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CRISPRs details
NZ_CP002427_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP002427_3                                                                                                                 
top
Strain :
Lactobacillus helveticus H9 GCF_000525715
RefSeq :
NZ_CP002427 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP002427_3
DR consensus (30 bp) :
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
Number of repetitions :
27
Begin Position :
1423044
End Position :
1424790
1423044
AATTATTTTCCTCCTAAGTTAGATAAAATC
AGCATATTTAGTAAAGTTGGTGTAAAATTCGGCTTT
1423109
1423110
ATTTACATTTCCCTTAGATTAAATAAAGAC
CTACCAACTACTAAAACTTTTAGATTAAACTTTCAAAA
1423177
1423178
ATTCACATTTCTCTTAAATTAAATAAAAAC
TCACTCAAAAAGAGGTACTATAGATCATTCAAGTTT
1423243
1423244
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TGACAGTAACTCAAGCTACTAACTACGCCATTATTAT
1423310
1423311
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
ACTACGCATTACATGAACGACACAGACACTACTGC
1423375
1423376
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CTTATGCGAAAAGTATTACGATGTTTCCGACAAGTA
1423441
1423442
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
ACCAAGACACCCAACAGGTGTTTAAGTACATGAAAA
1423507
1423508
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
ATTACTATTGCAAGCTACTTACTAGCTATCATTGC
1423572
1423573
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
ACTAAGGCTCAAATTAAGCAAGCTAATTTGTTCCC
1423637
1423638
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TTTGTTGTCCAAGTAATCTGTCTTAATAAAATTTGT
1423703
1423704
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GACAGTACAAGCATGGGACGCAACGTTTAAATCTA
1423768
1423769
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GGTTGTAAGAGCAAACATTGAAGACATCCGTAACAG
1423834
1423835
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CACGATAGAATAGTTCGTTTTACTTTACGTGAGTTTA
1423901
1423902
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TCATTTACTGTCTTTAGCAGTTGCTCACGATATTCT
1423967
1423968
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
AATATCATTTTGATTAGTTACTATAGCTTCTTGACG
1424033
1424034
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
AAAGTGGTTTGCATCAAATCTGATGGAACGACATTAA
1424100
1424101
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CCAACGAGGCTACTACGAAACAGCACCGGCTTACCA
1424166
1424167
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TACTTTAGTATGCCCTAAAATATGCTGAACATCTTT
1424232
1424233
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CAAGCCACTCAAATGGCGGCTAAGCCTAAAGTTCAA
1424298
1424299
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CTCGCGGACGCATGCAAGGAGTCAAGGGAACTCCT
1424363
1424364
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CCAGTTAAACGATGTTTAACCGGAAGCTCGCATATAA
1424430
1424431
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
AATGTATCAGCAAGTAACCTTGATAAGCTATTCCAT
1424496
1424497
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TTGGCAACGCCAAAAGGCTATAGTACAGCTTTTCAA
1424562
1424563
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TGTTTGTTTTAATTCATCTGGAATCTTACCACCGTA
1424628
1424629
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TATAATCCAGATGCAACCGAACCAAGTTTTGACGGT
1424694
1424695
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CTGGTGCCAGCAACAATTGGTGTGCGTGTTGAATCA
1424760
1424761
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
1424790
Left flanking sequence : Till position 1423044 (length
bp)
TTTAATTGGTAGGATTTTAGTAGGATGTTTGATCGTAGTTTCCTTCCCGTAAATTAAATATAAATCTTTA
TGTTTTATATTTAATTGACTTTAATCACAC
Right flanking sequence : From position 1424790 (length
bp)
AGTTGCAACTACCAGTCCTACTGTATCAATAGATTCAACGGCCCTATCTGTCGACCTAACCAAAAACGCA
TCCAAAAATCACTAAAATCATTAGACAAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp