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CRISPRs details
NZ_CP009933_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP009933_1                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium scatologenes GCF_000968375
RefSeq :
NZ_CP009933 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP009933_1
DR consensus (30 bp) :
GTTGAACTTTAACATATAATGTATTTAAAT
Number of repetitions :
13
Begin Position :
753473
End Position :
754290
753473
GTTGAACTTTAACATATAATGTATTTAAAT
CGGGTATAGCTAACCTTATTTTTGGGTTGATATTAG
753538
753539
GTTGAACTTTAACATATAATGTATTTAAAT
TTTTTAAACTCCAAAATTTATATCATCTAAAGCTTT
753604
753605
GTTGAACTTTAACATATAATGTATTTAAAT
TTATTGGCTATGACTTGTAAATTGTTTGAAGGGTTG
753670
753671
GTTGAACTTTAACATATAATGTATTTAAAT
TAGCCAATAATGATATGACAGTTACTATTAAAGCAG
753736
753737
GTTGAACTTTAACATATAATGTATTTAAAT
AGAGCTGGACAGACTTAGTCCCTGGAATCGTTAGCAA
753803
753804
GTTGAACTTTAACATATAATGTATTTAAAT
GATAACTGTGCATATATTTGAGTAGTTGCTGGTGT
753868
753869
GTTGAACTTTAACATATAATGTATTTAAAT
AATAATGATACACAATGCAAGTGGTTGTTTTGGTGG
753934
753935
GTTGAACTTTAACATATAATGTATTTAAAT
ACCATGTTGGTGGTCTTATCTTATTACTCTGCAACT
754000
754001
GTTGAACTTTAACATATAATGTATTTAAAT
TATCGAAGTAACTGACTAAGTGGTACACAATACAA
754065
754066
GTTGAACTTTAACATATAATGTATTTAAAT
CTTTTTCGTATATCAAAACCTGAAGGTATATAATC
754130
754131
GTTGAACTTTAACATATAATGTATTTAAAT
AGAAATTCTTTTACTCGTATATATAATTCCAATGAA
754196
754197
GTTGAACTTTAACATATAATGTATTTAAAT
CACATACAGTATAGCTCTTTTATTCGTATTGTTA
754260
754261
GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTATGA
754290
Left flanking sequence : Till position 753473 (length
bp)
TTTTAAAAATTAAAAAACGGCTGGTAAAATTTCAACAAAATCCTTTATTTACAATGTATTAAAGGGTATA
ATAAAAAATAGAAATGGCTATTTTACAGTG
Right flanking sequence : From position 754290 (length
bp)
ATTAAGATTTTCTTCAAATATTTGAAATTTAACTTAACAAAAATTTATTATAAAATTAGCTGCAGAGGTG
TTTCATGGATATAACAATAATAAAAGGAAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp