CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP004392_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP004392_4                                                                                                                 
top
Strain :
Pasteurella multocida OH1905 GCF_000973565
RefSeq :
NZ_CP004392 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP004392_4
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
Number of repetitions :
44
Begin Position :
1081980
End Position :
1084588
1081980
AATTGAAACTGCCTATACGGCAGTTAAC
CGAGTTTTGCCAACAGTTTTCGCAAAATTTCA
1082039
1082040
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GCATGAATCCACTCGGTTATCTAAGAGCAATA
1082099
1082100
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
AATGCGGTGAGCACGTTACCGACAAATGAACA
1082159
1082160
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
TTGCTAAAATGCCACGGTCTAGCTAGACAAGT
1082219
1082220
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTTAAC
GCAAGTGCCAGTGCGGCGTGCCGTCGTGGTGT
1082279
1082280
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TTGGGTATATTCAGGCGGTCGTAAGCTCAAAG
1082339
1082340
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
AACACCGTCCACAATTTCACCACTTCTAAAAT
1082399
1082400
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
ATGATAATGGTGAAAATTGTCATATTGTTGTT
1082459
1082460
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TGTTCAGCGCCAGTAATTGACTGATGGACCGT
1082519
1082520
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
CAAATTATGTTACAATTCACGCGCGGTAAAAT
1082579
1082580
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
AAAACTTGACCTTTTACGCTAAAATCATAGCC
1082639
1082640
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TCAATGAACGGTCCGGCAGTGATTGACGCACT
1082699
1082700
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TCCCGCACTTGATCCGCCACATCCTGCGGAAT
1082759
1082760
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
ACCAAGTGCGCACTTCTTCAACCGTTGGCAAT
1082819
1082820
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TCGCCTTTCGCTCGGCTTTAATCCATTATAAA
1082879
1082880
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
GCGAGAAAAATTTATTCTTCTGGGTTTAGCGT
1082939
1082940
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
GGTTAGATATACGCCAAGCAGCCAAATAATAA
1082999
1083000
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
GTAAAACTTTTGTTAAAAAAGCAATTAAAACA
1083059
1083060
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
AAACGCTCCACTTTTATCTGAAATGGAATAGGT
1083120
1083121
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TTGTGTCAATATCTTCTTTTAAAATTTCCGTT
1083180
1083181
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
GTGCAAAGTCAGACTTATGCAATTTCGGCACG
1083240
1083241
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
ATGCTTATTTTGAAGTGGTGCGCAATGCGTTT
1083300
1083301
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
GAAATACATCGCTTAATTGCAACAGATGAAGA
1083360
1083361
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
CAAGTAAGCCTTAGTCCTGCGCTGTCCATCGT
1083420
1083421
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TTGAACATCCAAAAATTGTTGAATATCCAAAA
1083480
1083481
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
AAGCCGAAAACTTTAGAGGGATTGTATTTAAC
1083540
1083541
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
ATATGTCAATTACTGCATATGTGGGCATTCCC
1083600
1083601
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
GGAACTGCCCTGTTAAATCTTTTACACGAACA
1083660
1083661
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
AAACACGCTGATTGAGTTCAACATCATCAAGC
1083720
1083721
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
AAATCCGTCGCTCGGATTTTTTTCCGACTGTC
1083780
1083781
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TCCGCAGATTAAGGCAATGATTAAAGAATTTT
1083840
1083841
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TTGCAAGACTAACAGGCAAAACAAAAGAAATT
1083900
1083901
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
CGCCTGATTTAGAACTGGACGATTTAGAAAAT
1083960
1083961
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
CGGTCCGGCAGTGATTGACGCGCTAGTGTCAT
1084020
1084021
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TTAAATCATTTGAACACTGCACGAGCTAAGCT
1084080
1084081
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
ACATTGATTGGCTAGCAATAGAACAGGATTTT
1084140
1084141
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TATAACATTGACACTCTTTGCACACTTTAACT
1084200
1084201
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
GTAGCGGCATTTCACCGTTTGAGTTTGTAAAA
1084260
1084261
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
CCCATAAAACGATTTTCTAAACTTAGGTGGTG
1084320
1084321
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TGAAAAAATGGACAGCGAAAGTCTCAATGAAC
1084380
1084381
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
GAATACCACTTAGATAAAAGAGATTGCTTGGT
1084440
1084441
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
TTGGTGACAATTATAGTCAGAGAACATCAAAA
1084500
1084501
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
ATACATCTGACAGCCACGTTATTGAACCGATT
1084560
1084561
TTTCTAAGCTGCCTACACGGCAGTTAAC
1084588
Left flanking sequence : Till position 1081980 (length
bp)
TGAAATTTTCCAAAAATTGACCGCACTTTTATCGTTAAACACGATATAAGCTAACAGACCGATCCCCATA
TCCAACTGTTTTAGTAATATACCAACAGTC
Right flanking sequence : From position 1084588 (length
bp)
AAAACAGTCTAATCGACATCCCTTTATTCAGCAAGTATGGCGCCGATCAAACTGTTAAAAACCCTTTTTC
TAGACATAGAAATAACCCTTTGATCTTATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp