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CRISPRs details
NZ_CP011386_4
Flanking alignement tool
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NZ_CP011386_4                                                                                                                 
top
Strain :
Lactobacillus helveticus GCF_001006025
RefSeq :
NZ_CP011386 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP011386_4
DR consensus (30 bp) :
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
Number of repetitions :
41
Begin Position :
1644308
End Position :
1647001
1644308
AATTATTTTCCTCCTAAGTTAGATAAAATC
AGCATATTTAGTAAAGTTGGTGTAAAATTCGGCTTT
1644373
1644374
ATTTACATTTCCCTTAGATTAAATAAAGAC
CTACCAACTACTAAAACTTTTAGATTAAACTTTCAAAA
1644441
1644442
ATTCACATTTCTCTTAAATTAAATAAAAAC
TCACTCAAAAAGAGGTACTATAGATCATTCAAGTTT
1644507
1644508
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CAATGGGTTCAAGCATTCCGTTACCACCTGAATTA
1644572
1644573
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GGTGTGGTTTTCTCATGAATGTATGTAAAAATTTGT
1644638
1644639
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
AACGGCATAAACCATTGAGTCGACATTGTCATCGTG
1644704
1644705
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
AAGCTCCATTAATGCTGACTTAATCCCCCATGCAGT
1644770
1644771
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
AAAGTCCAACGACCAAAAGAAAGGATATAGATAGA
1644835
1644836
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CGTCCTTATCATCACCTTGAGTCAAGCTTAAATCACT
1644902
1644903
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TAAAGCAAAGCAAAATAAGTTTTACCACTCAAAGCAA
1644969
1644970
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GATGATCTAAATAAACATACTTATACTGCTAAGCA
1645034
1645035
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TGATTGATCACCATTTCCTGCATTGTTGAATTTAA
1645099
1645100
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
ACTTCTTTTTACCGTTTTTAAGATTATATGACTTATTACCGTTTTTAAGATTATATGACTTAA
1645192
1645193
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TGATTAGATTGTAAGGAATTGTAGTCAGCTACTAAT
1645258
1645259
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TCAAAACCGTTCACAGCGCCGGATAGGTACTAAGAG
1645324
1645325
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GCAGCTAAATCAGCATAAGTCTGCTTTAGTTCATC
1645389
1645390
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CTTGCTACACACGGCATGAAAGTAGGTGCTTAGATA
1645455
1645456
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
ATCTAGTTCAGTTGATTGGGCTACACGTCAGATAGC
1645521
1645522
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GAGTTTGCCTTGTTGTGTTCGCTAGCAGATAGGTTAA
1645588
1645589
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CTTTTTCCGTGTGCCCTTTACCTTGCACATATAGCA
1645654
1645655
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GATGATCTAAATAAACATACTTATACTGCTAAGCA
1645719
1645720
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
AGCAAGCTCTTTGTAGTTTTCTACTTTTTTTGAAA
1645784
1645785
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CTTTTTCCGTGTGCCCTTTACCTTGCACATATAGCA
1645850
1645851
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TCAATTCAAGATACTTTTCAACTAGCTTTTCATCTT
1645916
1645917
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TAAGCGAGAAATGGCTTAAAAATCACAACTTATATTA
1645983
1645984
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TTTAAGTGAGTTAAGTTATTGAGTGAGTGAGTTGTG
1646049
1646050
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GCTTAAAATTGTAAATTAGCGTATATAAGCGTTATAT
1646116
1646117
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TTGTATGGAGTTATGTGGTTATTCTGCTGTTGTTCGA
1646183
1646184
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CTGAGCTTTGCGCCCTTAACATTTCGGGCAATATC
1646248
1646249
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GCAGATATTGATTATGAGATGATCGAAGGCTTAGCA
1646314
1646315
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
GAAACATAAAAGCAATGCGTTTCTCAAACTCAAACTT
1646381
1646382
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CGTGATAAATCACATGATCACGCTGTTTGCTTACA
1646446
1646447
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
ACGTTAGGATATTAATCGCATATATTGATGAGCAAA
1646512
1646513
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TCAGGAATTGACCAATTGATAGCAGCACCTTTGCT
1646577
1646578
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TACTTATAGTTGCCAAAGTCGTTCCATTGGTTCTT
1646642
1646643
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
AATACCTTGTCAATTCCACTAATACCATTGTTGACT
1646708
1646709
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TGTGCCCTATACATAACGTTCACTTAGTTTCAGT
1646772
1646773
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
CAGTGAATGAATTGAATTGATCTGTATAAAAGCCGAG
1646839
1646840
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
TCGGCATATTCCAATCACTGCCCTTTCTATTGATC
1646904
1646905
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
AAGTTTTTAGGATTTTTGTATGAAAATTCTGACATTG
1646971
1646972
CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
1647001
Left flanking sequence : Till position 1644308 (length
bp)
TTTAATTGGTAGGATTTTAGTAGGATGTTTGATTGTAGTTTCCTTCCCGTAAATTAAATATAAATCTTTA
TGTTTTATATTTAATTGACTTTAATCACAC
Right flanking sequence : From position 1647001 (length
bp)
AGTTGCAACTACCAGTCCTACTGTATCAATAGATTCAACGGCCCTATCTGTCGACCTAACCAAAAACGCA
TCCAAAAATCACTAAAATCATTAGACAAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp