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CRISPRs details
NZ_CP009149_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP009149_4                                                                                                                 
top
Strain :
Methanocaldococcus bathoardescens GCF_000739065
RefSeq :
NZ_CP009149 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP009149_4
DR consensus (30 bp) :
GTTTCCATACCGAAACGGTCTGATTTTAAC
Number of repetitions :
21
Begin Position :
287107
End Position :
288529
287107
GTTTTTACACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
TTATAAAGTTTTGTGGGAAGCTAAAAGTCAAACATAT
287173
287174
GTTTCCATACCGAAACGGTCTGATTTTAAC
TATTGTTTATTTCTTCAGTTGCAGGGGAATCAATCTTAGATATGAAGTATA
287254
287255
GTTTCCATGCCGAAACGGTCTGATTTTAAC
AGGACTGGATAAGTCATGCCGTAGAGAGGCCAGGAGCACTA
287325
287326
GTTTCCATACCAAAACGGTCTGATTTTAAC
TACTACATATATGTAAATTGGTGATAAAATGGCTGATGTAA
287396
287397
GTTTCCATACCGAAACGGTCTGATTTTAAC
GCCGTTTAATTCTCTTACCGCCTCACACCCTCCCTTGCAATA
287468
287469
GTTTCCATACCAAAACGGTCTGATTTTAAC
AACTTCTATAGGAATAGTTATTTTACAGTATAATTCATC
287537
287538
GTTTCCATACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
TTATAAAATGAAAATAAAAGGCAGTATTGGAATGATTGA
287606
287607
GTTTCCATACCAAAACGGTCTGATTTTAAC
TTGCATACATTGCTAAAAAATATCTGTAGGTGAAACTA
287674
287675
GTTTCCATACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
TATCACTTGTTGGTTACCGTAAAACTAAATGA
287736
287737
GTTTCCATACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
GATGCAATAACTTCATTAGCCCCACCTGTATTAAATACGGAGCATTT
287813
287814
GTTTCCATACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
CAAATTCCCAACTAACACCGAAAACTATCTCCCTAT
287879
287880
GTTTCCATACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
ATCCCTTTAGATTCTCAATTCTGTAGGCAGTTAGAA
287945
287946
GTTTCCATACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
TTAATCTTAAAAGTGGTGGAATAGGAGCTGGTGGTGGGGC
288015
288016
GTTTCCATACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
CATTAACTGATAATAATACAATTGATAGATTAAAAA
288081
288082
GTTTCCATACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
AAAATAGATGAAAATACTTCAATTGTTATTGATTTATG
288149
288150
GTTTCCATACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
TTTAAGTTTTGTTATTGTTTCGTAAATTTTAAATAATTCTTG
288221
288222
GTTTCCATACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
AAGATTGACGAATATCAACACCTTCAGAAAAAAGAATATTTAGA
288295
288296
GTTTCCATACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
TTTTGATGTTTCTGGAGTTTATTCACATAATTGT
288359
288360
GTTTCCATACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
CAATGTAGAATTTGATATTACTAATATTTGGGATATATCTTA
288431
288432
GTTTCCATACCGTAACGGTCTGATTTTAAC
AATTTTAATGTATCTTTTACTGCTGGTGGCATATCCTT
288499
288500
GTTTCCATACCGAAACGGTCTGATTTTAAC
288529
Left flanking sequence : Till position 287107 (length
bp)
AAAATATTTTGAGGTTTTTGGAATGCTATAATTCCATAGGGGGCTACGCCCCCCTCTATTGGGATACTTC
CCTATTTTTATTTTTTTATTTTAAAATTAT
Right flanking sequence : From position 288529 (length
bp)
AGGGCATTATTTTGCTCATTTTGTATGTTATCTCTTCTAATATTTAAGCTTTTTCATACCATAATTTTCG
AAGGGTAGATAACCCCTTTTATTTATAAAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp