Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP009170_6                                                                                                                 top


Strain : Thermoanaerobacter kivui GCF_000763575 RefSeq :NZ_CP009170 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP009170_6
DR consensus (30 bp) : CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCNumber of repetitions :37
Begin Position : 2344710 End Position : 2347139

2344710GTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCAAGAAAGATGTAGAACGTGGTGAAGTTCGTATTAT2344774
2344775GTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTGATTTTTTATCCCAAATGCTGAAGCGATCTGTTTGA2344841
2344842GTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTGATTTAGCTTCCCGACCTTGAATTCATCAACGTA2344906
2344907ATTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCGTATGGCGATCCTGTTGATATTGTATATTTTAATGA2344972
2344973CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTATTACACAGATTTTTTGATATATTAAAAAAATAACTTT2345041
2345042CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCAGCATGTAAGTACAGTTGTACTTGCGTATAGTATTG2345107
2345108CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTTATGAATGCTGTTTTTGCCAAATTTTTGGTTAGCTT2345174
2345175CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCAAGAGTATACCAGAAGGTCATTTATCACACAAACAT2345240
2345241CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCCAACCGAAACATCCAGATTAATAGGCAACGAATAGAA2345307
2345308CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCCGGCAGGAGTAATTCCCAGGTCCGCTTCTGTTTTAT2345373
2345374CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCATAAATCCACCAGCGGAAGCAGAATTTACAATACAAT2345440
2345441CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCGTGGATGTAATTGATTATGGTCTTGCTGCTTTTGCAG2345507
2345508CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTTATGAATGCTGTTTTTGCCAAATTTTTGGTTAGCTT2345574
2345575CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCAAGAGTATACCAGAAGGTCATTTATCACACAAACAT2345640
2345641CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTTAAATTATGCTTTACTACCTCGTATGTATAATACGA2345707
2345708CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCCAAAAGCAAGAGAACAACTAGTTGAGGATATAAAAAA2345774
2345775CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTTCTTTCAGCTTTGTTTCATTGAAGGTTTTTATCTC2345840
2345841CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCGAATATCCACCTTTAATTAATATGTACCAATAAATTG2345907
2345908CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTGTCAATATCACAGCAAACTAACTTGCCTTTTACGT2345973
2345974CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTGTACACGAATGTGAATTTTATTCGTTAGCAAACTA2346039
2346040CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCCTAAGGCTTTTACATAATCAAAAAACAGTTTGCTTCT2346106
2346107CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCCAAAAATACACTCACAAAATCACCCTTTCAATATTTT2346173
2346174CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCGATATAAAACACAACCAATTCAGTATATATTCATAC2346239
2346240CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTTAATGAAGGTGATAATGTGAGCAAAAAGACGATTA2346305
2346306CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCCACCCCCTTGTCAGAAATTTAGTCGAGTACAATCACT2346372
2346373CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCCACCCCCTTGTCAGAAATTTAGTCGAGTACAATCACT2346439
2346440CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTTTAACAGATGGCACAAATAATTTCTTATCAACACA2346505
2346506CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTAACCCAAAAATTTCCGTTTTCATTGCCTTTTGATGTT2346573
2346574CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTCAACACTATATTGTTTAAGTTTTTCGTGTAATTCGA2346640
2346641CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCGCTTTAAAGTTTGTTCATCATCATAAAAGTTTGGCTT2346707
2346708CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCGGGACAGCTTTATGGAGTGATGCCAATTCCAATCCTT2346774
2346775CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTTGTTCTCATTATGTTTTAACTGCTGAATGTTTGCGTTG2346843
2346844CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTGTTACCAAGTTTTCGCAGCTCAGCTTCAGCTCTATC2346910
2346911CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCGCACACTGAAAGAAAAAAAAGATTATGGAATCATCCC2346977
2346978CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTTTGAGCATTCCATACAACGTTTAATCCTAATGCTT2347043
2347044CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATCTGCATCTTCGAGTTTGCCAGTCAGAGCTAAGTATTG2347109
2347110CTTTCAATTCCAGTATGGTTGGATTAAATC2347139
Left flanking sequence : Till position 2344710 (length bp)
TCCCTCTTTCAAGATCCTGGTATAAGAAGGGTCTCCTTTAAAAGCATACTAGTGGATAGTTAACTGTCGG
AAAATTTCCATCGAGGATTTGCTGTTCTAA
Right flanking sequence : From position 2347139 (length bp)
CCATGAAAACTGCATGATAATACTAATGCTCTTTAAATTTACTTTACCACAGAATAAGCTATTTTACAAT
AACAAATCCTAAAATAAATACTCAAACATA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp