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CRISPRs details
NZ_CP010888_10
Flanking alignement tool
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NZ_CP010888_10                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridioides difficile GCF_001577795
RefSeq :
NZ_CP010888 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP010888_10
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
Number of repetitions :
17
Begin Position :
2353654
End Position :
2354737
2353654
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AGCAGTTAAAGTTGCAAACATCAACTTAACAGGAAAA
2353719
2353720
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TCCAAAATTTTAACTTTTTCTTTTTCTAAATCTTTAT
2353785
2353786
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTTAAATTATAAAAAGTATACAAACGAAAATTATCAAC
2353852
2353853
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TAACCTCTCCTGTACGTTTATCTATGTACTCATTAG
2353917
2353918
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CTCTTTAGCGCTTCTTCAAGTTGTATTTGTGTATAA
2353982
2353983
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTCATATTCCAAGCGTTTTGCTTACACTTAATAGAA
2354047
2354048
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AAAATTAAATTTCATGCTCTTAGACATACATATGCAAC
2354114
2354115
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TAGATTGCTTTCAAATTACCTCTTGTATAGCGTCTT
2354179
2354180
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CTTTTTTTATTAGTGAAAGGGGGTGGTTAAAATTAAA
2354245
2354246
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTGCTCCGCTATGCCTTGCGCTCTCTAATATCGCTTA
2354311
2354312
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
GGTTTTAAAGACCCAGCAACGATAAAACAATATGTTGCAA
2354380
2354381
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TGAACTTTAATCGGTTTTATACAACAATATAACGC
2354444
2354445
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AATGAAGGTATAATAAAATTAACAGAAGAAACAAGAGA
2354511
2354512
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TCACACATGAGCAATATCGAAACAGGCAAATCTACAG
2354577
2354578
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTCGTAAAATAACAATTATCTGGAATATGAGAAGTT
2354642
2354643
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TCAATATCTATATTAAGTTTATTTTTAAAAACATCTT
2354708
2354709
GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT
2354737
Left flanking sequence : Till position 2353654 (length
bp)
GGTGTGTGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 2354737 (length
bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACCCCAATAATTTATACAGCATTTTATCCTTTAAAATATAATTATTTT
TTAGCATTTGTAGTAAATAATTACCAGATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp