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CRISPRs details
NZ_CP009226_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP009226_3                                                                                                                 
top
Strain :
Campylobacter fetus subsp. testudinum pet-3 pet-3-1 GCF_000814265
RefSeq :
NZ_CP009226 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP009226_3
DR consensus (30 bp) :
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
Number of repetitions :
18
Begin Position :
685861
End Position :
687008
685861
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
ACTACAGGTACATTTATAACATCAAATAATAATTTT
685926
685927
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
ATACTTGTTAGGAAATTTGACTACGCTAAAACAAGA
685992
685993
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
AGTTAAAAAAATGAGAGTAAGCCGTTTTTTGTAAT
686057
686058
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
CTTTGATGATAACTTTTTGGCTCTTTTGTGTGATATT
686124
686125
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
AGTCCTCCATAAATGAAAACGAAATGGCTACATAT
686189
686190
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
AAAACTATTTTGAGTTATATTTTATGCCTATTTTAA
686255
686256
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
AGAAATTTAGTATCGATATAATCGCACCTATACACG
686321
686322
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
ACTCCAAAATCCTCGCCCTGAACGCTGCTAAAAGCT
686387
686388
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
AGCCGATGAGCAAAGATGTGGCGGGTAAGATACTGG
686453
686454
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
GGGAGTAAAAAATATTTTAATTTTACATCCCACCC
686518
686519
AGTTTGTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
TTTAATTTTATGCTATCTTTTAAACTCATTTAAATCT
686585
686586
GTTTACTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
TTTGCCATAACTAAGAGCATATTTTTTATATTCAT
686650
686651
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
AGTGGGGGATATCGTTAAGCTCAAGAGCCCAACACA
686716
686717
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
TCTTTGCTTACAGAACATTGTATCCCTTACTCTGAGT
686783
686784
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
TAAGTAATGTTTTTGGTGTTGAAGATGACTATGACG
686849
686850
GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC
AAGTCTGCTTTAGTGGATCAGATAATAAATAATTAT
686915
686916
GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTAAATC
CCCTAATATAGCTATTAAAGGCTATCATATTTA
686978
686979
GTTTACTAATCACAAAGTTTATATTAAAAT
687008
Left flanking sequence : Till position 685861 (length
bp)
TCCATTTTCAATAGTTTTAAATAGTTTTTTAAATTTATTTCTTATTTTAATTTCTAATTAAATTTCTTTT
TAAATTTAATTAGATGATGAGTTTATTATG
Right flanking sequence : From position 687008 (length
bp)
CATATAGAACGCTAAAGCAGAAGATGAGCTTTTTAGACATATTGATAGTATGGGTTATGAAAAAGTTGCT
AAAGCAGATATCTATACACACGGACAAAGC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp