Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP009226_3                                                                                                                 top


Strain : Campylobacter fetus subsp. testudinum pet-3 pet-3-1 GCF_000814265 RefSeq :NZ_CP009226 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP009226_3
DR consensus (30 bp) : GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACNumber of repetitions :18
Begin Position : 685861 End Position : 687008

685861GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT685926
685927GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACATACTTGTTAGGAAATTTGACTACGCTAAAACAAGA685992
685993GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGTTAAAAAAATGAGAGTAAGCCGTTTTTTGTAAT686057
686058GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACCTTTGATGATAACTTTTTGGCTCTTTTGTGTGATATT686124
686125GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGTCCTCCATAAATGAAAACGAAATGGCTACATAT686189
686190GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAAACTATTTTGAGTTATATTTTATGCCTATTTTAA686255
686256GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGAAATTTAGTATCGATATAATCGCACCTATACACG686321
686322GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACACTCCAAAATCCTCGCCCTGAACGCTGCTAAAAGCT686387
686388GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGCCGATGAGCAAAGATGTGGCGGGTAAGATACTGG686453
686454GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCC686518
686519AGTTTGTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTAATTTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCT686585
686586GTTTACTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTGCCATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCAT686650
686651GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAGTGGGGGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACA686716
686717GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCTTTGCTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGT686783
686784GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTAAGTAATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACG686849
686850GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACAAGTCTGCTTTAGTGGATCAGATAATAAATAATTAT686915
686916GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTAAATCCCCTAATATAGCTATTAAAGGCTATCATATTTA686978
686979GTTTACTAATCACAAAGTTTATATTAAAAT687008
Left flanking sequence : Till position 685861 (length bp)
TCCATTTTCAATAGTTTTAAATAGTTTTTTAAATTTATTTCTTATTTTAATTTCTAATTAAATTTCTTTT
TAAATTTAATTAGATGATGAGTTTATTATG
Right flanking sequence : From position 687008 (length bp)
CATATAGAACGCTAAAGCAGAAGATGAGCTTTTTAGACATATTGATAGTATGGGTTATGAAAAAGTTGCT
AAAGCAGATATCTATACACACGGACAAAGC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp