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CRISPRs details
NZ_CP012395_4
Flanking alignement tool
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NZ_CP012395_4                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium autoethanogenum DSM 10061 GCF_001484725
RefSeq :
NZ_CP012395 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP012395_4
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
Number of repetitions :
34
Begin Position :
1504570
End Position :
1506776
1504570
AATTAGATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC
AGTAGCTAATGATCAAATATTAACATTCCAATTACT
1504635
1504636
ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
AGGTGGTTATTTTCAAAATAGTTATCAAGCCACACCG
1504702
1504703
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TATATCAACTCTCCCCACTTTTGGGGAACGTACTCT
1504768
1504769
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GATGATTATAAAGTATGTTTGCTAACAGCTATAGCGT
1504835
1504836
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
ATTTGTACTTGGCTCTGCTATCTTGAATATTAATTTA
1504902
1504903
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TAATTATATATATTCTGATTGGGTTTATATAAATTC
1504968
1504969
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
AAGAGTTGATACTTTACTTATAGATTACTTAGGTGC
1505034
1505035
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GGGCATTAAATATAAAAAGAAATATATTCCATGAAT
1505100
1505101
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TCTATTACCTTAAGAAAATTAAGTCCACTAGCATTA
1505166
1505167
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
CTATCCCAGCAATTAATATCTCTATTAATATCTCTCA
1505233
1505234
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
ATTGCTCACCCATTTTAAATAGTAATTCCCAAAAA
1505298
1505299
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GTGGTTACTTGGGATACACCAAGGCGGCTAACAAA
1505363
1505364
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GGAAATATATCTTCTCCTAGATCTCTGTACTTATTT
1505429
1505430
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
ATATTAGGCTGTTTAAAAGATACCTTACAGTTAAAT
1505495
1505496
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GCTGCAGAAAGAAAAAAGTGAGATGGAAGAAAAAAA
1505561
1505562
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TATATACGTAAATAATTTAAGTGGAACAACAACATC
1505627
1505628
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
CAACAACTTTCTCATGCAGGGGCCATATCAAAAGA
1505692
1505693
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
AAAAGAAAATGAAAATAAAGTTCCAAGTGCAACCAT
1505758
1505759
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
CTTCCACGCACTATGTAACACATTTTTGCTTTAGAG
1505824
1505825
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
CATAACCATAGATCAGTGCAATAAATTGTTTTTTAC
1505890
1505891
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TTGCCTTATTAGCGAATACAATAGAATTAGAAATTA
1505956
1505957
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
ATGGCTTTTGTTGCTGCTATGTGTGCAGGAGGTAC
1506021
1506022
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TTGAGAAGGAGTATAAAATTGCTAATAAGCAGATGA
1506087
1506088
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GTATAGATACTACATGCATTAAGCATATAGATGTATT
1506154
1506155
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TTTGACAGCAACAAGAGAAAGAATTTCACATATATT
1506220
1506221
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
AAATACATTTTATAAATTATTAAAAGAATATGAGG
1506285
1506286
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GAAGCTATAGAAGAATTAAAGGATCTATAAGAGAAA
1506351
1506352
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GAGGTATTTAAATTGTTAAAAGGTATAGATATATA
1506416
1506417
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
ATCAACTCCTAAAATATTCATAAATTTTATACCTCC
1506482
1506483
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
AAGGCGGATCCACAAATATTAAATCAGCCTCTTTCA
1506548
1506549
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TATTTGTTATTGGAGTGTATGTAGCAACAAAGACAA
1506614
1506615
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
GTATGATAGTGTGACAGGTGCTATTATATTAGACAC
1506680
1506681
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
TAACGGAAAAGGATGGGAGCACGTAAGTATAACACA
1506746
1506747
ATTTAAATACATCTTATGTTGAGGTTCAAC
1506776
Left flanking sequence : Till position 1504570 (length
bp)
TAAATTCAGAGAAAAACCTTAGTAATTTCAATAGTTTTAAGACTATAGACTTTCATCAATCTCACGTTAT
AATAGAGTCTACTATATTCCTAATTTTTCA
Right flanking sequence : From position 1506776 (length
bp)
CACAGTAAAATAGCCATTTCTTATTTTCATTATAGTCCTAAAACCCTTAATAATAAAGGCATCAACAGAA
AATTTTCCAACCGTTTTTCACTTTTCACAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp