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CRISPRs details
NZ_AP014815_2
Flanking alignement tool
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NZ_AP014815_2                                                                                                                 
top
Strain :
Geminocystis sp. NIES-3708 GCF_001548095
RefSeq :
NZ_AP014815 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_AP014815_2
DR consensus (36 bp) :
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
Number of repetitions :
29
Begin Position :
1387979
End Position :
1390024
1387979
GTGAACAACGCCTAATGGTGATCGAAGGTTAAACAG
TCTCCTTTTAACCTTGACTACTATAGTATAACAACT
1388050
1388051
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
GGGTTCTGGAAGCTCTCAGACTAATTCAGACTTAAA
1388122
1388123
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
ATTCTCAGCTACTCAATTAGCGAAGAGATTAGGGATT
1388195
1388196
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
GATAACAGCATGATTGCCTTCTAGCGATTTGAATT
1388266
1388267
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
TTCCTCCCACAGGTACTAGCATATTATTTAAAGG
1388336
1388337
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
ATATTGCAAAAGAAATAGGGAAAAAATATCAGTAT
1388407
1388408
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
TAAAAGTACAGTCCCATTCACGGGAAAAGATTTTC
1388478
1388479
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
AGTAATAAGTAATGCCAAACTTAAACTATAATTT
1388548
1388549
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
TGGCTATATTTCCGAGGCACAGCGTAAGAGATTGTACG
1388622
1388623
ATGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
ACAGAGAAAATGTAATAAAAGCTCATGCTGAATATTT
1388695
1388696
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
ATCGCTCAAAATAGTCAAAGAAAATTGCCTGTTCTACAA
1388770
1388771
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
TTTCAGCCCCTGCTAGGTAGATTCTTTTTTGCTCCTAT
1388844
1388845
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
TACTCAACGGGCATTTACTCTCTAAGCAATAGAAG
1388915
1388916
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
ATGATTTTTTTGTTGTTTCAATACCTCATTAAAGT
1388986
1388987
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
TCTAATGCACTTTCTACGAACCCTTTTAAATAAT
1389056
1389057
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
CAGAAAAAGTACCTTTAGAATTTATCGTCAGTTCCT
1389128
1389129
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
TTCTCAGCTACTGAATTAGCTAATAGATTGGGGATT
1389200
1389201
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
AGTGTAAAGAATCTTACCATCAGGGGTGCTTACAG
1389271
1389272
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
AATTTACAGGAAATAATTAATATTTTTGTGCCTAT
1389342
1389343
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
TGATGAAAAAAGAAATGCTCAATTTATTTTTCTA
1389412
1389413
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
AGTACAAAATAGTAAAAAAATAATCGCAACAATAG
1389483
1389484
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
ATGATAGCTTTAATGCTATCAACGTTTTCGATTGT
1389554
1389555
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
TCTATTTCCTGTGCTGTCGACCAAAAATTCGGATT
1389625
1389626
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
CTTCCAAAACTTGACCTTTTGCTCTCGTCCATCT
1389695
1389696
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
ATATTCTTCCCAAATAATTTGGTCTGGGTCAGATTT
1389767
1389768
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
TGTTCCAGTCCCACTCATGCACTGTTGCATCTGCTGA
1389840
1389841
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
ATAGACTATCAGTTTATACTCACTCAATAAATGATAC
1389913
1389914
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
AATTTAATAAATTTAAGTTTGGTATTTTTACGGTAGAGG
1389988
1389989
GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG
1390024
Left flanking sequence : Till position 1387979 (length
bp)
AGAGTTTCTAAGGCGATCGACAGTATTAATTTTCTTGTTAATTATTTTCAGAATTTTATTGATGCTAATT
GTTAAAATATGATATTTTAGCCTTGCTTTC
Right flanking sequence : From position 1390024 (length
bp)
TGCGAAGACTGAAAGCCTTTAATAGAAAATCTTCCTAGATAACTTTTCAAGGTACAAATTAATAATAGAA
AAAACTATCATTTTTGGAAAAATAAACTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp