Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP009933_5                                                                                                                 top


Strain : Clostridium scatologenes GCF_000968375 RefSeq :NZ_CP009933 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP009933_5
DR consensus (30 bp) : GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATNumber of repetitions :14
Begin Position : 813678 End Position : 814564

813678GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATTTCCATCTGATTTGATAACCGCTATGTCCATGATT813742
813743GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATCAGAACAAGTCTTATAAAAATGATTACTATAGCAG813807
813808GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATTCTATAAGTAATATAGCATTGCTTAGTACTTCCATA813873
813874GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATAAATAATGAATTTGGTGTTGGAAGAATAATTTTAGAT813940
813941GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATAATACCATTAGCAGACATACAAGCAAGAAGATTAAC814006
814007GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATTCCCTGTTGCAACATGATAGGAAAGCGAATATACCC814072
814073GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATCTTCCTTTTATTATTTTATATTTCTATCCATTTAGC814138
814139GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATTGTAACCATATAATTATTTTAAATTCTTTATCATTT814204
814205GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATGATGGTGAAGTAACAAATAAAAGATTTGTTGGTGGAA814271
814272GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATCGAATAAAATTCCCAAAATGAAAGTTTGAAACCT814335
814336GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATCAAATCAGTTTTAAATGTTTTCCTAATATCCACAATC814402
814403GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATGAACTTGGATCATCAGGAGATATAATTCTTTGTGA814467
814468GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAATCAGATGATGAACGATTTAAATGTACTTATGATAGCAG814534
814535GTTGAACTATAACATAGGATGTATTTAAAT814564
Left flanking sequence : Till position 813678 (length bp)
TTTGAAAAATTAAAAAACGGCTGGTAAAATTTTAAGAAAATCCTTTATTTTCAATGGGTTAAGAGGTATA
ATAAAAAATAAGAATGGCTATTTTACAGTG
Right flanking sequence : From position 814564 (length bp)
AAAGTTAACCATAACAAGATTTTTTATATAGTATATTTAACAAAGCATAGATCAAGCTAAGCGAAACAGT
AACTTTGAATTGAACTTAATTACTATAAAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp