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CRISPRs details
NZ_CP012395_3
Flanking alignement tool
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NZ_CP012395_3                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium autoethanogenum DSM 10061 GCF_001484725
RefSeq :
NZ_CP012395 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP012395_3
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
Number of repetitions :
44
Begin Position :
1499926
End Position :
1502801
1499926
TGTTTCATACAACATTTGTTACGGTTCAAC
TATCATCACTTTGACGATAATTCAAAGTTATACCAATAAAGT
1499997
1499998
ATTTAAAAACATTTCATATTATGGTTCAAT
AATTCCTTTATAATGTATTATTTACAATTATTATTT
1500063
1500064
ATTTAATCACATCTCATGTTGAAGTTCAAC
TTATAGCTCCAGACGAGGAAAATGCCAGAGATTATTA
1500130
1500131
ATTTAAATACATCCCATGTTAAGGTTCAAT
TAAAAAATAGACCATATACTTCTTTAAAAGATTTTCA
1500197
1500198
ATTTAAATACATCCCATGTTAAGGTTCAAC
CAACTATAGAGCCACTTGGAAGGGTAATTAAGTT
1500261
1500262
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTGAAATACTTGATATGTATCCTAATGATGGAAGTTT
1500328
1500329
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTATAAATAGAAACTTCACAAAAGATCCTAAATCCAC
1500395
1500396
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTTAATTTTCGCCAATTCTACATTACTATATTTCA
1500460
1500461
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTTATTGTTTACTTTATCAGTATTTGCATTGACTT
1500525
1500526
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TATGGAAGAAATAAGACTTTTAACAGCAAATGAAAT
1500591
1500592
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
CGTCACAAAAGAAGAAATAGAAAAAATTGTAGATGAA
1500658
1500659
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
GCAGATACAAAGAAGAAGGATTCCCTTGGGCAAGAA
1500724
1500725
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
AAAATCAAATAAACCTATTGAATGGATAATCTCCCAG
1500791
1500792
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
ATCATTATTGAAAGCTCTTATCCTTTATTCGATTTA
1500857
1500858
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
ATGCCGTGCAATCAGACTGGATGGTCTACTATTTA
1500922
1500923
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
AAACATTTCTTAGATGCTATATCTGGTTATGTAAG
1500987
1500988
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTTTAGGTACTGGTATTATTTTTGCTCCATATTATTG
1501054
1501055
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
AGTCTAGGCTTCAGCAATTTTAAGAAGGTAAAAAAA
1501120
1501121
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
GGAGGCAGTAAATGATCTTGGACATACGCCTGTAAG
1501186
1501187
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TAGGACAAGGTAGAGATATGGATTTTTCTGCTTACAAA
1501254
1501255
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TGAAAAAGAAGGAGATAACCCAACTCAAAATAGTAAG
1501321
1501322
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTAATATCTCATCTATCATATTATACTTCCTTTCCA
1501387
1501388
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTAAATAATTAGTATAAAAATGGAGGAATGTATAAA
1501453
1501454
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TATTGGCCAAACTTTAAATATACATCTGCAATGTC
1501518
1501519
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
CTCTATAGCAGTTCAATTTCATCCTGATCTAATCCC
1501584
1501585
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TAGACCACAATTAAATGCAATGTTAGAATTTGCTCG
1501650
1501651
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTTTAAAGATAGTATAACTAAGCAACAAAATGATTA
1501716
1501717
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
CGATAAAAGACACACTCAAAACTGTATGGGATGCTA
1501782
1501783
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTTGGCTTACTACTTATAGCAGTTCCAACAGTTATTAC
1501850
1501851
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
AAAGCTTCGGCATATAAAAGTTGGAGCTTTATACTG
1501916
1501917
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTAAGCAGTTTAAGCCATTGTATCGAGTAGACTG
1501980
1501981
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
GTTGGTGGAGAAAAGGAACCTCTATTACTAGAAAA
1502045
1502046
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TGATAACTTAATAAAAAATATAGAGTTAAAAAAAGG
1502111
1502112
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
GGTGCTAAAGATACTGGATTAGGAATAATTACATCA
1502177
1502178
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
GCCCACTATTTTGTGTATAATTTATTACTCCAAACA
1502243
1502244
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TACATTCTCTACTACAGAATAATCGAATTTTACCTG
1502309
1502310
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
ATAATGGATAAGATAATATTATATTAGTCATTTTTT
1502375
1502376
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
ATTGGTTAGGCTCAAAATTCCTAGCGTTTTGTCCTT
1502441
1502442
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
TTTGCACAACTTCGTTAAAACATAATTTAGCGAAGT
1502507
1502508
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
AAATGAAAACATATGTTTTACACCTTATCAAGTTGG
1502573
1502574
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
AATAATAGCAGTAATTTTATTAATTACAGGCATATA
1502639
1502640
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
ATGTATAAATAAAGAAACAAACCAAATTGTAGAATA
1502705
1502706
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
GCAGCTCCAGGAGCAAAAACCAAAGGTACTATTCGC
1502771
1502772
ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
1502801
Left flanking sequence : Till position 1499926 (length
bp)
GTTTACATTTATATTATTGTACTTAAATCAAATTTATATTCATAGTAAAACCAATAAAGTTGAAGTATTG
AGAAATATTTAGAATTAATTTAAACAAATC
Right flanking sequence : From position 1502801 (length
bp)
CACAGTAAAATAGCCATTCTTTATTTTCATTATAACCCTAAAACCCTTAACAATAAAGGCATTCGCTGAA
AATTTTCCAACCGTTTTTCACTTTTCATAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp