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CRISPRs details
NZ_CP004391_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP004391_3                                                                                                                 
top
Strain :
Pasteurella multocida subsp. multocida OH4807 GCF_000973525
RefSeq :
NZ_CP004391 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP004391_3
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
Number of repetitions :
23
Begin Position :
1640745
End Position :
1642092
1640745
TAACACTGCCATCTATACGATGGTTAAC
ATTGTGATCAGCTTGTGCCAGACGGATTCGGC
1640804
1640805
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
TAGAAAACGCCTAGATGATGCGACTTATCGTT
1640864
1640865
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
TCGAATAATGTCCCCACTGCTTGAAAAAATGA
1640924
1640925
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
GAAGAAGAAAATTTTGTTGTGATTCACGTTTG
1640984
1640985
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
TTTTGGGTTGCAGTAGGCAATTAAAAAAAAGG
1641044
1641045
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
GGTTTCGTGCGCGATTGGTATCAACAAGAATT
1641104
1641105
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
GGATTAAAGCGTTTGGTGAGATTACTAACGCT
1641164
1641165
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
GGCAAGCAAGTCGTATCATTGCAGTTGAATTG
1641224
1641225
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
CACCATTTCGCTTAAGGTAGCTGATTGATTCA
1641284
1641285
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
ATAGATTGCCAAACCTTACTCGTTTTAATGTT
1641344
1641345
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
GCAGCAAACGCGATCAGACAGATTGCGAGAAA
1641404
1641405
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
ACCTAAAGGATGTGCCGACTATCAGGCTGATA
1641464
1641465
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
TCGTATATATAGAAGGAAAAGATAACTATATG
1641524
1641525
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
TGAAACTCGATCAGAAACAGAAAACCGATGGC
1641584
1641585
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
AACTCAGGTACTGATTCAGCATTAGTCATGCA
1641644
1641645
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
TGGTTGATAACCGAAAGAGTAGTACCTTGGAA
1641704
1641705
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
TTGTAGTATTGATACCTGTTTCCGCTAAAGCA
1641764
1641765
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
GAGCAGATAAAATGAAAAGCGAACTACTAATT
1641824
1641825
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
ATCAAAATGTTGGAAATTACGCGGGAAGAATT
1641884
1641885
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
AGTAGATGATGACAAATATAAAACTTGAAATT
1641944
1641945
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
ACTTGAACATCTCCATTTTCATGACACAAGAA
1642004
1642005
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
TATAACAATCTGCCTCTTTGTCAATATAAAAA
1642064
1642065
TTTCTAAGCCATCTATACGATGGTTAAC
1642092
Left flanking sequence : Till position 1640745 (length
bp)
TTATTTATGACAAAAATAATCAATATCATCCAAGCTTCATTCAACTCACAAGCGCGTTTTATTTAAAGTA
TTGATAAGACAAGATCGTCTCTCAACTTAA
Right flanking sequence : From position 1642092 (length
bp)
TATATAACATAATCAAAATCAGTTTATTCTTCAATTTGTTAAAGAACATATACAAGAAAACCCCTTTTCT
CTAAGACATTTATAACCCTTTGATCTTATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp