Institut de Génétique et Microbiologie

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NZ_AP014815_2                                                                                                                 top


Strain : Geminocystis sp. NIES-3708 GCF_001548095 RefSeq :NZ_AP014815 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_AP014815_2
DR consensus (36 bp) : GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGNumber of repetitions :29
Begin Position : 1387979 End Position : 1390024

1387979GTGAACAACGCCTAATGGTGATCGAAGGTTAAACAGTCTCCTTTTAACCTTGACTACTATAGTATAACAACT1388050
1388051GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGGGGTTCTGGAAGCTCTCAGACTAATTCAGACTTAAA1388122
1388123GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGATTCTCAGCTACTCAATTAGCGAAGAGATTAGGGATT1388195
1388196GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGGATAACAGCATGATTGCCTTCTAGCGATTTGAATT1388266
1388267GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGTTCCTCCCACAGGTACTAGCATATTATTTAAAGG1388336
1388337GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGATATTGCAAAAGAAATAGGGAAAAAATATCAGTAT1388407
1388408GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGTAAAAGTACAGTCCCATTCACGGGAAAAGATTTTC1388478
1388479GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGAGTAATAAGTAATGCCAAACTTAAACTATAATTT1388548
1388549GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGTGGCTATATTTCCGAGGCACAGCGTAAGAGATTGTACG1388622
1388623ATGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGACAGAGAAAATGTAATAAAAGCTCATGCTGAATATTT1388695
1388696GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGATCGCTCAAAATAGTCAAAGAAAATTGCCTGTTCTACAA1388770
1388771GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGTTTCAGCCCCTGCTAGGTAGATTCTTTTTTGCTCCTAT1388844
1388845GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGTACTCAACGGGCATTTACTCTCTAAGCAATAGAAG1388915
1388916GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGATGATTTTTTTGTTGTTTCAATACCTCATTAAAGT1388986
1388987GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGTCTAATGCACTTTCTACGAACCCTTTTAAATAAT1389056
1389057GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGCAGAAAAAGTACCTTTAGAATTTATCGTCAGTTCCT1389128
1389129GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGTTCTCAGCTACTGAATTAGCTAATAGATTGGGGATT1389200
1389201GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGAGTGTAAAGAATCTTACCATCAGGGGTGCTTACAG1389271
1389272GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGAATTTACAGGAAATAATTAATATTTTTGTGCCTAT1389342
1389343GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGTGATGAAAAAAGAAATGCTCAATTTATTTTTCTA1389412
1389413GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGAGTACAAAATAGTAAAAAAATAATCGCAACAATAG1389483
1389484GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGATGATAGCTTTAATGCTATCAACGTTTTCGATTGT1389554
1389555GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGTCTATTTCCTGTGCTGTCGACCAAAAATTCGGATT1389625
1389626GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGCTTCCAAAACTTGACCTTTTGCTCTCGTCCATCT1389695
1389696GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGATATTCTTCCCAAATAATTTGGTCTGGGTCAGATTT1389767
1389768GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGTGTTCCAGTCCCACTCATGCACTGTTGCATCTGCTGA1389840
1389841GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGATAGACTATCAGTTTATACTCACTCAATAAATGATAC1389913
1389914GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAGAATTTAATAAATTTAAGTTTGGTATTTTTACGGTAGAGG1389988
1389989GTGATCAACGCCTAATGGCGATCGAAGGTTAAACAG1390024
Left flanking sequence : Till position 1387979 (length bp)
AGAGTTTCTAAGGCGATCGACAGTATTAATTTTCTTGTTAATTATTTTCAGAATTTTATTGATGCTAATT
GTTAAAATATGATATTTTAGCCTTGCTTTC
Right flanking sequence : From position 1390024 (length bp)
TGCGAAGACTGAAAGCCTTTAATAGAAAATCTTCCTAGATAACTTTTCAAGGTACAAATTAATAATAGAA
AAAACTATCATTTTTGGAAAAATAAACTAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp