Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP011386_4                                                                                                                 top


Strain : Lactobacillus helveticus GCF_001006025 RefSeq :NZ_CP011386 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP011386_4
DR consensus (30 bp) : CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACNumber of repetitions :41
Begin Position : 1644308 End Position : 1647001

1644308AATTATTTTCCTCCTAAGTTAGATAAAATCAGCATATTTAGTAAAGTTGGTGTAAAATTCGGCTTT1644373
1644374ATTTACATTTCCCTTAGATTAAATAAAGACCTACCAACTACTAAAACTTTTAGATTAAACTTTCAAAA1644441
1644442ATTCACATTTCTCTTAAATTAAATAAAAACTCACTCAAAAAGAGGTACTATAGATCATTCAAGTTT1644507
1644508CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACCAATGGGTTCAAGCATTCCGTTACCACCTGAATTA1644572
1644573CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACGGTGTGGTTTTCTCATGAATGTATGTAAAAATTTGT1644638
1644639CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACAACGGCATAAACCATTGAGTCGACATTGTCATCGTG1644704
1644705CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACAAGCTCCATTAATGCTGACTTAATCCCCCATGCAGT1644770
1644771CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACAAAGTCCAACGACCAAAAGAAAGGATATAGATAGA1644835
1644836CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACCGTCCTTATCATCACCTTGAGTCAAGCTTAAATCACT1644902
1644903CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTAAAGCAAAGCAAAATAAGTTTTACCACTCAAAGCAA1644969
1644970CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACGATGATCTAAATAAACATACTTATACTGCTAAGCA1645034
1645035CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTGATTGATCACCATTTCCTGCATTGTTGAATTTAA1645099
1645100CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACACTTCTTTTTACCGTTTTTAAGATTATATGACTTATTACCGTTTTTAAGATTATATGACTTAA1645192
1645193CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTGATTAGATTGTAAGGAATTGTAGTCAGCTACTAAT1645258
1645259CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTCAAAACCGTTCACAGCGCCGGATAGGTACTAAGAG1645324
1645325CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACGCAGCTAAATCAGCATAAGTCTGCTTTAGTTCATC1645389
1645390CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACCTTGCTACACACGGCATGAAAGTAGGTGCTTAGATA1645455
1645456CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACATCTAGTTCAGTTGATTGGGCTACACGTCAGATAGC1645521
1645522CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACGAGTTTGCCTTGTTGTGTTCGCTAGCAGATAGGTTAA1645588
1645589CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACCTTTTTCCGTGTGCCCTTTACCTTGCACATATAGCA1645654
1645655CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACGATGATCTAAATAAACATACTTATACTGCTAAGCA1645719
1645720CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACAGCAAGCTCTTTGTAGTTTTCTACTTTTTTTGAAA1645784
1645785CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACCTTTTTCCGTGTGCCCTTTACCTTGCACATATAGCA1645850
1645851CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTCAATTCAAGATACTTTTCAACTAGCTTTTCATCTT1645916
1645917CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTAAGCGAGAAATGGCTTAAAAATCACAACTTATATTA1645983
1645984CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTTTAAGTGAGTTAAGTTATTGAGTGAGTGAGTTGTG1646049
1646050CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACGCTTAAAATTGTAAATTAGCGTATATAAGCGTTATAT1646116
1646117CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTTGTATGGAGTTATGTGGTTATTCTGCTGTTGTTCGA1646183
1646184CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACCTGAGCTTTGCGCCCTTAACATTTCGGGCAATATC1646248
1646249CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACGCAGATATTGATTATGAGATGATCGAAGGCTTAGCA1646314
1646315CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACGAAACATAAAAGCAATGCGTTTCTCAAACTCAAACTT1646381
1646382CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACCGTGATAAATCACATGATCACGCTGTTTGCTTACA1646446
1646447CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACACGTTAGGATATTAATCGCATATATTGATGAGCAAA1646512
1646513CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTCAGGAATTGACCAATTGATAGCAGCACCTTTGCT1646577
1646578CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTACTTATAGTTGCCAAAGTCGTTCCATTGGTTCTT1646642
1646643CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACAATACCTTGTCAATTCCACTAATACCATTGTTGACT1646708
1646709CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTGTGCCCTATACATAACGTTCACTTAGTTTCAGT1646772
1646773CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACCAGTGAATGAATTGAATTGATCTGTATAAAAGCCGAG1646839
1646840CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTCGGCATATTCCAATCACTGCCCTTTCTATTGATC1646904
1646905CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACAAGTTTTTAGGATTTTTGTATGAAAATTCTGACATTG1646971
1646972CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC1647001
Left flanking sequence : Till position 1644308 (length bp)
TTTAATTGGTAGGATTTTAGTAGGATGTTTGATTGTAGTTTCCTTCCCGTAAATTAAATATAAATCTTTA
TGTTTTATATTTAATTGACTTTAATCACAC
Right flanking sequence : From position 1647001 (length bp)
AGTTGCAACTACCAGTCCTACTGTATCAATAGATTCAACGGCCCTATCTGTCGACCTAACCAAAAACGCA
TCCAAAAATCACTAAAATCATTAGACAAAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp