Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP006933_3                                                                                                                 top


Strain : Methanobacterium formicicum BRM9 GCF_000762265 RefSeq :NZ_CP006933 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP006933_3
DR consensus (31 bp) : GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACNumber of repetitions :142
Begin Position : 1941348 End Position : 1950804

1941348GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATGATTTTGAACGTGAAAAAGAAATAATCAAAAATGAA1941414
1941415GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATTCCGGGCTGGTTACATATAGGGTGCATAGCTCTTT1941480
1941481GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATAATTTTCTTTTTCATTAAATATATAATACACCCCCCA1941548
1941549GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAAAGTCAGACTTGGCAGAAAATCAACCCGCTTAACTGG1941615
1941616GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCAGGGTGCAGTAGTAGAACGGAATGTATTTGATAGT1941682
1941683GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTCAGCAAGACCTTTAAGGAGCCCTGTCATGATTTCC1941750
1941751GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTCTTGAGGGCTGATTTTAACTAAATCGTCTTTAATT1941817
1941818GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGCGAAAAACTCCTAGGCACATTCACCACTTTCACAG1941884
1941885GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGTCTGGATATATAGGCCCCATTTTGCTTAGTCCACT1941951
1941952GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTTAATGGGTTATAATCAACGTTTATGGTATTTA1942016
1942017GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCGCTAAGGAGAGTAGATACAAATGAAGAGTAATGTAT1942084
1942085GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTAAACTTTTTTTCTCTCTTTTTCTTTGTTTAATTTAT1942152
1942153GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTGTTCCGGGGTATTGACTCCAATTGGAGGTAGTCA1942218
1942219GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACAATAAATCATATATTAAAGAGTGTTGGTCTGGATTT1942285
1942286GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTAATTATATTAAAATATTAAAATATTTTTATAGA1942351
1942352AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACATGTATGGGAAACACCACAAAGCAAAATCAAAAG1942416
1942417AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACACGTTTAAGGGAAAATGGACGGATGAGGAAACACGA1942483
1942484GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACACACTCCCGGTGATATATCCTTTTAGACTGGTGGTC1942550
1942551GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCAGTTAAAATCACTGATGATGATGTCTGGCAGAAAA1942617
1942618GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTCGATAAAGCGGAAATTTATCTTTACGGTAAAAAAT1942684
1942685GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTGTTTCGGGTTCAAGGACTCGGAACTGGTCCAGGCT1942751
1942752GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGAACATCCATGTTCTCATTGATCAAGTCTTCGACGT1942818
1942819GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTGACTTATTGGTGATTCTGCCTTCATAAATCCTTCA1942885
1942886GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACAAAAGGGGGAAAATAAAAAATGGCATCTGAAATAG1942951
1942952GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGAAGAAAAAACAACCTCACACCATGAATGTGGTTAAA1943019
1943020GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTACCTGGCCTTCATGCTCCCACCGGGTGAGCCAAG1943086
1943087GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTACACTATGATAATTATCTACATATTGGTTTCTA1943151
1943152GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGTTGTATAGTGTGGTTTTGGTGTTGGTATTCATAC1943217
1943218CGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCACCGTGGGCATTTAATTGAGTTTTCTTTTAGATAT1943284
1943285GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTTAATTCAGATTGTAAGGATGCTGCTTTTGATTTAG1943352
1943353GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTTTCAAAAATCCAAGTGTAAACGTCATACTGTAAT1943419
1943420GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTACCAAATCACCTCCTTATGGGGTTGCAGATACTA1943485
1943486GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCATGGCTACATGTACCTCTATAATGGAAACCTGGGC1943552
1943553GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGAGGTAACTGTAATTCTCCAGATTTGAGTTTAACAG1943619
1943620GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCCGACAAAGCCGGTACCGGTTGGATTGGAGTGAAA1943685
1943686GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCCTACACTGAAGTCGTTGGTAAACCTGCTATGCTCA1943752
1943753GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTTAACTAGTTGGTGGTATTTTATGACTGAGATGA1943818
1943819GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCAGCTTTTCCCTTTAGGTGTCTTGATGACTTCCAT1943884
1943885GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTAAAAGATGGGGATTACTACAACACGCTACGGTTTAC1943952
1943953GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGCTTCAGTATGTTTATGAAGTTTTAGACTTCATTAA1944019
1944020GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTGGTGCTTTGACGTGTGCTAGTTCGTGGAGTTCTG1944085
1944086GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTGAAGAATTGAATAAATTCGAAAAAATGGATGGAC1944152
1944153GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTCGAGAAATTATCTGTTGATATCAAGGACAGTCAC1944218
1944219GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACATCAATAAGAAGAATATCCTGGAAACCAGTGCCGA1944284
1944285GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGAACATATGTCATGGCAACAATACGCAGTATTCCTC1944351
1944352GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACATTAGACATTACTTTCCCCGGGAGAGAGGGGCCC1944416
1944417TGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACAAACTGTGCATTGTCATCTTTAGATTTAAGGTTTA1944482
1944483GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGCAACAGTGCATTAACATGTTCACGGGCCCTTTTAG1944549
1944550GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCCATACCCTCCAAAGATGCTCACATCCCTAAAAGAA1944616
1944617GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCTTTGATTTTGCTTTCAGATATATTACCATACCTC1944682
1944683GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCAAGATTTGCACCTCTAAGGTTTGCACCCTCAAGAT1944749
1944750GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACATAATTTTTTCTGTTCTAATGATTTGTTGTATCTAT1944816
1944817GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACATGAGATTCTTTTCTAAACCCATTTTTTTAAAATAA1944883
1944884GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTACAAATTGCAGACCGCTTTGCAGACCGCTATGG1944949
1944950GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCTGAATGGTGATGCGGCCACATCTTTAAGGGTTTTA1945016
1945017GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACATATTAGCAGGCGATAAAATGAATAAATGGATTAAC1945083
1945084GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTATATTAGGGTCTATGAGGTAGTCAGGTCTATCCC1945149
1945150GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGAAGTCTTTAATTCTCCGGATTATGTCATGGAAGGT1945216
1945217GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTCACTGAAGCAGCTATGTTCCGTAGGGCGCAGACTG1945283
1945284GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGCAGATATAAATGATACATCTTTTGGGTTTATATTT1945350
1945351GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGTGCTTCTTGCCAATCATTCAAATGGTCATGTAA1945415
1945416GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTGAAGAAAAGATTAAAGTATCTGGTGAACAGGCAG1945482
1945483GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTAGGTGTATACGAATCCCTGGGTATTCTCTTTGAA1945548
1945549GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCCTCTTTTGAATTTAACGCATCTAATACTTTCTTAGC1945616
1945617GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTAGTAAATTTCAGCTACGAAATGAGCTTGACGGACT1945683
1945684GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACATACGAAAGGCGAATAAACGCCCAGTCAGGTTCTATT1945751
1945752GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACAATTCATTACAATCTAGATCATATCCTTTTTCCT1945816
1945817GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACAGATTTATTATTAAAAGAATATGATAATTCATATTT1945883
1945884GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTACAATATCATGGGGCGGACCCGGCGAACATATAGA1945950
1945951GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGTGTATATTTAGTATAATCGTATTCTACAGTAATA1946016
1946017TGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACACTTATACATACGTACTGTAGATGGTGAGATATTTC1946083
1946084GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTAATTTCATCAACTCTCTCATGTAAAGTCATTATAC1946150
1946151GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACACGGAGAATATATAAAACAACTAAAAGACCCCCAG1946216
1946217GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCATAAAAGACAATAAACCTTCTAAGGTTTCCAATTC1946283
1946284GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACATTGTTGCTATTGCTTCCGGTGTGGTTTCATAGTCT1946350
1946351GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTCAGCAACAGTACCTGCTTCAACAGCATCGATACGA1946417
1946418GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCCAGCCACGCTCTGAAGAATTTCATCCAGGGTAATA1946484
1946485GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTGGAGCTGAAGGGGTTTGTCTTGGTCGGACAGAGAT1946551
1946552GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTACCATCCAGGGAGGAATGGAAGGACCCTAACCTTA1946618
1946619GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACAGTAATCTAATAAAGGATTCATGCTTTTAGAAGCTG1946685
1946686GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACACCTCTAGACAATTTATGTGATGGCAGTGAGGACA1946751
1946752GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGGAAATGATAGAATCTGTGATTAGTCAGCTAGTTTT1946818
1946819GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCAGAATTGGTTAGGGGTGGGTGGCTGTCGAGGTAGA1946885
1946886GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCCTTTTTAGTCTCAGTGTTTTATATCTTTTTCTTAT1946952
1946953GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGGGGTTGTCATTCTTTTGTGGCTTTTTTGCTTTGT1947018
1947019CGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACATTAATCAGATGTGAAACTGGTAAATTTATGGTCT1947084
1947085TGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTCTTAAAAGTAATTTCAATGGGGAAACTATAAAGTT1947151
1947152GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGGAATTGTAAAGTATCACGGTCTAACTTGTAACCGTC1947219
1947220GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGACGATGAATGTGTTGACGTGAAATGTGACTGTGGA1947286
1947287GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGGTACAGTTGAACATTGAAGTTACCATGTACCGGGC1947353
1947354GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACAACTTAAGGGGGGGATATGATGGAAAATGAACAAGC1947420
1947421GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGAAGTAATGCAACCAAAAGAAATACTTAGAATCACA1947487
1947488GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTGGTGTGTCCGAAGGCCACACTGTTCTGGCAGTAG1947553
1947554GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGAAAATCTCCGAGGACACATACGTCCGGAAGAGCA1947619
1947620GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGTTTAGGACTACTGGTGAGTTTCGTATTTCTTTGAC1947686
1947687GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGCAGAATGAACAGTAAAAGAGACTTGTTTAAACGG1947752
1947753GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGTGTCTTCAGAGTCGTAGAGGTACGCCTCCCTTCGG1947819
1947820GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTTGATGTTGCTTCTACAACATCACTTACATTGTTA1947886
1947887GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGGACTAACTACAGGTTTAATTTTAGTTGCAGCGGG1947952
1947953GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTAACACAACATGCGAACTGCTATGCACTCGAACCAG1948019
1948020GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACACTTCTCCCAGGTCATGGGTGTTTAATGTGGGACTAT1948087
1948088GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTGATAAAAATTATCAGATAAGGAGGCCCTAAACAA1948153
1948154GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATTAATTTTGGCTTGAAATGCTTTGTTCGGTTAGAGTA1948220
1948221GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATATTGGTAGGTGTCTTTATATTGGGCATTAATGCAGT1948287
1948288GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATGTCATGATCAGCTCTACAATGCTATGAGAAAATTAG1948354
1948355GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATCTAGTGGATCCATCGACAGTTTTTAGTTTCGTGAGA1948421
1948422GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATTATTCAAGAACTCATTAGGATCACTGGCCTTCTCAG1948488
1948489GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATTGAGATCCAACATGATGGATTAATCACTAAGGATGG1948555
1948556GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATTAAAAAAGGCATGGCAACACTCAAACAGGATATAGA1948622
1948623GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATTTGCCTTCACAGTTATGATTAGTGCATATTAGTTCA1948689
1948690GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATGAGAAGAATTCTAAAGAGGTATTGAAAGGTATTCTT1948756
1948757GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATTGAGTTGTTTCTTTAATTTGCGTTTTTCTTTGAATA1948823
1948824GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATTCATGTAAGTGAAACTTGTGAATTTGGACCCCTTAAT1948891
1948892GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATTTATGTTCACAGTTAAGATTGGTGCAAATTAGTTCA1948958
1948959GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAATTAGGTTTTGACCTTAAAACAGATAACGAGTTGATTA1949025
1949026GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTACTGGTTCTACCTACTGTGGTGAAGAATGCAGAGA1949092
1949093GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGATGTTGAAAACATAATCCATGAAGCTGTTCCAG1949157
1949158GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCAACAATGTTTATAATTTTATTTGTAGTGACCATAG1949224
1949225GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGTGAATGCACCCTTAACATTTTAGCGGGTAAACGGT1949291
1949292GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTTAAAGGGATCGTGCGGGGTGATTCTTCTATTTTC1949358
1949359GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTGGATTTGAAGTGGAAGTAATCGCCGGTTCCAATT1949425
1949426TGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACAAAAGGGTGAATTTGGGAAGATTACCTCCTTTAAGGAA1949494
1949495GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACAAATTCAAATTCTCAAAATTAGAAATCTTAAAATC1949560
1949561GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACACTATTTTTTACCCTTTTATTCTTTTTTTTTATTAT1949627
1949628GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCGGTATTGGATGACCTTTTCAAGGATGTTCCAATAG1949694
1949695GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGCAGAATTAAAGGAGATTGAAAGGGAGGTGTTCATG1949761
1949762GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACATATTTTTAATTGGGTATGTTCCCCACTTTTTTTT1949827
1949828GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTTCTACATTAATCCGATATTTTGAGGACAACGATAT1949894
1949895GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGAAGCAATGCTCATGAGAGTAGACAGCAGCTTCAACG1949962
1949963GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACAGTGCTGGTTCTGATATTAGTATGCAAGATGTTTTTT1950030
1950031GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACACAAAATAAAAAAAAACTATAATAGTCCCACATTAA1950097
1950098AGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGAAATGGCATATGATGGTTACATCTGGTGGTAGAAC1950164
1950165GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACAACTTACCCGTTTCATCTAGGCCCTTCATGACTCCT1950231
1950232GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGTTCCGAGTCAAAAACAGTTTTAGACATCTTTATCA1950298
1950299GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACATTGTTAGTTTAAAAAATTAAAAAAGGTTGATTTTT1950365
1950366GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACCAAATTTACAGGAACGCTTCTACGTACGCAAGAAAA1950432
1950433GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTAAAATCAAACAAAATACCTGCAACCAGTTTAACAG1950499
1950500GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACATCAATCAGATTAAAGTAATTATTCATAGATTTGATTGCGG1950571
1950572GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACGAAGATAAGCGAAGCTAAGGGTATCTTGAAATCTGT1950638
1950639GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACATAGGAAAGAAAAACCATGTTTTCGTGGAGGGCTGG1950705
1950706GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAACTAATCTTTGAAATTTCAATAGGCATCCCCTCTTGAT1950772
1950773GGCTAAAATCAGACTATTTTAGGATTGAAAC1950803
Left flanking sequence : Till position 1941348 (length bp)
ACCATATAAAGGAAACCCCTAATTAAACACCGACAATTTAAGTACCATGAAAGAGTAAAGAATAGGATGA
ATTAGGCCAAATAGACGAAATTTCGTGCCT
Right flanking sequence : From position 1950804 (length bp)
AAAGGAATGTTTCCAGTGCAAAGGCCCCATTAGTAGGCTAAAATCTGTTAAGGGTCATTAAAATGCCTGT
GAAAAACTCATGTGCAAAGGCCCCATTAGT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp