Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP010888_15                                                                                                                 top


Strain : Clostridioides difficile GCF_001577795 RefSeq :NZ_CP010888 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP010888_15
DR consensus (29 bp) : ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACNumber of repetitions :27
Begin Position : 3822106 End Position : 3823834

3822106ATTTAGATATGATTTAGTTAATATAAGGTGGATGTTTTAGTATATGCTATTGTTGATTCTACAA3822169
3822170TTTTATATACTGCTTTATTAATATAAAATAAGTTTCTAAATACTCGTTGATATTGCTAATATTCT3822234
3822235ACTTATCTACCACTTAGTTAATATAAAACAATGATACTGTAATATCTAAAGATGTTACATTGGCAA3822300
3822301ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCATCTTCAGTATCATATGCTGAAATATTATCAAG3822363
3822364ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGGCAATCATGTCAAGTACTTCTAATATAAAAAAGTTCT3822430
3822431ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTTACATGGAAAACGAAACATATTTAATTTGTTCTGA3822496
3822497ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAATGAAGCATTGAGTTTAAATAGCGATATTAGAAA3822561
3822562ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTCAATGAACTAGGGTTTAAAATACATTCTAGCCCGA3822627
3822628ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTTAAAATTCCGGACAAACAACGCTAAATCAAAAGA3822692
3822693ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAATAGAATTATAGCATCAACTAATCGTAAAATATTT3822758
3822759ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTGCGGTAAGACTGTTTGTTACAGGGATGGCAGAGTC3822824
3822825ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTCAACTCTCCTTGATAGATTTAGCCTATCTTGCGAT3822889
3822890ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGAACAAATTTAATGGAAGCAATAAAAAGTAATGACG3822954
3822955ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGGAGGAACTAAATTTAGCTTACTTTGATAAAGAAAG3823019
3823020ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTCAATATCTTTTCTTATTAGTTTCGCAAATTCTTCAT3823085
3823086ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGAAGGCAAAAACTAATGACTAATAAAGAGAAAATAAA3823151
3823152ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATATTTAAAGCAAGTACTTTTTTAAGAAAACTTA3823214
3823215ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACATGGCTAAGAGATACAGATAAAAATATAAATGAATGGT3823281
3823282ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTATTACGAGAAAAATTTAAAAACGACTAAAATCCAT3823346
3823347ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTCCATTTATTTTATATATTAAAATTATAGCATTCGA3823411
3823412ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACCTTTTGTTTTAGGATGATTATATAATATTACAAATTT3823477
3823478ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTGGACTTATTTTATTGACTTATAAATTATCTAATTT3823543
3823544ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACAAGCAGAAATAATAGGACTAATATCTATATCAACCAA3823609
3823610ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACGATAGAAGAAAATAATATAAAAGTTACCCTAAATTA3823674
3823675ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTTAGAAGATATAGAAGTTCTTGTAGATACTGTTGAG3823739
3823740ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAACTAAATTTAAAATAAATTATTAAATATCCGAAAAAATT3823805
3823806ATTTACATACCACTTAGTTAATATAAAAC3823834
Left flanking sequence : Till position 3822106 (length bp)
TGATTTTATTTATATCTTTATTGTTTAATTTCTTTATCATAAATTTTATTTCACCTCATTTTTGTATTGA
TTTTATAATGTTTATAGGTAAGTTTATTTT
Right flanking sequence : From position 3823834 (length bp)
CCCAAAATAGGTATATTTGAATACATTGAAAACACTTCAATCAAGCAATTATAATTCAATAAAAACATCA
AAATTTGCAGTGAGCGAGCAGTAGTGCAAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp