Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP007035_1                                                                                                                 top


Strain : Niabella soli DSM 19437 GCF_000243115 RefSeq :NZ_CP007035 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP007035_1
DR consensus (47 bp) : GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACNumber of repetitions :37
Begin Position : 309047 End Position : 311934

309047GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACATCAAATACCTGGTCAACTACTTTTCTTA309122
309123GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACAAAGCCTAAAGGCATAAAAATCCAGCGGAA309199
309200GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACAATAAGACATAGCGGCCAAAAAGCGCCATGA309277
309278GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACGCACCTGTTGCACCCGATGCGTTGTACCGC309354
309355GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACGGTAGGATTCTCTTTGCCCCATGTTCTTA309430
309431GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACTATTTTTGATGTAAATATTTACAGAAACAA309507
309508GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACTTCCACCATCGATTAATCCCACCTGCCTAT309584
309585GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACAGCCAGTAGTGTTTTGCCACTCGGTATAGT309661
309662GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACTCAGGACCCGGCGGTCAGCCCGCGATGGCA309738
309739GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACGCCCCGAATGCGGGTCCATTGAGGAGGCTG309815
309816GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACCCCAACAGCATGGAACCGATGGATTAAAC309891
309892GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACCCGGAGACCGAAGGTATGGCCTTTCCTTG309967
309968GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACCGGTGGTGCCGGTCTTATTGGTGGTACCAT310044
310045GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACTTCTCAGCCTTGGCTTCCCGGATTTCCTTT310121
310122GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACGGTTGACATGGCTAAGTGTTTGACTCCTTT310198
310199GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACCACAGAGTATAAATCTGTTCCTTCGAGTAC310275
310276GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACTTTATTAGTTCGTTATCGTCAATTTTGTT310351
310352GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACTACTGAGTATAAGTCTGTTCCTTCAAGTAC310428
310429GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACGTGCTGCATAGCTGGCCGGGTTACCCATC310504
310505GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACGCAGCCTTCGGAATCATGAACGGGTTAAC310580
310581GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACGCCGCCGCCCGCCGGACCACTTCATTCGGT310657
310658GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACAGAGTCAACGAAGGTGCCGTCATCGATGTA310734
310735GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACAAGCGGCTTTAAATTTTGCAAGAGATTTTT310811
310812GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACTGTCTGTATGTAATGCAACCACTTTTTCT310887
310888GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACTGAAGGCTCTTTATGTTCAGCACGGCAGCG310964
310965GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACAAAGTTGATGCGGCTCCTGTGGCTCACTCT311041
311042GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACAGGCAGACAAAAGGGATAATATACGGCAAC311118
311119GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACAGAGAAGGATAAGGTTACTCGTGCCACGGTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACCGCCCCGGCCGATATGGCATCAAAGGTTGT311270
311271GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACTCTTATGTTAACATCTATTCTATTCCTCCA311347
311348GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACTGAAATGATTCAATAGCATCCGCTTCGGCT311424
311425GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACGGATACGAGTAATATAGTTCCTGGTACGCT311501
311502GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACTGAATTGCAGGAGTTGTTGGACAAGCGTGC311578
311579GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACATACCGTTTTACTTCCTTGTTTTCGGTAAG311655
311656GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACCTAAATGATCCAGACACTACATAAGAACTA311732
311733GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACCTAAATGATCCAGACACTACATAAGAACTA311809
311810GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCACAACTAGCTGTCGTGAGCATGGTGTTATTATGGGT311887
311888GTTGTCAAAGACCAAAGTTAATTCGAAAATTGAAAGCAATTCAGATG311934
Left flanking sequence : Till position 309047 (length bp)
AAAATGGAAGAATTAGGATAAAAAAACGGGCAATATCGCCCGTTTTTTTATCCTGTTGACAACTTGAAAT
CCTTTGCTGTTGTGGGTTTTGACAAAACGT
Right flanking sequence : From position 311934 (length bp)
CCCGATTCGTATTTCTCAGGGAAAGTAAAAAATTCGATGTTGTAGTTTTTACGGAACGTAACGCCTATTA
CCAGACCGAACGTTGGTCTATGGAACTAAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp