Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_AP017305_7                                                                                                                 top


Strain : Fischerella sp. NIES-3754 GCF_001548455 RefSeq :NZ_AP017305 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_AP017305_7
DR consensus (37 bp) : ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACNumber of repetitions :111
Begin Position : 1158601 End Position : 1166673

1158601GTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACATTCCTCGCACGGGGGAAATAATTCCTCCCAAGAA1158672
1158673ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACAACCTGTGTCGCCAAAGTTGGTAGGCACAGTGCTGTCA1158747
1158748ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCTTTGCCTCCCAATCCGGCAATCGAAAAAGCCA1158817
1158818ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGATTTGATATTTGAATCTGTTGAAAAAGTCTTGTCTG1158891
1158892ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGCACGGAATATATTAGACTACTATGCAATTGGATTAA1158965
1158966ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCTAGTAGATGAAGACGTTAACACCTATCTTGTAGGT1159039
1159040ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACAAAAATCGTTGGCGAACCTGAGCTAGCGATTGAT1159110
1159111ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTGGACAGATTGTTTTATTACTAGCCTCCATTTTTGT1159184
1159185ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACAACGCCGAACTAATTAATCGTCTCTATGGTACAGCG1159257
1159258ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTAATTTTTTATTGCTGATTGTAGCTGTCACTATTAA1159330
1159331ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTATTGAATACCTAAACTATGATGTTTTTTATAAAGGT1159404
1159405ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGCAATTCGCCCTGCTTGAGCCTGGGCTAAATTTATT1159477
1159478ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCTGAATACGTCTAGCAAAAAATAGCTCTGGCTTTT1159549
1159550ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCTACGCGAATTACTCGCCCCAATTTACAAGAACCACGA1159624
1159625ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGTACCTTCCAGTTACCGTCCCGAAAGGGTTAAAAG1159696
1159697ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCGGAGTCAAGAGCCGAAGAATAGGGCTTACTTGGATT1159770
1159771ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGAAGCAAAGTAAAAGCCCCGCCTCCTCCCATGTTTCC1159844
1159845ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCAGAACTTTTTAATTCTTTTAAAAATAAAATTGTT1159917
1159918ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCTATTTTTGTTTGGGAGAAAGGATGGTACAAATA1159988
1159989ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTAGATAATGTCGCGAAAGGTGTGCAATCACGTTCT1160060
1160061ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCTCCCCATTTATAACCATTGGGGAAAGTTTGGAT1160131
1160132ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCGAGCTCAACATAAAATCAGCAAAGACATTGTT1160202
1160203ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGCACTCTATCAATTAAATTAATTCCTCTGTGGTCGTC1160276
1160277ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGCAGCACTCGCCAAAGCTGAAGCTTGATCTGCTC1160347
1160348ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGTTAATGGTAAGCCTTTAGTGTATGAAGAAACCGGGC1160421
1160422ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGGTTACAATTGCTTTCCCCTCATAGTAGGCTGTTT1160493
1160494ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCTGCGATGGGGATGAATTGAGTGGGGTGGAGT1160563
1160564ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCTACTGCCATAGCTACCTTACTGCGGAAATGCC1160633
1160634ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCGCTGTACACTTTGTAATCTTCCGGCTGTGACTTCAAAC1160709
1160710ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACACAAATACAACTGGAGAATTGATACACAGCGACTTCA1160783
1160784ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTAATTTAAGATTTTCTTCAGGTTTAGGTGAGCCGA1160856
1160857ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTCCTCAATGATGCGATGGTTGCCCAACGATTCA1160927
1160928ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGAATGGCAGTTAGGGTATAAACGCGAAAAGATTCGC1161000
1161001ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCTGAGGCATTAAATCTTAAGTTCAGAATATCTACTAG1161074
1161075ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGTCGTTGTGTCGATTGCTGTGCTGCGATTGCTAA1161145
1161146ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCCTTGCCAAACTCTTGAAAAGAATCGCCGTCAT1161215
1161216ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTAGAAACAGCAACAAAGTACTTAAAGTCAGTCGGAA1161289
1161290ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTACTGATAGGTATTGCACGTCTTCCAAAGACAGATC1161362
1161363ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCAATAGGTGATTCACCTTCTGCGATCGCCAATTC1161434
1161435ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTATTTGTTGCATTATTGCTTAAATCTGCAAGC1161503
1161504ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCATACGCGGCGCTGGGATGAGTTGAGGAAATTTAGA1161576
1161577ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGGGTGGAATCTTTCTTTGGAGGTCCAATGTGTGGTG1161649
1161650ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTCTAGGTGTAATCCCCCCCTTGGGTCAGATGTTCGAG1161724
1161725ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCATCCTGGGGATCTCCGCTCCCCTCCCCACGGGAAC1161798
1161799ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTGGATACCTTTTTCCAAGGCGGCGCGATATTCCTG1161871
1161872ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGGTGTAGGAAACGATTCAGCTTCTTATCGAAGTATATC1161946
1161947ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCTAATTCCTGAATTAGTTTTCTTAGCGCCATT1162016
1162017ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTTAATATATTCAAGAAATATTTCATCAGCAGGC1162087
1162088ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACACTAAATCCATCAAAATAGGCTGAAATCCTTATACAGT1162162
1162163ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACATCAATTTTTCTTTTTGCTCATTCAAAAGTGTGAT1162234
1162235ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCCAAAGTAAGTTATATCACCATTTTTGTAACTCCATAA1162309
1162310ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCAAATTGTTCCTCGTTAACGCTAAAAACCGTACCATT1162383
1162384ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCTGACAGCATTCCCTAAGATTCTTATCAACCTGG1162454
1162455ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGATCCAGAAGATCTGGATGCATTAATGGCCGATTTTG1162528
1162529ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCAAAGAGAAAATTCATCCAGTGGGGGTGCACCA1162599
1162600ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTTCCTTGAAGTACGGATAAAATGCGATCGCCTTTT1162672
1162673ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTGTTGAGTATTTGAAACGCTCACCCCATATGGATTGC1162746
1162747ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACAAATTTGATGGTGGTGTAGTCTCAGAGAAAAAATAA1162819
1162820ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCTACAAAAGAGGAAAATATCCACTTCGACATCGATTGCTACGTC1162901
1162902ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTAAAAAGGAGGGGAGAAAATGAGAAGAAGAAGAA1162973
1162974ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCCAATCGATGAAGGTGAGTACTCCGTGAGGTTGG1163045
1163046ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCCGACTACGACACATCGAACCAGTTAGATTCAAAGT1163118
1163119ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCCTCAATGGTATCTAATCTATTTCCGTAAAAATTTAA1163193
1163194ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACAATTAAGTGTTGAATATTTTTGGTGAATATAAATTGC1163267
1163268ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGCAAGTAGAAAATTCTTTGGGGGAGTATGCCCCCAAA1163341
1163342ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCGATAATAGATAATACTCCTTCAATCAATAAAAATTG1163416
1163417ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGTAATCATTACAGCGATACTCAACAACTCTCTCAAAATA1163492
1163493ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACATGTGTGGTGCCCCCTGAATGATTAAATTAGTTGTTTTTTATC1163572
1163573ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCCTCAAATCTGTAATGCAGAGATAGTTTTTTTAGGCAT1163647
1163648ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGCTTTCTTGCAGCAATCCATATGTTTCTGAAATTA1163719
1163720ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGATATGGTATTCCTTTGTATGCCGATTCTATTGAATC1163793
1163794ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACATTGTCAAAAATTGAATCGGGGAAAAAATCTAAAA1163865
1163866ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTGATGCCCCCCCACTGGGTGAAATTCCATTTCTAAAA1163940
1163941ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTTGAATCGGGTGTGAAAGTGGATATATATAGATGC1164013
1164014ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTAAATCTTGTATATATCTTCGGAAGCTATCAGGAGAT1164087
1164088ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCGCGGGGATCCTTGGGATCCCTGGGGCCGAAATTAT1164161
1164162ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTGTATTTGAGTTCTCAATCTACCCTGTTTTGGCTGA1164235
1164236ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCAAAAAATATGTTCTAGATCTATTAAATCTAGAAGATA1164310
1164311ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCTATACTACTCTTAACCGTATGGAGGCTAAGC1164380
1164381ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGATCAACGTGTAAGTTATGGCCAAATAATTGGAA1164451
1164452ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCCAACCAGTGGGTTTTGGTATCCTCAATGTCATAAT1164524
1164525ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGGCCGCCAATATCGGTCGCAGTCTCAGAATATACC1164596
1164597ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTCTGTTTTGCCATCCAAATTAATAGTTGGATAA1164667
1164668ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACAAAGAATATTATCTTCGGAAAGAGGAGGCACTCTT1164739
1164740ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGAGGCTAGATATCACTTTGTGAGAAGCCAATTAGG1164811
1164812ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCTGGTAAGACATTCTTTACAGAATGTCTTGCAA1164881
1164882ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCTATCAACTGCCCGGCCTGTTTTAAATGCAGCAGAAA1164955
1164956ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTGGGATAGGGTTTTATCCCTATCCTCTTTGGATTTTCGC1165032
1165033ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTAAGTGTTGAGTATTTTTGGTGAATATAAATTGC1165104
1165105ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCCCACTGGGTGGAATTCCATTTGAAGATTGATG1165174
1165175ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTTTTTTTCTTACCAGCTACATCAGAATATGTTGTG1165247
1165248ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCTACAAAAATACGTGTTTTCCCAGATTGAAAATCATC1165321
1165322ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGGGGCTTCTATAGGATGGAGATTATTTGGCCAAAA1165393
1165394ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACATGTGGATGGTAATTCATGTTTATCTACTCTAATA1165465
1165466ATTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGCTGAAAGTATTGCAATTAAAGGATTTTTTATTAT1165537
1165538TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGCAGTAAGAGTAATACCCACTCCTCCGGCTTTTATAG1165611
1165612TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACACGTAGAGGTCGATATAGATGGATATAAATATAAT1165683
1165684TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGCTGACCACAAATGGGATCAGGCCCCTTATGGAAGC1165756
1165757TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCAAGATTAATGCCAGTTTTTTCACGAATATATTG1165827
1165828TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGCGAGGATTATTAATAAGATAATAATATGTCTACAAT1165901
1165902TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTGTGCCAAAATACGATTATTTTGGGCTTATTGAGAA1165974
1165975TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACAATTCTGGTAAAATTTTGCCATACAAGCAATACAT1166046
1166047TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTTTTTTGACTAATTTTAAATTTTGTTAATAG1166115
1166116TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGAAAAGATTTATATAATTATCTACAATTAAATTTG1166187
1166188TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTTAATATCACCTGTGAGATTGCCTAAAGCGTCAATA1166260
1166261TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACGAGGATAATAGAAAATAGAAGGGAAAATTTCTATGA1166333
1166334TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACAACTGTTTGACACCATGTTGCTGGTCGTCCTCGTTGACA1166409
1166410TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCGGAATCATGGATTGTGGGTAAAGTTCGTCTACTTCATCCCA1166488
1166489TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACCAAAAATGCCTTTAAGTTGGGAATTTGGTTATGTGACG1166563
1166564TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAACTCAATAGGCTGTATTCCTTTTGGGATAAGCATTTTA1166636
1166637TTTTCAATCCCTAATAGGGATTAGTTTAAGTTGCAAC1166673
Left flanking sequence : Till position 1158601 (length bp)
GCTGTTTCATTGTAACGTTAAATATACTTCATCAAAATAATTAGCAACGCCGTTATTGTCTTTTCTAGCA
GTATTTGCAATACAAATGTTTAGGTTTATA
Right flanking sequence : From position 1166673 (length bp)
TGCTCAATTTAGAAGCCTTAATGTATTTACTTTTCAAGGTTCAGTTCCGTCAATCTCGATTCAATATAGC
TTTTGAGACATTAAAGTGTCAAGATGATGT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp