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CRISPRs details
NZ_CP007223_2
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NZ_CP007223_2                                                                                                                 
top
Strain :
Thermosipho sp. 1063 GCF_001941365
RefSeq :
NZ_CP007223 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP007223_2
DR consensus (35 bp) :
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
Number of repetitions :
61
Begin Position :
306496
End Position :
310808
306496
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TTTCTAATTTAGAAATCGGAATAAAAAACAGTCCTTCTT
306569
306570
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
GGATGGACGTTTTTATATCCCAATCAACAAATTAGC
306640
306641
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TCTACATACGGCAACAACTCAGCAAGCCAATCTTCA
306711
306712
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TTTGGCAAAAGGGCTGCTGATTTTCTTGCTAAAGT
306781
306782
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
GCACTTTATTGTTTAAATCAACGGATAAACCAGATTTTT
306855
306856
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
AGCATGGAGATATTATTTTTGATATTTTTAGAAATT
306926
306927
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
AAGCAAGCCGAAGGAATGTTGACAACTTTTGTTGA
306996
306997
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
ATTATAGACGCTCAAATTGGTAGTGTTGATTGGGATA
307068
307069
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TTCTTGTAAAGGTGGCGGCAAGGTGCCCATGGATG
307138
307139
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
AATGGTATCCCCAATAACCCCTATAAATTGAAATTG
307209
307210
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TACCATAGGGTATCTGATAGGGTATCGATAGCCTATT
307281
307282
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
AATCTTCTAACTACCCAACCGTGTAAATTTCTTTCTT
307353
307354
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TTCTTGTGCCAATTCTTTAGTAGTCATCTTATCA
307422
307423
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TTAAAGTTGGTTTTCTGGTGAAAGGTGGATATAA
307491
307492
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
AAAAAAGGTATAGACTTTCAAAAAACAGAAAATAA
307561
307562
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
AAATTTACAATGGCACCAGATTATTAGTTAGGAAGCA
307633
307634
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
AATAGGGCTCCCGCTTGAACCCGAAAGGGAAGGGAGA
307705
307706
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
ATTCTACAAACATACTATTTCACCTCCAACAAACA
307775
307776
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
GAAGTAGTGTACGCTGGTGGAGAAACAACAGATGATA
307847
307848
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
AGAATTGAGAATAGAGGAAAGAATTTGTGGGATAATTT
307920
307921
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TTACCAAATTTTTGCTTAAGACGCTCCCAAGAAGTA
307991
307992
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
ACTCTATATCTCCTAATGCTCCGTTTCTGTTTTTTC
308062
308063
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
GCATAAAATGAATACTTCAAAGAACCCTTGGGATATTTT
308136
308137
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
AGAGAAGAATGGTCAAAACAACGAATACATTTGG
308205
308206
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
CGTTTGTGAAAGAAATAGAAGACGGACGTATTTTAG
308276
308277
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
GTTGATAATGTCCAAACCAACGACGCACATGTTCAACA
308349
308350
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TGGAATGCATGGATGAGATTAGAAAATCAACCAATG
308420
308421
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
GCTGCCACCGATACCACCGTCGTAATGGCGGTGGCCGAAG
308495
308496
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TTAAATTAGAGATGTTAGAAGAGGAGGGAGACAGATG
308567
308568
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
GTTTATAATTTTTCACGGGACTTACTTTAACATTAA
308638
308639
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
GCTCCACTTGGGAATCTACTCCGTATTTGGAAATGG
308709
308710
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TTGGAACACCTGTTGTATACTTCGGAACATATGA
308778
308779
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
ACATTTTGACCATTAACGAAGTCAGACAAGAAAT
308847
308848
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
AATGTTGACGCCGATGGCCAAATAGTCATAAAGGTGGT
308920
308921
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TTTCGGTTAAATTTTCGATATCTTTATCTGTGCTGT
308991
308992
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
GCACGTATTCTGGTGTTATATATATTCCACGGTTTC
309062
309063
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TCCACAGAACTATCAACAGTGAAAATATCACTAACTT
309134
309135
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
ATACCAATGCAGAAAGCCCATATGCAAGAGGACTTAT
309206
309207
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
CGACTGTTACTATAGCAAGTGATAAGTTTGTCAAAAA
309278
309279
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
AAAGTTTTTCATTTTCTGCCTTTAATGTTTCTATTT
309349
309350
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
AGAGAGCTGGGGTGGTTCTGCTTAGTTTTTTAAGCC
309420
309421
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
CATATTGTTCATATGTTTCCCAATGCCCACTAGCGA
309491
309492
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
ACCTATTGTTTTTTGGTTGTTATCTGTTGTTGGCTC
309562
309563
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
ATTACTTGTAGTAATAACCGCCCCTACAGTGGTAGTCAG
309636
309637
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TTAAGTGTTGTTGTAGATGGCGCGGTATTAACAGATT
309708
309709
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TTTTGAAGGCTTCGGATATAGAATAGAACCACGAC
309778
309779
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
CTTATTATGAACGAAGCGTTGCAAATGCTTATTGGTG
309850
309851
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
CTGTTGCAAAACGGAAGAGCTTTTAACTTGGCAAGAG
309922
309923
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
ATGTCTTGGCAGCTTGGTTTAATGGTGTACATTTG
309992
309993
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TTACTAATTGGTATTCACCTCTATATCCTTTTTGT
310062
310063
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
ATTTAGTCTCCTGTGGAACATTTTCATCTATCCAAG
310133
310134
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
TTGCAAATTTTAAATGATGCGGCTAACGATGCAAG
310203
310204
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
ATTTTTTAACAGGGCGCGCAGATTACAGAAATAG
310272
310273
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
ATTAAAATGTATGAACCACGCTGCAAGGTTTGTAA
310342
310343
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
AGAACCCGCTGTATTAGTTTGCCCCCTTATAGTATGTG
310415
310416
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAATGGAATTCAAAC
GGTTGATTGTGCCATCGGCTGTTTTTGCATATGCGG
310486
310487
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAAATGGAATTCAAA
CACGTAGGTGATACGCTAAGCGGCAATTATTATCTT
310557
310558
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAAATGGAATTCAAA
CTTGTGATTCCGTTTAGAGCCCAGCTCATTCAAACCA
310629
310630
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAAATGGAATTCAAA
CATCTAACAGTATCAAGGATAGTTTTGGGGATAAAAGC
310702
310703
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAAATGGAATTCAAA
CATAGAAAACTCAGGAGTAGCATTCCCAGTTATCGT
310773
310774
GTTAAAAAACCTAATTCCATAAAATGGAATTCAAA
310808
Left flanking sequence : Till position 306496 (length
bp)
CATTGAAACAAACTTATTTAAAAATTTTTTAAGTAAAAAACGTTAACACACGCATTTACGGTCCTTGACA
ATTTATTTTTTTTGTTTTAGTATTGATAGT
Right flanking sequence : From position 310808 (length
bp)
TTGTTACTACACTTGTTTGATATCAATATTTATGTTTAAAAATTGATATAGAATTTCGGCTACTTATACT
GTAATTAATAAAAAAACATGGCTCCATAGC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp