CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NZ_CP013011_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NZ_CP013011_2                                                                                                                 
top
Strain :
Pyrodictium delaneyi Su06 GCF_001412615
RefSeq :
NZ_CP013011 (chromosome circular)
CRISPR id :
NZ_CP013011_2
DR consensus (25 bp) :
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
Number of repetitions :
52
Begin Position :
307847
End Position :
311362
307847
TTAGTAATTCTCCGTTGAGTCAAGC
TTTCGTCGTTGTTGAGACTACATCTGGCACGGCAGCATTGC
307912
307913
ATTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
TTGACGCGTATGTTGGTGAACTCCACCTCGCGGCACGAGAACCACG
307983
307984
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
ATGCCGATGGTGCGTACGGCACGCTGAGCGCATGCTACGTGACAC
308053
308054
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CGGTACTTTGCGAATATCCTGCCGGCTATTAGCGCGGCGCGT
308120
308121
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
TCCCGGGCCTGAAACCGTGGCCGGGCGCCCTGCCTGTGCTGAG
308188
308189
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
GTGCCCCTGTTCTAGCGTCTAGCCCACACATTTCTTCGG
308252
308253
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
ATACTTGGCTACGGCTGTTAGGTCTAGACTCTGTGCCCGCTCTGTTA
308324
308325
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
ATACGTCGATGAGATAGAGATACCCGGCGGCACGTCAACATCGAC
308394
308395
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
ACCCCGGGGGCATTGTTTGCAGCGAGAAATCCAGAAACTCTATAGAG
308466
308467
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CAACGAGCAGACTGGCACCCTCAGCGCAGTGGCTTTCATAGTCTACAT
308539
308540
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CTCCGCCAGCCGCCCCGAGGCAGCGAGGTATGTTAGCG
308602
308603
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
ACAGACCAAAGACAAGTACCAGTACAACGTAGACCCCATGAC
308669
308670
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CGAAGTATATCCACTTCATAGACACGGAGACCGGAGAGAAATTCA
308739
308740
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
GTGAGCAGGGAGCTCAGCGTCACGGGAGCACACTATCTCGACACA
308809
308810
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
ACTGCATAGAGGCGTGCGACAAGGACTGTGCAGAAGAACACA
308876
308877
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CCGCATAAGGAACGTGGCTCCCTATGCTGCGAAGGCTGCTAGG
308944
308945
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CAGTATTTTACTTGGCTTAAAGAAGCATTAGAAGAGAGAAAGA
309012
309013
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
TTGTTATCTTTAGGTGTATGTTGTGGCCGGGCTCTAGGACCATGC
309082
309083
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
TGGTGCAGGCCGTGGCTGCTAGCTTGTTGCTGGCTTGTTCTTTAG
309152
309153
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
TAGAGAAGGCTGTATCAGACATAGCCCGCTTCTGCGCCGCCAC
309220
309221
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
AGCATAGATCTTGGCGTCGTGTAGTGGCGCCGCGAGCTTCAA
309287
309288
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
ATATACATCATCGACACGGCTAAGCCCCCGCTACAACGAGA
309353
309354
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
AAGAAGATGGTCTACTACCTCGGTAGGCGCTACGGGGTGTGTCAGT
309424
309425
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CATTTCTTAGAGACGCACAAGTTTGCAATAGCGAAGTAAC
309489
309490
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
AGAAACAAGACAGTGTGCTGGAAGTACGTGGATTGCAATGGAGTCAT
309561
309562
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
ACCACACATTGCCTCCTCTGGCATTTATTTCTAGCAGGGTGC
309628
309629
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CGCTATCGTGATGCCGCCGTCCATGGCCTTCCTGGCTATTATCCG
309698
309699
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CTCGCGCGCGCCATGGGCTTCGCGCTGGCCGGCGGCACGCTGCTAG
309769
309770
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CAGCCGAGCAGGCCCAGGTCATGCAGGCAGTCAGGCGGGCGCAGA
309839
309840
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CCGCCCATGAAGCCCACGCCGGCCATCGGCGCCAGGCTGGGCGGGAA
309911
309912
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CTCGCGGTAGGCTCGTATGCCCCAGCGGGCGATGAAGTAGCCGA
309980
309981
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
ACATGAGAGTACTGCCAAGCTTGTCAGCGAGTTGTTAGGAATCG
310049
310050
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
AACCGAAATGCTTACAGTTGCATGGATAGTCCCGGCATCCGTTAT
310119
310120
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
TTGTGGCCCCTTTGCAGCATCCATACCAGCAGCTCCTCAA
310184
310185
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
ATATCCCTTTGGAGGATTAACTCCGGCAGAAATAGGATAGGAAAAA
310255
310256
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
GGCTCCGGGATGTCTGGGCTAAGGCTGCTGAGCGGTTGG
310319
310320
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
ATGCTGAATTCGGATAGATTCAGCACTCATGACTTGTGCAGAATCT
310390
310391
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
ATAGTCGGGGCAGCTAACCAAACCATTCTCACCTCACTTTAAA
310458
310459
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
AGGTGTATGTCCCCGGTGGCACTAGCACATCGACCGGTAACACA
310527
310528
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CGCATCGGTCTCCGCCGGAATAGCGGCGGACGCGGTAATGCTAT
310596
310597
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CGGTATCATGTGTCTCATCGAACCATACACGTACGGTGCCAC
310663
310664
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
AAGAACCCCAACCTGCTGGCCTTCATCCCGAGCGCTGCCCCGA
310731
310732
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
GGGCCTTCACCCAGGGGGTTCCCCGGCCCGGCTACTCCC
310795
310796
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
GCAGAGTCACTCATTGAGAGCGCTACTGCTGGCGAGGAGA
310860
310861
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CGGTGGATGCTAGCCCGCTGGTCTGCTATCTCTCGGATGAAGAT
310929
310930
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CATGGCTCCCACTCCCGCTGCGCCGTCTGAGCGTGTTTA
310993
310994
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
ACACCGATTAGATGCTTGCAGAAGAAGCACTTAGCCAG
311056
311057
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CTTTATGCTGTCGAGCTCTATCGCCTCATCCGCTACCGTGTTGCTG
311127
311128
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
AGGAATGCAGCCATGAGCACTCGGCCCGGGGGACCTTGCACTCC
311196
311197
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
CAAAACCACCACCTCCATAAACCTTGCATACGCTCTGGCGAGACGA
311267
311268
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
TTCTCTCGGTAGAGTCACCTGGTCTACTTCTGCTTCTAGGGTCCT
311337
311338
CTTACAATTCTCTTTTGAGTTATGC
311362
Left flanking sequence : Till position 307847 (length
bp)
CTGTATCCCTGCCGGCCACTTATAGACGTTTAATTCCAGACATAATAATATCTCTGTTTACATTATTAAT
CACAAGTCTAGACTCCCTAAGCTTGTAATC
Right flanking sequence : From position 311362 (length
bp)
TTTGTGTGGAATGTATGGTTCCCTGTTGGGTCTAGTGGTGTAGGATTCTATAGTTCCTGTATTTATTTGT
TTCTCCTCCTTGGGAACAGCCCCGATCCCT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp