Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP009933_3                                                                                                                 top


Strain : Clostridium scatologenes GCF_000968375 RefSeq :NZ_CP009933 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP009933_3
DR consensus (30 bp) : GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATNumber of repetitions :33
Begin Position : 766433 End Position : 768564

766433GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTATGTATTTAAAATTAATTTTGTTGATTTAAGATTG766498
766499GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATATCATATAATCATCTTTATAAATCCATACTGTTTT766563
766564GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTGGCATTTACCGTATCTACTTTTATTGGTTTATTA766628
766629GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATGTAGTCATTGCCTTAAAATGCATCAAATCAGTACTT766694
766695GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTTTAGATAACATATATTCTTTAAACTTGTCTTTAG766760
766761GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATCGTGAAAGCTCATTTATTTTAGTTTGAATATCCTT766825
766826GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATAATGCTTACAGAATTAAAACAGGTTTAAGTAATGA766890
766891GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATAATGAATAATGATGTTGAACCAATTATGTAAAAACC766956
766957GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATACAAAGCTTGAAGCCGAGGCAGAATGGATCGTAAT767021
767022GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATACAAACCAGGCATTGCTGCCATTATTTCTTGTGTAG767087
767088GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATATTCCTAAAAGACTTGAAGCATACAACAGTTTTTCT767153
767154GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATACTTATCCCCTCCTTAGAGAGAGGATTAACCTCTCT767219
767220GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATGCTTCTAATGGAGCTACTGCTTTTAATTCTTGATCT767285
767286GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATGATAACTGTGCATATATTTGAGTAGTTGCTGGTGT767350
767351GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATAAGAAAAATGCCAATAGGATGCGTCTTAGAAATTAG767416
767417GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATGCATCTTTTCCTTTTGTGTAAGTAACAAAATATATT767482
767483GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTACATATCTGAGTTAGGGTGTGCATGATATTCGTCT767548
767549GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTTTCTATAAAGTATGCAAATAAATCCAAACCTTTA767614
767615GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATGATGAATTTTTAGCAAGTACCATAAGTTCCTTTA767678
767679GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATAAAGTTTTATGAAAACTATTTCCATAATCGGCGTTC767744
767745GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATAGAATAATCCAAACTATGTTAAATTCATAAATAATC767810
767811GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATAAGAAAGAAAAGTTATATATATAAAAATTTTGATAG767876
767877GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATGTAGGAACACAAGTCTCTACAAATACTTTAGATAT767941
767942GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTAACAAATGGTTGTTTCCCATTGTCTCTCCATGAT768007
768008GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATAGATTTATGTCTTTAATCTTTCCTTCAAATTTATT768072
768073GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATGATGCAGGTGGTTTTATGATTCGCGAAGTCGGTATA768138
768139GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTAGATTAGTTTGTGCTTTTGAAGATGCAGGATTTAT768204
768205GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATGATGAGGATCCTGCACAAAAAATTACTGACAAATAT768270
768271GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTATAGAGAACGACAAGGTTGTTAGTAAGAGAGGTACA768337
768338GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATACAAATAATTAATTTGTACAAAGCTCTAGTAAAA768401
768402GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTCCCAAATCCACTTAATTTTGTTATTATTCCAGCAA768468
768469GTTGAACTTTAACATAGGATGTATTTAAATTTGTTCCAAGTCAATACAAATTTATTCAAAATCGTT768534
768535GTTGAACTTTAACATATGGCATATTAAAAA768564
Left flanking sequence : Till position 766433 (length bp)
TTTTCAAAAGTAAAAAATGGCTGGTAAAATTTTAAGAAAATCCTTTAATTTCAATGGATTAAGAGGTATA
ATAAAAAATGAGAATGGCTATTTTACAGTG
Right flanking sequence : From position 768564 (length bp)
TAAATGCTATTGCTTTAAATTAGCAGTAGCATTTATTTTTATGAATGTTTAAATAGCATTGTTTGTGTTA
AAATAATTGTTAAGGAAGGAAGTGGTTAAG
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp