Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP011403_1                                                                                                                 top


Strain : Lactobacillus salivarius str. Ren GCF_001011095 RefSeq :NZ_CP011403 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP011403_1
DR consensus (36 bp) : GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACCNumber of repetitions :12
Begin Position : 124138 End Position : 124948

124138GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACCTAGAAGAAGTGAAAAACAATCTTACTAATT124203
124204GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACCTGACGAAGCTCCTAATGACTACAAAGTTTT124269
124270GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACCTTCAGGGACAGTATACGGACAAGGGTATCA124335
124336GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACCAGCCCCAGGTTCCTAATAATCCAACAACAC124401
124402GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACCTTCAGGGACAGTATACGGACAAGGGTATCA124467
124468GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACCAGCAACTTTGACTAAACAAGTTATGCAATT124533
124534GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACCTGACGAAGCTCCTAATGACTACAAAGTTTT124599
124600GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACCTTCAGGGACAGTATACGGACAAGGGTATCA124665
124666GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATTAGGTTAAGACCAGCAACTTTGACTAAACAAGTTATGCAATT124731
124732GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATTAGGTTAAGAACGGTTCTGAGCCTAGTTAGAATGAATAGGT124796
124797GTTTCAGAAGAATATTAAATTAATTAGATTAATATCTTGACTTTGTCTCCACAGTTATATATTCTAATTTCAGAATATATTAATTGACTATTTTAGAGTGGTTAGTTTAGGTATTA124912
124913GTTTCAGAAGAATGTTAAATTAATAGGGTCGAGGCC124948
Left flanking sequence : Till position 124138 (length bp)
AATGGTCAGAGATTCTTTGAAAACTGTGATAATTACTATATTGATGAGGATTATATTGATTGGTACTAAC
GAATAGTTAAATTTTGATTATAAAGTAACT
Right flanking sequence : From position 124948 (length bp)
TAAAATACAAAAAATATTTCATAATATTTATAAATCTATCAGAAATTTTCTGGTAGATTTTTTTAGTGTA
AAAATTTTTGAGTTTAAGATATATTATGGT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp