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CRISPRs details
NZ_CP007206_7
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP007206_7                                                                                                                 
top
Strain :
Flavobacterium psychrophilum FPG101 GCF_000754365
RefSeq :
NZ_CP007206 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP007206_7
DR consensus (47 bp) :
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACA
Number of repetitions :
17
Begin Position :
1376863
End Position :
1378500
1376863
TAATTTAATTACACCCAACGGGTTATTTTAGCTTATAATTACCAACT
TTTGTTTTCGTCAAATTCCCCATTTGTGGTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACATTAATGCGCTAATTATCGAAGGTAGCACT
1377013
1377014
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACA
GGACGATTATAAATTTATGCTAAATATTA
1377089
1377090
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACA
GCGATGGAAAATGCGCACGAGCTTACGCT
1377165
1377166
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACA
GATATATCTAATACTAGAGCGTACGACAG
1377241
1377242
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACA
AAAACAATATCGAAAAACTGAAAGAGAAT
1377317
1377318
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACA
TTTAATGTAATTGTACCCGAACCAGCTCC
1377393
1377394
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACT
ATATCCGTGTTTGAATACACATTGCCACC
1377469
1377470
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACC
GTTTTCGCACGTGAAATCAAAGTACTATGTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACTTTTAAAAAATGGTTAAGTAGGAAAACTTA
1377620
1377621
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACT
CCAGTAAGCGAGATGTCGTATATCAAAGT
1377696
1377697
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACA
GCCAATGCCTTGTGTCCTGTTATGTGTTC
1377772
1377773
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACA
AAAGATTTAGCAACATAGATGATTGTTTT
1377848
1377849
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACT
TTTACTTTTTATTTAAAGCAACTGTAATGTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACTAATAAGTTGCTCGTTTCCGTTTATTCCGT
1377999
1378000
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACA
GTAGGTAATGTATTCACAATAGACACATT
1378075
1378076
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACA
AAACGAAATACATACAGCGCACGCATTCGTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTCAGCTTATAATTACCAACAGGCACTTCTTTAGACTTAAATAAGTCTTT
1378226
1378227
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACA
GTAATAGATGGGGGGTTTGAATGCCGTAGTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACTCATCATCTGATGAAAATTGCTGTTCAATA
1378377
1378378
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACA
AGCAAAATAAAATAAAAGAAATATTTAGC
1378453
1378454
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTAGCTTATAATTACCAACA
1378500
Left flanking sequence : Till position 1376863 (length
bp)
GTTTTAAATCAATTTAATCTTATATTTGACAAAAGGCTCAGATTATAAAATCCAAGCCTAACTTTTTAAC
TTACACACTTTGCGGGATAGTGTCATCAAA
Right flanking sequence : From position 1378500 (length
bp)
TACCGCGAGTTAATCGTTTGATATGTTGGTGGTTATATGCTTATTTTGAAATTAAAAAACAGTTCTGTTT
GTGTGTTGATATTCTGGTAGGTCTAATATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp