGGTTGCTCTGTTAGTGGATTTTCTTTTTCTGT
2819721
2819722
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ATTTAGAAATAGATAAAACTCAAGAGAATAGAAT
2819785
2819786
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
GACTCACTTTTGTAAGGTCAGGTAATTCAGTTCGT
2819850
2819851
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TCATAAAGAAAATAAGAATCGCAAATATTAAAATATC
2819917
2819918
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
ACGTAACTATTATTAGAATGAAACGTATTTATACT
2819982
2819983
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
GGTTAATCCTAAATCAATTGCCCATTGTTCCATCAA
2820048
2820049
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TGACTTGGGTAAAGAACATCAGACTTTAGTTGTTAT
2820114
2820115
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TATCAATCAAATCCTCTTAGTGCATATTTCATCA
2820178
2820179
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
TTCAAGGTATTCTGATTTTACATTTAGTCAGTTGAG
2820244
2820245
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
2820274
Left flanking sequence : Till position 2818156 (length
bp)
TCTGATTTTTATGCTAAAAACAATATGTCTTTTACAATTGGTTTCATCATAGTTAATGTTAGTCTTTAAA
TTATACAAAGCACAAGTATGTTTTAGATAA
Right flanking sequence : From position 2820274 (length
bp)
CCCTAAGAAAAAAGCCACTTCTTATATTAAGATAATGCTTTCATTATAGTTAGTGTAACACATCCTTAAA
AATTTACCAAGCACCCTCAACTTAAATTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp