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CRISPRs details
NZ_CP012410_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NZ_CP012410_1                                                                                                                 
top
Strain :
Leptotrichia sp. oral taxon 212 GCF_001274535
RefSeq :
NZ_CP012410 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP012410_1
DR consensus (30 bp) :
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
Number of repetitions :
44
Begin Position :
583605
End Position :
586465
583605
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
AATAGCTCCATAAATTTTAAATATTTAAACAATTTC
583670
583671
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
AAAAAAAATACAATGGCTGTTTCTCTTTCATTATCA
583736
583737
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TAAGGAAATACAGGCTGTATCTTGAAACAGAAAATA
583802
583803
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
GATAAAAAATATAAGAGAATATGAAGGATTATCAT
583867
583868
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TTTCTTTTCAATGAATTCAAATTCATCTGTTATGAC
583933
583934
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
GTGGGAGTTTATTTAATGAACAGATAAAAAAGCAGG
583999
584000
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
CCGAGTATTACAATATTTTTATTTTGCAGATCCGTT
584065
584066
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
AATAAATAATATATTCTTTTGCTTTCTTTTATATTT
584131
584132
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
GTTTTTGAGATTCAATATCTACTTCAGCTCTGTTAT
584197
584198
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TTATTTTTTTCACCTCCTTTCCTTTACACACATAGT
584263
584264
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
ATTTCAAATGAGCTGGACGACGAACTGAGAAAACAG
584329
584330
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
GTTTTTGAGATTCAATATCTACTTCAGCTCTGTTAT
584395
584396
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TTATTTTTTTCACCTCCTTTCCTTTACACACATAGT
584461
584462
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TAATCAAACATAATATTTATTAATGGTAACATTAA
584526
584527
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TAATACTTAAATCCGTCTTCCTCTTCAATTATTTTG
584592
584593
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
GAGGGCGAATTCTATGGGGTAGTTGTAGCGTTCTAT
584658
584659
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TTTGTTTCAGGATTAAAATGGAGTGAGAGCATTGA
584723
584724
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
ACTATAATAGATGATATGAATAAATCAAGTAAAAAT
584789
584790
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
CTCTTGCACCGTCACAAAATACCCTTGAAGGTCTG
584854
584855
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TATTTATTACTGCCCAGTTCTCTTTGATGTGATTAT
584920
584921
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
GAGGGCGAATTCTATGGGGTAGTTGTAGCGTTCTAT
584986
584987
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TCATTTAAAAATAAATCACTAATAACACAAGGAAAT
585052
585053
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TGTGCAGATGAAGAAACGTCAGACGCTCTCGAAAC
585117
585118
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
AAAAATACTTCTCCTGATATTGACCTAACACCTAAG
585183
585184
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TAAATAAAAAAATTAGTCAAATTTTATTGACTAATC
585249
585250
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TGCTGGAAATGTTGTAAAATTTGCAGATATCAACGG
585315
585316
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
GGAGGTCAACAGTTCTTAGCAGGACAGGAAATGCTC
585381
585382
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
CGAAAAAAGGGGGTAAAAATGGCAAAAAAGGAAAAG
585447
585448
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
ATTCATAATGATATGTGGATAATTGTCTATCGGA
585511
585512
TTTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TATTTTGCTTTCATTTCTTCGCTGTGAAAAAGAAATG
585578
585579
ATTTTAATAGTAGCAGAATGTAATGTAAAT
GAATTAAATGTAAATGAAGAAAAAGATATAAAATTT
585644
585645
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
CTTCTAAGGAAAAATCACTTCTTAATAATTTTACAGG
585711
585712
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
AGGTGCAAGAAAAGAAATGTTGGAACAATAGTTGA
585776
585777
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
CCCCCTAAGGGGGGGCGACTTAATTATATCTTTTT
585841
585842
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TAAATATCAGAGTATATCAAAGACTGGATGTAATCA
585907
585908
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TGTGTTTCTGTATTGAAATATGTTGAGCATATTCTG
585973
585974
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
CTTATCTTGACACTATTATATCTCATTATTTTCTAA
586039
586040
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TTAATGGCTCTTATTTTTTAAACTTCATTTGATATT
586105
586106
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
GCAAATAAGGAAACGGCAAGAGGTAAAATGTTTGCA
586171
586172
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TGGGGATTTTAGCCCTAAAGAATTTGATTTCTTAC
586236
586237
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
GCTCTTATAGCTGCACTTCCGACTGGTTCTCTATAA
586302
586303
ATTTTAATAGTAGCAGAGTGTAATGTAAAT
TTAAGAATAAAATTGGAAATGTCGCCCATACTTAGA
586368
586369
GTTTTAATAGTAGCAGAATGTAATGTAAAT
GAAAGTGTTAATGACAGGTTTACTAATGATTATGAA
586434
586435
GTTTTAATAGTAGTAAATTGTAATATAAAT
586464
Left flanking sequence : Till position 583605 (length
bp)
TAAGAAAAATTTAAATGATATCTATTAAAAAAAACGGAAAATATAGTTCGACAGAAAGATAAAAAAATGA
TATCATATTTATTAAATAAAACAAAACAGC
Right flanking sequence : From position 586465 (length
bp)
TTTTACAAAATGCCCTGTTAATTAAAAGTGTAAGATATTTTAATTATAGAATTATATTAAAATTAATAAT
ATTATTAGAAATCTAAAATGAAGTAACTTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp