Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NZ_CP012395_3                                                                                                                 top


Strain : Clostridium autoethanogenum DSM 10061 GCF_001484725 RefSeq :NZ_CP012395 (chromosome circular)
CRISPR id : NZ_CP012395_3
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACNumber of repetitions :44
Begin Position : 1499926 End Position : 1502801

1499926TGTTTCATACAACATTTGTTACGGTTCAACTATCATCACTTTGACGATAATTCAAAGTTATACCAATAAAGT1499997
1499998ATTTAAAAACATTTCATATTATGGTTCAATAATTCCTTTATAATGTATTATTTACAATTATTATTT1500063
1500064ATTTAATCACATCTCATGTTGAAGTTCAACTTATAGCTCCAGACGAGGAAAATGCCAGAGATTATTA1500130
1500131ATTTAAATACATCCCATGTTAAGGTTCAATTAAAAAATAGACCATATACTTCTTTAAAAGATTTTCA1500197
1500198ATTTAAATACATCCCATGTTAAGGTTCAACCAACTATAGAGCCACTTGGAAGGGTAATTAAGTT1500261
1500262ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTGAAATACTTGATATGTATCCTAATGATGGAAGTTT1500328
1500329ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTATAAATAGAAACTTCACAAAAGATCCTAAATCCAC1500395
1500396ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTTAATTTTCGCCAATTCTACATTACTATATTTCA1500460
1500461ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTTATTGTTTACTTTATCAGTATTTGCATTGACTT1500525
1500526ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTATGGAAGAAATAAGACTTTTAACAGCAAATGAAAT1500591
1500592ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACCGTCACAAAAGAAGAAATAGAAAAAATTGTAGATGAA1500658
1500659ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGCAGATACAAAGAAGAAGGATTCCCTTGGGCAAGAA1500724
1500725ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAAAATCAAATAAACCTATTGAATGGATAATCTCCCAG1500791
1500792ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACATCATTATTGAAAGCTCTTATCCTTTATTCGATTTA1500857
1500858ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACATGCCGTGCAATCAGACTGGATGGTCTACTATTTA1500922
1500923ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAAACATTTCTTAGATGCTATATCTGGTTATGTAAG1500987
1500988ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTTTAGGTACTGGTATTATTTTTGCTCCATATTATTG1501054
1501055ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAGTCTAGGCTTCAGCAATTTTAAGAAGGTAAAAAAA1501120
1501121ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGGAGGCAGTAAATGATCTTGGACATACGCCTGTAAG1501186
1501187ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTAGGACAAGGTAGAGATATGGATTTTTCTGCTTACAAA1501254
1501255ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTGAAAAAGAAGGAGATAACCCAACTCAAAATAGTAAG1501321
1501322ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTAATATCTCATCTATCATATTATACTTCCTTTCCA1501387
1501388ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTAAATAATTAGTATAAAAATGGAGGAATGTATAAA1501453
1501454ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTATTGGCCAAACTTTAAATATACATCTGCAATGTC1501518
1501519ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACCTCTATAGCAGTTCAATTTCATCCTGATCTAATCCC1501584
1501585ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTAGACCACAATTAAATGCAATGTTAGAATTTGCTCG1501650
1501651ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTTTAAAGATAGTATAACTAAGCAACAAAATGATTA1501716
1501717ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACCGATAAAAGACACACTCAAAACTGTATGGGATGCTA1501782
1501783ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTTGGCTTACTACTTATAGCAGTTCCAACAGTTATTAC1501850
1501851ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAAAGCTTCGGCATATAAAAGTTGGAGCTTTATACTG1501916
1501917ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTAAGCAGTTTAAGCCATTGTATCGAGTAGACTG1501980
1501981ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGTTGGTGGAGAAAAGGAACCTCTATTACTAGAAAA1502045
1502046ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTGATAACTTAATAAAAAATATAGAGTTAAAAAAAGG1502111
1502112ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGGTGCTAAAGATACTGGATTAGGAATAATTACATCA1502177
1502178ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGCCCACTATTTTGTGTATAATTTATTACTCCAAACA1502243
1502244ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTACATTCTCTACTACAGAATAATCGAATTTTACCTG1502309
1502310ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACATAATGGATAAGATAATATTATATTAGTCATTTTTT1502375
1502376ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACATTGGTTAGGCTCAAAATTCCTAGCGTTTTGTCCTT1502441
1502442ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTTGCACAACTTCGTTAAAACATAATTTAGCGAAGT1502507
1502508ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAAATGAAAACATATGTTTTACACCTTATCAAGTTGG1502573
1502574ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAATAATAGCAGTAATTTTATTAATTACAGGCATATA1502639
1502640ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACATGTATAAATAAAGAAACAAACCAAATTGTAGAATA1502705
1502706ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGCAGCTCCAGGAGCAAAAACCAAAGGTACTATTCGC1502771
1502772ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC1502801
Left flanking sequence : Till position 1499926 (length bp)
GTTTACATTTATATTATTGTACTTAAATCAAATTTATATTCATAGTAAAACCAATAAAGTTGAAGTATTG
AGAAATATTTAGAATTAATTTAAACAAATC
Right flanking sequence : From position 1502801 (length bp)
CACAGTAAAATAGCCATTCTTTATTTTCATTATAACCCTAAAACCCTTAACAATAAAGGCATTCGCTGAA
AATTTTCCAACCGTTTTTCACTTTTCATAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp