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NC_022592_3
Flanking alignement tool
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NC_022592_3                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium autoethanogenum DSM 10061
RefSeq :
NC_022592 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_022592_3
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
Number of repetitions :
44
Begin Position :
1499836
End Position :
1502711
1499836
TGTTTCATACAACATTTGTTACGGTTCAAC
TATCATCACTTTGACGATAATTCAAAGTTATACCAATAAAGT
1499907
1499908
ATTTAAAAACATTTCATATTATGGTTCAAT
AATTCCTTTATAATGTATTATTTACAATTATTATTT
1499973
1499974
ATTTAATCACATCTCATGTTGAAGTTCAAC
TTATAGCTCCAGACGAGGAAAATGCCAGAGATTATTA
1500040
1500041
ATTTAAATACATCCCATGTTAAGGTTCAAT
TAAAAAATAGACCATATACTTCTTTAAAAGATTTTCA
1500107
1500108
ATTTAAATACATCCCATGTTAAGGTTCAAC
CAACTATAGAGCCACTTGGAAGGGTAATTAAGTT
1500171
1500172
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTGAAATACTTGATATGTATCCTAATGATGGAAGTTT
1500238
1500239
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTATAAATAGAAACTTCACAAAAGATCCTAAATCCAC
1500305
1500306
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTTAATTTTCGCCAATTCTACATTACTATATTTCA
1500370
1500371
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTTATTGTTTACTTTATCAGTATTTGCATTGACTT
1500435
1500436
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TATGGAAGAAATAAGACTTTTAACAGCAAATGAAAT
1500501
1500502
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
CGTCACAAAAGAAGAAATAGAAAAAATTGTAGATGAA
1500568
1500569
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
GCAGATACAAAGAAGAAGGATTCCCTTGGGCAAGAA
1500634
1500635
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
AAAATCAAATAAACCTATTGAATGGATAATCTCCCAG
1500701
1500702
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
ATCATTATTGAAAGCTCTTATCCTTTATTCGATTTA
1500767
1500768
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
ATGCCGTGCAATCAGACTGGATGGTCTACTATTTA
1500832
1500833
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
AAACATTTCTTAGATGCTATATCTGGTTATGTAAG
1500897
1500898
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTTTAGGTACTGGTATTATTTTTGCTCCATATTATTG
1500964
1500965
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
AGTCTAGGCTTCAGCAATTTTAAGAAGGTAAAAAAA
1501030
1501031
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
GGAGGCAGTAAATGATCTTGGACATACGCCTGTAAG
1501096
1501097
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TAGGACAAGGTAGAGATATGGATTTTTCTGCTTACAAA
1501164
1501165
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TGAAAAAGAAGGAGATAACCCAACTCAAAATAGTAAG
1501231
1501232
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTAATATCTCATCTATCATATTATACTTCCTTTCCA
1501297
1501298
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTAAATAATTAGTATAAAAATGGAGGAATGTATAAA
1501363
1501364
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TATTGGCCAAACTTTAAATATACATCTGCAATGTC
1501428
1501429
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
CTCTATAGCAGTTCAATTTCATCCTGATCTAATCCC
1501494
1501495
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TAGACCACAATTAAATGCAATGTTAGAATTTGCTCG
1501560
1501561
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTTTAAAGATAGTATAACTAAGCAACAAAATGATTA
1501626
1501627
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
CGATAAAAGACACACTCAAAACTGTATGGGATGCTA
1501692
1501693
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTTGGCTTACTACTTATAGCAGTTCCAACAGTTATTAC
1501760
1501761
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
AAAGCTTCGGCATATAAAAGTTGGAGCTTTATACTG
1501826
1501827
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTAAGCAGTTTAAGCCATTGTATCGAGTAGACTG
1501890
1501891
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
GTTGGTGGAGAAAAGGAACCTCTATTACTAGAAAA
1501955
1501956
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TGATAACTTAATAAAAAATATAGAGTTAAAAAAAGG
1502021
1502022
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
GGTGCTAAAGATACTGGATTAGGAATAATTACATCA
1502087
1502088
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
GCCCACTATTTTGTGTATAATTTATTACTCCAAACA
1502153
1502154
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TACATTCTCTACTACAGAATAATCGAATTTTACCTG
1502219
1502220
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
ATAATGGATAAGATAATATTATATTAGTCATTTTTT
1502285
1502286
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
ATTGGTTAGGCTCAAAATTCCTAGCGTTTTGTCCTT
1502351
1502352
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTTGCACAACTTCGTTAAAACATAATTTAGCGAAGT
1502417
1502418
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
AAATGAAAACATATGTTTTACACCTTATCAAGTTGG
1502483
1502484
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
AATAATAGCAGTAATTTTATTAATTACAGGCATATA
1502549
1502550
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
ATGTATAAATAAAGAAACAAACCAAATTGTAGAATA
1502615
1502616
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
GCAGCTCCAGGAGCAAAAACCAAAGGTACTATTCGC
1502681
1502682
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
1502711
Left flanking sequence : Till position 1499836 (length
bp)
GTTTACATTTATATTATTGTACTTAAATCAAATTTATATTCATAGTAAAACCAATAAAGTTGAAGTATTG
AGAAATATTTAGAATTAATTTAAACAAATC
Right flanking sequence : From position 1502711 (length
bp)
CACAGTAAAATAGCCATTCTTTATTTTCATTATAACCCTAAAACCCTTAACAATAAAGGCATTCGCTGAA
AATTTTCCAACCGTTTTTCACTTTTCATAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp