Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP009933_2                                                                                                                 top


Strain : Clostridium scatologenes GCF_000968375 RefSeq :NZ_CP009933 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP009933_2
DR consensus (30 bp) : GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATNumber of repetitions :39
Begin Position : 757646 End Position : 760176

757646GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTTTAAAAAACTGGTAAAAAATTATACTGGAGTTG757710
757711GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATATGTTTCCAATTTTAATGTGCTTATTTACTATTTCC757776
757777GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTATACTCCTGATCCGTTGCCTTCTTTAGTTGTTA757840
757841GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTACTATAGTCAATTAATTCTTCTAGTACTGTACTA757906
757907GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTGGAAACAGCAGCTATAAAGTTGGAACAAACTTTAG757973
757974GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTAATCCTTTCCTGCTGTAGTAATTATAACTAACAGT758039
758040GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATATGGTGATGTCCTATTGTTCGTGCAGACAACCCTCC758105
758106GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATGATTTAAAAGACTTCTATGACAAGAAACTCGATTCA758171
758172GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATGAGACTAGGGATGGTCTTTTTATTTTGACTATTTTG758237
758238GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATATGTTATGTTCTAAATCAATCCATTCACCCATAG758301
758302GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTAGAGTTCTAACAGCTACATTAGTTCTTAAAGCTG758367
758368GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTAATGCTTCCATTCTATTTATTCTCTAAAACACCA758433
758434GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATAAACGACTTCGCCATTTATCCTGCTTACCTCTCTTT758499
758500GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATAAATCTGCACCAACTTTTACTGCTGCTGCAGCAACC758565
758566GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTTTCTATAAAGTATGCAAATAAATCCAAACCTTTA758631
758632GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTCTTCCTCTAGTCCTAAATACTTTTTAGCTTCATTT758697
758698GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATAATAATCAAAATGCTCTTTACCTTTGCAAAATGTTT758763
758764GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTTTTAAACTCCAAAATTTATATCATCTAAAGCTTT758829
758830GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTGCCTGCAATTATTGCATGACATCCACCATAATTG758895
758896GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATGCCTTTGTTGTTATTGTAGTGAGAGGTTTATCTAAT758961
758962GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTAACATAATTAAACGCAATGTAGGAATTTACGTAAA759027
759028GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATAATAATAGATATCTGCAAAGAAAATGATATGCAAA759092
759093GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTACATAAGGCTTTTGAGCCACATACCCTAGTCTAA759158
759159GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTAGGAATAGATTTAAAAGCATTATTGCTTGTAATGG759224
759225GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATATTTATGTAAGAATCTATTAAAACAATTAAAAAAA759289
759290GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTAAAGATCATAACTATTTTAAATAAAATAATTACA759355
759356GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATAAAGAACAATGTGAACAGGAATTAAAAGTTGTTAGAT759422
759423GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATATGGATTTAATATTATGTTATTCATATTTTTACCCT759488
759489GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATCGATTGGGAAAATCTTTACCTAATATAAACCCAGGA759554
759555GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTGCCTCCCAAATATTATAACTTTTTATAACTTCTC759620
759621GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATAGCATGTTAGTTAGTATATCTTTGAATATAGCTTC759685
759686GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATATAGCTGTTAATCCAGTAGCAGGTATCAAATATGGA759751
759752GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTATAAAATGAATTCCCTGTATATATACCAATTCCA759817
759818GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTGCTCTGCAGTTATTAGCCTATAATCTTCAAATC759882
759883GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTGGAGCTGTGATAAAGATTCCGTAGGTATAAGTCTT759948
759949GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATCATATTCTTGAATTTATACAGAGTAAAGAGGTGAAA760014
760015GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATACTATTTGTACATCAAATGTGGTATCTCCTTGTGT760079
760080GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATGATTGTCCTACATAATAAGTTGCATTATTAAGTGCTA760146
760147GCTGAACTTTAACATATGATGTATACATGA760176
Left flanking sequence : Till position 757646 (length bp)
TTTTCAAAAACGAAAAATGGCTGGTAAAATTTTAAGAAAATCCTTTATTTTCAATGGATTAAGAGTTATA
ATAAAAAATAAGAATGGCTATTTTACAGTG
Right flanking sequence : From position 760176 (length bp)
AAAACGTATTAAGGAATTTGAACAGAGGATTATATTATTAATTTTACTCCACTAAAATCGTTTAATAATT
TTTTAGCAATCAAAAGGTCTTTCATTAATT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp