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CRISPRs details
NZ_CP006909_2
Flanking alignement tool
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NZ_CP006909_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium botulinum CDC_1436 GCF_000817935
RefSeq :
NZ_CP006909 (plasmid pCBG circula)
CRISPR id :
NZ_CP006909_2
DR consensus (29 bp) :
TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAAC
Number of repetitions :
13
Begin Position :
154922
End Position :
155742
154922
TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAAC
TTGTTTTTTATAGAATTTAGCATTACAAAAACCTCCG
154987
154988
TTTAAATACACCTAATGTAAAAGTTAAAC
TTTATTTGTTTTTATTGTTACTATTAACACG
155047
155048
TTTAAATACATGTAATGTAAAAGTTAAAC
TTCCCCTTTTCAGATTATAAATTTAATGTTTCG
155109
155110
TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAAC
CATCCAAAACTCTTCTCTTTTTTTGCAATTGTTCTCTG
155176
155177
TTTAAATACATATAATGTATAAGTTAAAT
TCAGTGTTGTAGCTAACTTTATAATAGTAGTTATGG
155241
155242
TTTAAATACATCTAATGTACAAGTTAAAC
AAATCATCTATTTTATATTGGTAATATATTTACTATAAATCGGTAG
155316
155317
TTTAAATATATCTAATATATAAGTTAAAC
CCAATTTACTCCATTTTTCATATTTCAAATATGCGTG
155382
155383
TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAAC
GTATCTTATTTTTAGGTAAAACCTCTCTTAAATTCTTG
155449
155450
TTTAAATACATATAATGTAGAAGTTAAAC
TTTTCTATTCTGCACCTCTCTTATAAAAAAAGAACCC
155515
155516
TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAAC
TTATATCTATGCATTTGCAAAACCTCCATTTCCTGTTG
155582
155583
TTTAAATACATATAATATATAAGTTAAAC
TATTCCTTTTTATTTCTTTTTATAAAAATTATTATG
155647
155648
TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAAC
TATTTAATTCTTTAATTACCTTTTTCTGTTCTTTACA
155713
155714
TTTAAATACATCTAATGTAGAAGTTAAAC
155742
Left flanking sequence : Till position 154922 (length
bp)
AACAAAGATAAAAAACAATTGTAAGTATTATTAATTTTAAATACATATAATGTAAAAGTTGAACATAAAA
ACTGAAAGATTTTTAATATTCCTAAACATG
Right flanking sequence : From position 155742 (length
bp)
CAATGAAAATAAGCTATTTGTAAATAATAAAATGTTTATATAATTATTATAACATGCTTTCATTATATGA
CTTTTAAATTTCTAAAAGAAATATAAATTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp