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CRISPRs details
NZ_CP009515_21
Flanking alignement tool
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NZ_CP009515_21                                                                                                                 
top
Strain :
Methanosarcina lacustris Z-7289 GCF_000970265
RefSeq :
NZ_CP009515 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP009515_21
DR consensus (37 bp) :
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
Number of repetitions :
29
Begin Position :
3273503
End Position :
3275585
3273503
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
AAATATGTGGTAGATAGTTTATACTGTTATTATGA
3273574
3273575
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
CTTATAATACTGTATGTGAGAGTCCCGAGGTTCCG
3273646
3273647
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
GATGTTATGGCGGACCCTGATATGGAGATCCGGATTAA
3273721
3273722
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
ACGCTGTAGGTGCAATAGTAGGAAAATCATCAGGGTC
3273795
3273796
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
AGGGCACCGAACCGTCGAAGTTCCCCGAGTACGAAT
3273868
3273869
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
CTGTCCAAACAAACTTTATACAGTTGAGCTTGAGAG
3273941
3273942
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
CAGGCGCATGGAAAGGGCTGGTTGGAGCACTATGTT
3274014
3274015
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
AGCCTCCACTGGTTCAGTGAGCGCGGCGATGGGTGT
3274087
3274088
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
TTTTAAAGACCGTGAAACCTGACATCTATTTCGT
3274158
3274159
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
CGAGGTATTCTTTAGCTGGAACCACTTCCAGCTTTGTG
3274233
3274234
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
CTCCTTTTGAATTTCCGGAACTCCTAGATGCTACCG
3274306
3274307
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
TTGCTACAATCACGGGTACATATTTTTCAAATAATT
3274379
3274380
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
ATTGCATTCGATGGAATAATAGGATAATTGATAAAA
3274452
3274453
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
CTCCTTTTGAATTTCCGGAACTCCTAGATGCTACCG
3274525
3274526
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
AATATACCAATTGGGCTAAACGCGAAAACGGGGAAAA
3274599
3274600
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
AATATTGCTAAGTTCCGAGACACACACACAAGCAG
3274671
3274672
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
GCTGTACAGGTTGTCAGGTTGCAGCCGAGTACAT
3274742
3274743
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
CATAGGTGATATCTGCCGTAAAACCAACTGGTTCTAA
3274816
3274817
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
TTTAATGAATACAACGAAGAAGACATTGAGACAA
3274887
3274888
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
CTACATGGTATTTGCATACGGTCTTTGCATGGATGGGA
3274962
3274963
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
TTTTCCTTCTTGCTTTTGTTGTAGCAGGAGGGATAA
3275035
3275036
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
ATATGACGATCATTACACATCACACAACACTCTTT
3275107
3275108
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
GACGCACTCTTAAAAATGATTGCCATCTTTGGGAGTC
3275181
3275182
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
AAAAACATTTAAAAGAACTATCAGAGGCTGAATTTT
3275254
3275255
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
TCTTTTCTCTCAGTTCCTTCACGTGTGAATCTCG
3275325
3275326
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
ATGGGCTGTACATAAAATCAATACTCTTGCAGAAGATA
3275400
3275401
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
CATCTCATTGGTGATCGAGGTTCCTCTAGCTACTTTA
3275474
3275475
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
CATACAAGGTACGGGTCATTTCGTCCTGCTCATCAAA
3275548
3275549
GTTCTAATCCTTGTTATAATGGAACTCGCATCGGAAT
3275585
Left flanking sequence : Till position 3273503 (length
bp)
AATCACTTTATGCTTGCTGAACAAGTTAAGCCTTTCATAATACCTGGCAAAAAGTATTCATTTGCTATTG
ATCTTACAGATGATTCATTCGTTACACTCA
Right flanking sequence : From position 3275585 (length
bp)
AGGGCAAAAATTTCCCGTGTTTGACTTGAAAATCCCTTATATTCCTCCTTTTTGAGCACTAATTTTCTTC
CTGGCAATTTATCAAACCATTTATAAATAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp