Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NZ_CP012375_22                                                                                                                 top


Strain : Microcystis aeruginosa NIES-2481 GCF_001704955 RefSeq :NZ_CP012375 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP012375_22
DR consensus (37 bp) : GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACNumber of repetitions :27
Begin Position : 3611590 End Position : 3613494

3611590GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAGAGCGTCTAGGAGGGCTGCTTATGGCGTAATC3611660
3611661GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACACTCGCTAAAGTCTTTGGGGGGAGATGTAGAAAT3611731
3611732GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATGGGTTAGTCTGTGGGGATAGTATAGAGAAAACTG3611804
3611805GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACACAGACTCAACCTTATCAGCAATCTCAACGGTATT3611876
3611877GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAGATCGATCTGATCGAGCGATCATCTTCTTTCTT3611948
3611949GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACATTTAGTGGAATTGGCTAATCAAGCTGGTGATG3612018
3612019GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTGCGCTTTTGATCTCAATAACTCAGGATTTAATAG3612090
3612091GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGAAACCGAAGATTAATTTTATCAGACTCAAACCT3612161
3612162GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTGCCGAAAGGCAAATTCGCAACTTTTGCGGATTT3612232
3612233GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAGCTTTCTTTCAGTACCCGGCTCACAAGCCTGA3612303
3612304GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTTATTTGATTCCGATAAGCTATTAGAGCAGTTACAA3612376
3612377GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTTCTTGTCTGAGGATACTAAATAATCTAGGTTTT3612448
3612449GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAACGGACGCGATCGGAACCGTACCGGGTGAGGGAAT3612521
3612522GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAAAGACAAGCTTTTGGGGACTTGGCAAAAAGCCAA3612594
3612595GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGACTTAAGGCCGTCATGGCAGACCGGGATGTAAAT3612666
3612667GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGCATTAGATGATTTACTGCAATCCCTTGAGGGATT3612738
3612739GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGCCGTCAAGGCTCAACCCTGCTAACTGGTAAACTC3612810
3612811GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACTAGATGGTTTTTTAGGGTGTCTAGAATACTGTTTAG3612883
3612884GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCTTCCTTGCTTTAAGCTTGGCAGCGTACTTGTCT3612955
3612956GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCTTAATAGCGAGTCACCCTTGTCGGGGTTAGTCATT3613028
3613029GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGGAAATTTCCCCACTGAGAAAGCAGTCCATTAGC3613099
3613100GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCGTTGACGGCTGCCGTCCGGGAACCGGCGATGAGA3613171
3613172GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAGTCTTCTGGCAATTAGGCCGCGCCCTAAAATTGT3613243
3613244GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACCCTCACTTTTATACGATTTTATTAATCAATGCCTA3613315
3613316GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACAAATTACGGTTTTTTCTGGATCGGCGCGAAGGTT3613386
3613387GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAACGAGATCACTTTTACTAATATCCTACTCCAAAAAA3613457
3613458GTTTCAATCCCTAATAGGGTTTAAGATTAATTGGAAC3613494
Left flanking sequence : Till position 3611590 (length bp)
AACAACTAAAGCTTATGCTTGTAGCTAAGTGAAATCATTGATTAAGAGACCTGTACTTTTCAATGACTTT
TTCAGCAAACCCTAATTACCAGCAATAGAA
Right flanking sequence : From position 3613494 (length bp)
CGCCCAGTGGTAAAAGCCATACGCTATGGGATTTTCAAGGTTCGTATGCGCCGCACCTGCAATAAACCAA
TCATACAGCAAGTGACCCAGTTCTTCAAGA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp