CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP009170_6
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP009170_6                                                                                                                 
top
Strain :
Thermoanaerobacter kivui GCF_000763575
RefSeq :
NZ_CP009170 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP009170_6
DR consensus (30 bp) :
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
Number of repetitions :
37
Begin Position :
2344710
End Position :
2347139
2344710
GTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
AAGAAAGATGTAGAACGTGGTGAAGTTCGTATTAT
2344774
2344775
GTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TGATTTTTTATCCCAAATGCTGAAGCGATCTGTTTGA
2344841
2344842
GTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TGATTTAGCTTCCCGACCTTGAATTCATCAACGTA
2344906
2344907
ATTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
GTATGGCGATCCTGTTGATATTGTATATTTTAATGA
2344972
2344973
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TATTACACAGATTTTTTGATATATTAAAAAAATAACTTT
2345041
2345042
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
AGCATGTAAGTACAGTTGTACTTGCGTATAGTATTG
2345107
2345108
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TTATGAATGCTGTTTTTGCCAAATTTTTGGTTAGCTT
2345174
2345175
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
AAGAGTATACCAGAAGGTCATTTATCACACAAACAT
2345240
2345241
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
CAACCGAAACATCCAGATTAATAGGCAACGAATAGAA
2345307
2345308
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
CGGCAGGAGTAATTCCCAGGTCCGCTTCTGTTTTAT
2345373
2345374
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
ATAAATCCACCAGCGGAAGCAGAATTTACAATACAAT
2345440
2345441
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
GTGGATGTAATTGATTATGGTCTTGCTGCTTTTGCAG
2345507
2345508
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TTATGAATGCTGTTTTTGCCAAATTTTTGGTTAGCTT
2345574
2345575
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
AAGAGTATACCAGAAGGTCATTTATCACACAAACAT
2345640
2345641
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TTAAATTATGCTTTACTACCTCGTATGTATAATACGA
2345707
2345708
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
CAAAAGCAAGAGAACAACTAGTTGAGGATATAAAAAA
2345774
2345775
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TTCTTTCAGCTTTGTTTCATTGAAGGTTTTTATCTC
2345840
2345841
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
GAATATCCACCTTTAATTAATATGTACCAATAAATTG
2345907
2345908
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TGTCAATATCACAGCAAACTAACTTGCCTTTTACGT
2345973
2345974
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TGTACACGAATGTGAATTTTATTCGTTAGCAAACTA
2346039
2346040
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
CTAAGGCTTTTACATAATCAAAAAACAGTTTGCTTCT
2346106
2346107
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
CAAAAATACACTCACAAAATCACCCTTTCAATATTTT
2346173
2346174
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
GATATAAAACACAACCAATTCAGTATATATTCATAC
2346239
2346240
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TTAATGAAGGTGATAATGTGAGCAAAAAGACGATTA
2346305
2346306
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
CACCCCCTTGTCAGAAATTTAGTCGAGTACAATCACT
2346372
2346373
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
CACCCCCTTGTCAGAAATTTAGTCGAGTACAATCACT
2346439
2346440
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TTTAACAGATGGCACAAATAATTTCTTATCAACACA
2346505
2346506
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TAACCCAAAAATTTCCGTTTTCATTGCCTTTTGATGTT
2346573
2346574
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TCAACACTATATTGTTTAAGTTTTTCGTGTAATTCGA
2346640
2346641
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
GCTTTAAAGTTTGTTCATCATCATAAAAGTTTGGCTT
2346707
2346708
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
GGGACAGCTTTATGGAGTGATGCCAATTCCAATCCTT
2346774
2346775
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TTGTTCTCATTATGTTTTAACTGCTGAATGTTTGCGTTG
2346843
2346844
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TGTTACCAAGTTTTCGCAGCTCAGCTTCAGCTCTATC
2346910
2346911
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
GCACACTGAAAGAAAAAAAAGATTATGGAATCATCCC
2346977
2346978
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TTTGAGCATTCCATACAACGTTTAATCCTAATGCTT
2347043
2347044
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
TGCATCTTCGAGTTTGCCAGTCAGAGCTAAGTATTG
2347109
2347110
CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC
2347139
Left flanking sequence : Till position 2344710 (length
bp)
TCCCTCTTTCAAGATCCTGGTATAAGAAGGGTCTCCTTTAAAAGCATACTAGTGGATAGTTAACTGTCGG
AAAATTTCCATCGAGGATTTGCTGTTCTAA
Right flanking sequence : From position 2347139 (length
bp)
CCATGAAAACTGCATGATAATACTAATGCTCTTTAAATTTACTTTACCACAGAATAAGCTATTTTACAAT
AACAAATCCTAAAATAAATACTCAAACATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp