Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CM007646_2                                                                                                                 top


Strain : Mycobacterium tuberculosis GCF_001969035 RefSeq :NZ_CM007646 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CM007646_2
DR consensus (45 bp) : GGGGAGGGTGAAGCCGGTGAGGTTGATGGGGTCGATGGTCAGCGGNumber of repetitions :6
Begin Position : 1975047 End Position : 1975540

1975047GGGCGTGGTGAAGCCCCCCACGCCGATCGGCTCGATGGTGAGCGGTGGGGTGGTGATGGGTGGGGTGGTGATTTG1975121
1975122GGGGAGGGTGAAGCCGGTGAGGTTGATGGGGTCGATGGTCAGCGGTGGGGTGGTGATGGGTGGGGTGGTGATTT1975195
1975196GGGGAGGGTGAAGCCGGTGAGGTTGATGGGGTCGATGGTCAGCGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGGTGGGGTGGTGATTTG1975345
1975346GGGGAGGGTGAAGCCGGTGAGGTTGATGGGGTCGATGGTCAGCGGTGGGGTGGTGATGGGTGGGGTGGTGATTTG1975420
1975421GGGGAGGGTGAAGCCGGTGAGGTTGATGGGGTCGATGGTCAGCGGTGGGGTGGTGATGGGTGGGGTGGTGATTTG1975495
1975496CGGCAGGGTGAACCCGCCGACGCCGATCGAGTTGATGGTTAGCTC1975540
Left flanking sequence : Till position 1975047 (length bp)
ACGAAGGCGCGGTGCTCGAGTTGAAGTAGCCCGGCCCCCCGGGGATCGCGAAGGCCCCGATCGTGGTGCT
GGGCAGGTGGATGCCGGGAACGGTGAGCGG
Right flanking sequence : From position 1975540 (length bp)
CGGGGTGATGATTTCCTGGGTGGTGATCTGCGGCAGAGTGAAGCCGCCCACGCCGATCGGAGGGATCGCG
AACTCCGGGGTGGTGATAGCTGGGGTGGTG
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp