CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP006577_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP006577_3                                                                                                                 
top
Strain :
Archaeoglobus fulgidus DSM 8774 GCF_000734035
RefSeq :
NZ_CP006577 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP006577_3
DR consensus (24 bp) :
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
Number of repetitions :
50
Begin Position :
539158
End Position :
542309
539158
TGGGAGTCTATCCTTATGAGATTC
CGTGGATGAGGAAGTGGAGGTTTTTGAGGATGTGCACCTGCTGA
539225
539226
ATTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
GAATGTGCCTGAGTTTAGGGAGTTCTGGATTGAGAGGTTTGG
539291
539292
GTTGCCGTTCTCCTTGTGAGATTC
AAGGTTTTCAGCTCTCACTACGGCAAGGGTGGCAACTACGG
539356
539357
GTTGCCGTTCTCCTTGTGAGATTC
AAGGTTTTCAGCTCTCACTACGGCAAGGGTGGCAACTACGG
539421
539422
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TTACTTTGACTCCTGACGAGGGTGAAGCGCTGAGAATTA
539484
539485
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
AAACTGATAGAGGAGCATCCGGAGCTAGGATACTCCTC
539546
539547
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
CGGAGCAACTAATGAAGGCATAGATGACTGCGAGGATATATT
539612
539613
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
AAAAAAATGAGGAAATACTTAGCAGGGCGTTTGGTAA
539673
539674
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
CGGGCAGTATAGAATTCCTGCCGAGGAGGTCAAGAGAATCT
539738
539739
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
ATTGGTATTTAGTAGCCTTTGAATCAGCAGGCTATTAC
539800
539801
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TGCATGGAGAAGATGGTTGAATTGAGTAACTACGAGCTGGGCTACTA
539871
539872
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
GAGGTGGGACGAATGGACTATGACAGAATAGTTATTA
539932
539933
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
GGAGAGGGTGCAGAGTTTGAAGTATAAGCTTAGGAAGACTAATC
540000
540001
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TTAAAGAAGCGAGACTTGAGGCGAAGGAGAAGTTCCTT
540062
540063
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
AAGCACGAGTTTGAAGCTTTGGTGGGGGAGGAAATTACTGA
540127
540128
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
GATTCTTGAAGACTTTGGTGATGAGGTTATAGTAACAACTAT
540193
540194
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
GAAGGTGAAAATGGAAGATGCAGTGAGAGATGCTATGATTG
540258
540259
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
ATGAGAAGTTGAAGAAGGTGATAGGATGAGGGCGAAGATAA
540323
540324
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TTGTCTGGATAAGCCGACACGAGCTAACCAAGGAGAATTATG
540389
540390
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
CAACAATGAAAAAGATGGATTTACAGTGTGCTGGCAGCTGA
540454
540455
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
GTAAAAGTGTTATTTACGTTGATCCTGAGTGGGGTTGTC
540517
540518
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
GTCATTTTTTGGCGTTTGTGAGAGTGCCTGTACTTG
540577
540578
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TGGTTGAATGGGTAAAGAATACTGTAACAGCAGAAGATT
540640
540641
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
AAATGGTAGGTGATAAAATGGAAGATGGAGTCCTAAAACA
540704
540705
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TGGTAAGTGGTTGGAACACCGAGAGATTACGGGATGATACAAC
540771
540772
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TATATGATGACCGAGTGAGAACTGAGGCAGATAAAATC
540833
540834
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TTATTAATATGGTGTATGTTTACCACCCACGAAATTTTA
540896
540897
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TATCAAGAGAGTGCGGATTAACGGGCGGTATTTCTATC
540958
540959
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
CAAGCAACGAGTACAGCGTAGCAACGACCCCATTTGG
541019
541020
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
GTGGAGATACCATTTCAGAATATTTAACCACGAATTTG
541081
541082
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
GGTAAAGATGGCATTCCAGAGCGGTGCAACAACCCCATCG
541145
541146
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TAGTCGTGGACGTCGGAGGAAAACTTGAGCCAGAAAA
541206
541207
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
CAGAATGGAGAAGTCCTAGTGTGGAAGGAGGACACATGG
541269
541270
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
GCAGTAGTGTCCGTAGGTGTAATATGACCAGTTCTCAGCATAT
541336
541337
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
CTCAGAGAGAAGCTTAAGGGATTCTATGAGGACTACAAGTA
541401
541402
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TTTGAGAGGGGTAGAATAGTTATCGAGCACAAAAACAGC
541464
541465
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
CGAAAATCTACAGGCAAAGCGGTTCACTTGCATTGATAATTC
541530
541531
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TATGGTATACATGTACCACCCAAGAGATTTCTCGAAAAA
541593
541594
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TGAAACAAACGAAATGGTGTACTTTGCAGACTATCTA
541654
541655
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
CACATGCCATACAACTACCTCCTCGAGATACTGAA
541713
541714
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TAAGAAATTTGAAAATGCTGATGCGGATGAGGAATGCATC
541777
541778
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TGCAGAGGTTGGTGGAATTCCCATTGTTAAGACGGTGTTTAA
541843
541844
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
CTGTGCAGATTGCCGTCCCGGAGGATAAGCTGTACCGTAA
541907
541908
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TGTTAGAGATGTCCTCGAGGGCATTGGTGGGCCAACTAC
541970
541971
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
ATAAGATGAGTGGGGTAGTTGGGTTGAACCAGTTTGGTGT
542034
542035
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
GTGTAATTAGAAGTGAGCCTGTAATAGCCTACTGGAAAA
542097
542098
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
ACTTAATAAGAGATTGAGGAAACAGGTGCTTGAGGAAA
542159
542160
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
CGAAGGCAGCTACTTTCCAGATACGGACGTGAACACAGC
542222
542223
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
TGAGGATTGGAGCAGGGCAACAGTTGGGCAGATAACGGA
542285
542286
GTTGCCGTTCTCCTTATGAGATTC
542309
Left flanking sequence : Till position 539158 (length
bp)
TGTTATTATATAGCATTTGAGAAGGAGAAAGTTGTAATTTACAATGCACTTTTCTGGAGTTCTTGATTTT
TGATCTGGGTTGCTAGATACTGGAATTGGA
Right flanking sequence : From position 542309 (length
bp)
CCCATACTCAAATCTCTCAAATCCACCTTAATATCCTTTTTCCTTGCTGCTTTTTTCACAGGTCACTGGT
TGCAGCACATCTGAACGCTGAGTATATAAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp