Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_022592_4                                                                                                                 top


Strain : Clostridium autoethanogenum DSM 10061 RefSeq :NC_022592 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_022592_4
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACNumber of repetitions :34
Begin Position : 1504480 End Position : 1506686

1504480AATTAGATACATCTCATGTTAAGGTTCAACAGTAGCTAATGATCAAATATTAACATTCCAATTACT 1504545
1504546ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAGGTGGTTATTTTCAAAATAGTTATCAAGCCACACCG 1504612
1504613ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACTATATCAACTCTCCCCACTTTTGGGGAACGTACTCT 1504678
1504679ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACGATGATTATAAAGTATGTTTGCTAACAGCTATAGCGT 1504745
1504746ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACATTTGTACTTGGCTCTGCTATCTTGAATATTAATTTA 1504812
1504813ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACTAATTATATATATTCTGATTGGGTTTATATAAATTC 1504878
1504879ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACAAGAGTTGATACTTTACTTATAGATTACTTAGGTGC 1504944
1504945ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACGGGCATTAAATATAAAAAGAAATATATTCCATGAAT 1505010
1505011ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACTCTATTACCTTAAGAAAATTAAGTCCACTAGCATTA 1505076
1505077ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACCTATCCCAGCAATTAATATCTCTATTAATATCTCTCA 1505143
1505144ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACATTGCTCACCCATTTTAAATAGTAATTCCCAAAAA 1505208
1505209ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACGTGGTTACTTGGGATACACCAAGGCGGCTAACAAA 1505273
1505274ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACGGAAATATATCTTCTCCTAGATCTCTGTACTTATTT 1505339
1505340ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACATATTAGGCTGTTTAAAAGATACCTTACAGTTAAAT 1505405
1505406ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACGCTGCAGAAAGAAAAAAGTGAGATGGAAGAAAAAAA 1505471
1505472ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACTATATACGTAAATAATTTAAGTGGAACAACAACATC 1505537
1505538ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACCAACAACTTTCTCATGCAGGGGCCATATCAAAAGA 1505602
1505603ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACAAAAGAAAATGAAAATAAAGTTCCAAGTGCAACCAT 1505668
1505669ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACCTTCCACGCACTATGTAACACATTTTTGCTTTAGAG 1505734
1505735ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACCATAACCATAGATCAGTGCAATAAATTGTTTTTTAC 1505800
1505801ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACTTGCCTTATTAGCGAATACAATAGAATTAGAAATTA 1505866
1505867ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACATGGCTTTTGTTGCTGCTATGTGTGCAGGAGGTAC 1505931
1505932ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACTTGAGAAGGAGTATAAAATTGCTAATAAGCAGATGA 1505997
1505998ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACGTATAGATACTACATGCATTAAGCATATAGATGTATT 1506064
1506065ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACTTTGACAGCAACAAGAGAAAGAATTTCACATATATT 1506130
1506131ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACAAATACATTTTATAAATTATTAAAAGAATATGAGG 1506195
1506196ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACGAAGCTATAGAAGAATTAAAGGATCTATAAGAGAAA 1506261
1506262ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACGAGGTATTTAAATTGTTAAAAGGTATAGATATATA 1506326
1506327ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACATCAACTCCTAAAATATTCATAAATTTTATACCTCC 1506392
1506393ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACAAGGCGGATCCACAAATATTAAATCAGCCTCTTTCA 1506458
1506459ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACTATTTGTTATTGGAGTGTATGTAGCAACAAAGACAA 1506524
1506525ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACGTATGATAGTGTGACAGGTGCTATTATATTAGACAC 1506590
1506591ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAACTAACGGAAAAGGATGGGAGCACGTAAGTATAACACA 1506656
1506657ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC1506686
Left flanking sequence : Till position 1504480 (length bp)
TAAATTCAGAGAAAAACCTTAGTAATTTCAATAGTTTTAAGACTATAGACTTTCATCAATCTCACGTTAT
AATAGAGTCTACTATATTCCTAATTTTTCA
Right flanking sequence : From position 1506686 (length bp)
CACAGTAAAATAGCCATTTCTTATTTTCATTATAGTCCTAAAACCCTTAATAATAAAGGCATCAACAGAA
AATTTTCCAACCGTTTTTCACTTTTCACAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp