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CRISPRs details
NZ_CP006905_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP006905_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium baratii str. Sullivan GCF_000789395
RefSeq :
NZ_CP006905 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP006905_2
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
Number of repetitions :
27
Begin Position :
2322725
End Position :
2324465
2322725
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
AATTTTGAGAAGAAGCCTATACCTTGATTTGCTGCAAA
2322791
2322792
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
AAAAGTTTTAGATTTACTTAATGGTATAAATTCAAAGCG
2322859
2322860
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
AAAGTTAAAGAAAAGGCTACAAGACAATTTACAGTTA
2322925
2322926
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
GGGTTAGAAAAAACAAATCTAATCCTGGCATCTTTA
2322990
2322991
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
TTATGGATAGCACAGTATGGATCAAGTACGGTAATG
2323055
2323056
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
GGGGGAGACAGATGTCCCCCACCCAAGGACATATAAT
2323121
2323122
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
TAATCCATCTAAGACCTATTTGATATAAATAATAAA
2323186
2323187
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
GGTGAAATTACGATTGATTATCTTAGTTTAGGCAATC
2323252
2323253
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
CAAAGTCGTAAATTTGGATGCAAGTTTATTTTCAGTAC
2323319
2323320
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
AAAAAAGTTAATTGTTCTTGAATATCTTTTACTGATAA
2323386
2323387
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
ATCTAAGGAGCTAACAATGTTAGTCATGTCTTCCGC
2323451
2323452
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
AGGATTTTATTATGTCAATTGTTAAGGGTACTGTAGC
2323517
2323518
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
TTAAATCTTATCACTTGTCCTGTAGGCTTATAGGTA
2323582
2323583
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
AAATATCAATGCGGAGATCAATTAGTTGTTTATGATGG
2323649
2323650
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
AAACCACCAAATTTACAAAGAGATAATCTTATTTGG
2323714
2323715
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
TATGCTAAATCTGCATTTACATCACAATTACCAGGTG
2323780
2323781
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
CTATATAATGAACTTATTATACCTTCATAGAAAGAAT
2323846
2323847
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
GTAAATCAATTCAAAACAACTCTTTCTTTAAAGCATT
2323912
2323913
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
GTTATACCGCCCGTTTGGATATTTTCACTTGATAG
2323976
2323977
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
ACATACTATAATTTTCTATCTGAAAAATATGACAAAA
2324042
2324043
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
CTGCTATAGTGTCAAACCTTGTTAGGTCTATGGTAA
2324107
2324108
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TACTTAACCCTAAAAACATTAGAAAAAGCTTATGTG
2324172
2324173
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
TCGAAACTACCTTGTCCTACAAAATATCTTTTCCTAG
2324238
2324239
GTTTTATATTAACTATGTGGAATGTAAAT
AAAGGAGAAAAAGGCGAAGATGGAAAACAAGGCGAAA
2324304
2324305
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAT
TTTCAAAGCATGATTGTAATGTCTTAGGTATGAATTG
2324370
2324371
GTTTTATATTAACTATGAGAAATGTAAAT
GGTATTAATTAGTTATTTGGGAAATGACTCCTTTAGA
2324436
2324437
GTTTTATATTAACTATGAGGAATGTAAAC
2324465
Left flanking sequence : Till position 2322725 (length
bp)
AAAATAAGACTGAAGGTTTACTGCATTTGCTGGGATTATTTTTAGAAAAAATAGTCTATAAATGGCTTAA
AATGGTCAAAAAGAGCTTATTAATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 2324465 (length
bp)
AATGAGAAAATACTGATATTAAATTTTTATTTAGTATCAGTATTTTTGTTGTTTCAAATTGGGATAAAAA
AATAAATGTTCAAAATATAGTCAATTAAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp