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CRISPRs details
NZ_AP014925_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_AP014925_1                                                                                                                 
top
Strain :
Prevotella intermedia GCF_001548195
RefSeq :
NZ_AP014925 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_AP014925_1
DR consensus (47 bp) :
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
Number of repetitions :
39
Begin Position :
540349
End Position :
543313
540349
AGTTGTGATTGCTTTAGAATTGGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
AGTAGGCATTTCGTAATGTGCTCGGAGGTT
540425
540426
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGTAAATACAAC
AAGTAGACGATAACGAAGATACCATAGTC
540501
540502
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
GCATTTTCACAAGATTTTCAAAGACTGTTT
540578
540579
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TTTATCATATCTTTTCAATATAAATTTTTA
540655
540656
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TGGCACTACCATTACTTACATCTTCGGCAT
540732
540733
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
ATTCTGACAATTAGGGTCGAGAGAATAACC
540809
540810
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
CCATAATTTAAATTATCAGACCAAATAGAA
540886
540887
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TGCCAAAGGACAAATACGGAAAGGCTGACA
540963
540964
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
AAAGGATATGAATTTAGGTTTTATGTTTCC
541040
541041
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
ACTCGTGAAAGGCGACGAGAAAACAATCG
541116
541117
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
ACCTAGTGGTATGTCATTATTAAATCCCCT
541193
541194
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TAATAGCAGCATTGTAAAGGCTTTGAGCTT
541270
541271
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TCTTCGTCCGATACTACCTTTTTCGAGTGG
541347
541348
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TTGATAAGCTAAGCCGAGTATTTGACGGGC
541424
541425
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TAAATGGGTTGCCACTTTTTAACGTTGTTG
541501
541502
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
CTGCAGCAAGCAATACAACAACATCTTTCC
541578
541579
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
ATTGGGGTAAGTTCGTAACCCATAGCGTCA
541655
541656
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TAAGGTTCTGCTTCAATATTTGGTCGTATA
541732
541733
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
GTAGACCTAAAAGAAGTATTACAGTTTATT
541809
541810
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TTAATGGCTCAAACGTTGTTACGGTGGCAG
541886
541887
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
AGGACGGAAACTGTGCTATCGTTACACGTG
541963
541964
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TAAATAAATATGAAAGTTTTTAGATTAAAT
542040
542041
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
GCCCTTTCCTTTAATGTCAATAATTTTCAA
542117
542118
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TGTGTATAAGTAGGCAAGTGCTGCACCCGC
542194
542195
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
GAGAAAGTTACTATTATTGATGTGTCTGTG
542271
542272
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TTAGTATTATATGCATCGAGCGCATAGCC
542347
542348
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
CCAACAGCACCACTAACTAACATACCTAAG
542424
542425
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TAGAGAGAGGATATTGGCAATGTTGAGGCG
542501
542502
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
ATTATTTCCAAGCACTGTTTATTCTTTCCT
542578
542579
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
AGAACGAAACTATACAACAAGTAGAGCAGG
542655
542656
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
GAATATCAACGTGTGAACGAAACGAAAAA
542731
542732
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
AACGTAGGCACAGGAAATTATTTGAAGAAA
542808
542809
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TGTACAAGGAGTATGCGCCTGTATTTGATA
542885
542886
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
TACAATATACGCTCCACTTGGTTGCACCA
542961
542962
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
CGGGATAAAAGCCCTTACGACCGCTTTTG
543037
543038
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
ACTCGGTGGCATTGAAATGACGATAGGGCG
543114
543115
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
CGCTGAAAGATAACTTTTTGAAGTTGTCC
543190
543191
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
AAAAAAGTTTGCATAATTTTAAATTTTAT
543266
543267
GTTGTGATTAGCTTTAAAATTAGTATCTTTGCATTGGCAAATACAAC
543313
Left flanking sequence : Till position 540349 (length
bp)
TATTTTCCAGCTCTCTTTTTCTCTATTTTCCCCTTTTCGCTTGTGTTAAATTTATTGCCCCATTTACTTG
ATTTTAGAACAATAAATCGGAAGTGTCGTT
Right flanking sequence : From position 543313 (length
bp)
TCAAGTAGATTAAAGTAATGAACATCAGTATTGTTACGAAAGCTTAGAGAGAAAGAAAAATGCAAGCAAA
ATAAAGTTCCACTCGTCAAGAATGGAACTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp